262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4029 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  100 
 
 
316 aa  611  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  61.09 
 
 
321 aa  344  1e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  67.11 
 
 
303 aa  344  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  61.07 
 
 
427 aa  328  8e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  54.61 
 
 
300 aa  319  3e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  54.02 
 
 
326 aa  300  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  48.66 
 
 
299 aa  273  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  49.63 
 
 
360 aa  265  5e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  47.93 
 
 
306 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  48.53 
 
 
291 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  50.36 
 
 
321 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  51.09 
 
 
329 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  51.09 
 
 
329 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  49.65 
 
 
324 aa  236  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  43.39 
 
 
312 aa  231  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  48.23 
 
 
329 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  38.85 
 
 
317 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  41.67 
 
 
347 aa  218  8.999999999999998e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  40.57 
 
 
307 aa  209  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  38.13 
 
 
321 aa  205  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  39.51 
 
 
299 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  37.71 
 
 
298 aa  202  6e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  39.13 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  38.66 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  35.56 
 
 
424 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  36.51 
 
 
322 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  38.46 
 
 
305 aa  191  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  38.95 
 
 
324 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  40.15 
 
 
436 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  38.23 
 
 
443 aa  185  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  39.42 
 
 
341 aa  185  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  38.83 
 
 
310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  40.66 
 
 
411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  38.71 
 
 
311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  38.83 
 
 
310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  39.19 
 
 
325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  38.04 
 
 
324 aa  182  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  38.97 
 
 
308 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  38.97 
 
 
314 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  38.97 
 
 
314 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  38.08 
 
 
304 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  38.6 
 
 
311 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  38.83 
 
 
337 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  37.81 
 
 
370 aa  179  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  38.97 
 
 
307 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  38.97 
 
 
304 aa  178  9e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  38.97 
 
 
307 aa  178  9e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  38.97 
 
 
307 aa  178  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  38.97 
 
 
307 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  36.72 
 
 
393 aa  177  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  36.81 
 
 
323 aa  176  7e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  37.71 
 
 
301 aa  174  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  36.1 
 
 
299 aa  170  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  41.88 
 
 
306 aa  160  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  37.87 
 
 
305 aa  152  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  38.87 
 
 
305 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  35.61 
 
 
320 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  27.85 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  27.85 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  34.23 
 
 
321 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  34.62 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  34.62 
 
 
292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  33.84 
 
 
294 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  31.82 
 
 
314 aa  124  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  33.45 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  26.46 
 
 
306 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  33.33 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  37.02 
 
 
305 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  28.52 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  37.02 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  30.1 
 
 
331 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  28.57 
 
 
368 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  22.81 
 
 
306 aa  92.4  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  24.29 
 
 
307 aa  91.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  24.06 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  26.67 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  24.45 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  26.44 
 
 
411 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  26.44 
 
 
411 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  23.31 
 
 
538 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  24.54 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  24.54 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  24.54 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  24.54 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  22.22 
 
 
525 aa  67  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  25.09 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  22.53 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  26.55 
 
 
443 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  26.55 
 
 
443 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  25.45 
 
 
442 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  26.91 
 
 
443 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  22.22 
 
 
525 aa  66.2  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  26.69 
 
 
339 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  25.75 
 
 
442 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  23.3 
 
 
337 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  25.69 
 
 
292 aa  65.1  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  24.91 
 
 
363 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  25.75 
 
 
442 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  24.63 
 
 
337 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  27.68 
 
 
402 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>