169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2561 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  100 
 
 
276 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  41.03 
 
 
320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  33.09 
 
 
306 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  32.01 
 
 
291 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  32.96 
 
 
360 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  32.43 
 
 
322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  29.71 
 
 
299 aa  129  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  27.74 
 
 
317 aa  123  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  30.8 
 
 
321 aa  122  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  30 
 
 
347 aa  122  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  30.48 
 
 
307 aa  122  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  28.46 
 
 
311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  31.23 
 
 
305 aa  119  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  29 
 
 
424 aa  118  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  25.55 
 
 
321 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  28.2 
 
 
324 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  28.52 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  31.37 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  27.88 
 
 
427 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  27.44 
 
 
304 aa  112  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  28.47 
 
 
299 aa  112  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  28.73 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  27.24 
 
 
323 aa  110  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  29.54 
 
 
321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  29.39 
 
 
301 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  25 
 
 
300 aa  106  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  26.52 
 
 
312 aa  105  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  29.3 
 
 
326 aa  105  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  25.17 
 
 
329 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  25.17 
 
 
329 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  25.64 
 
 
324 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  27.34 
 
 
329 aa  99  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  28.15 
 
 
303 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  27.41 
 
 
334 aa  94.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  25.93 
 
 
320 aa  91.3  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  26.86 
 
 
298 aa  90.1  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  26.64 
 
 
306 aa  88.6  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  26.72 
 
 
314 aa  87.4  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  25.28 
 
 
306 aa  87  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  28.11 
 
 
292 aa  86.7  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  28.11 
 
 
292 aa  86.7  4e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  26.84 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  27.07 
 
 
393 aa  82  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  23.42 
 
 
324 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  24.43 
 
 
443 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  25.17 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  25.89 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  28.62 
 
 
368 aa  75.5  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  28.67 
 
 
289 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  28.57 
 
 
289 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  27.46 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  27.46 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1463  serum resistance locus BrkB-like protein  25.09 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01651  serum resistance locus BrkB-like protein  25.09 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.596268  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  24.7 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  28.32 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  28.32 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  28.32 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  28.32 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  28.32 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  28.26 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  22.35 
 
 
436 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  28.32 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  24.34 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  22.93 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  26.59 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  26.59 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  24.1 
 
 
311 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  26.3 
 
 
305 aa  68.9  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  26.3 
 
 
305 aa  68.9  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  21.97 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1252  ribonuclease BN  25.42 
 
 
324 aa  67  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  22.76 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  22.76 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  23.36 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  23.36 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  22.76 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  22.76 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  22.76 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  23.7 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  22.01 
 
 
337 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  22.99 
 
 
311 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  21.66 
 
 
321 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  22.99 
 
 
310 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  22.99 
 
 
310 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  26.67 
 
 
307 aa  62.4  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  26.24 
 
 
316 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  37.21 
 
 
302 aa  58.9  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  22.3 
 
 
363 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01081  serum resistance locus BrkB-like protein  23.13 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  26.28 
 
 
276 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3200  ribonuclease BN  26.64 
 
 
258 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  24.74 
 
 
283 aa  56.2  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  24.15 
 
 
392 aa  55.8  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  24 
 
 
320 aa  55.8  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  23.08 
 
 
341 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0099  serum resistance locus BrkB-like protein  25.19 
 
 
306 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0625929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  25.26 
 
 
283 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01101  serum resistance locus BrkB-like protein  25.1 
 
 
304 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  23.83 
 
 
294 aa  55.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>