101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2672 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2672  ribonuclease BN  100 
 
 
266 aa  502  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.324554  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1078  ribonuclease BN  55.44 
 
 
297 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.332903 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  25.56 
 
 
277 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  24.23 
 
 
289 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  23.19 
 
 
317 aa  59.7  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  25.45 
 
 
374 aa  59.7  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  24.73 
 
 
306 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  23.36 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  23.36 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  23.36 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  23.36 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  23.36 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  23.36 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  22.91 
 
 
286 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  25.87 
 
 
363 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  24.54 
 
 
360 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  24.23 
 
 
289 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  27.97 
 
 
328 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  27.37 
 
 
304 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  23.36 
 
 
288 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  23.36 
 
 
288 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  28.2 
 
 
277 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  31.42 
 
 
499 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  26.64 
 
 
328 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  27.24 
 
 
313 aa  53.5  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  24.83 
 
 
368 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  24.09 
 
 
336 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  26.46 
 
 
310 aa  51.6  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  27.6 
 
 
300 aa  50.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  29.47 
 
 
346 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.42 
 
 
428 aa  50.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000260717  hitchhiker  0.000176219 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  26.71 
 
 
322 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  24.9 
 
 
340 aa  49.3  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2359  ribonuclease BN  27.42 
 
 
437 aa  49.3  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.389707  normal  0.121008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  25.18 
 
 
291 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  22.83 
 
 
320 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  23.05 
 
 
424 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0702  ribonuclease BN  23.96 
 
 
322 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  26.61 
 
 
347 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  28.32 
 
 
343 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  25.94 
 
 
323 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  25.94 
 
 
323 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  25.37 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  25.94 
 
 
323 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  26.47 
 
 
359 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  25.94 
 
 
323 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  28.35 
 
 
408 aa  47  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  30.08 
 
 
445 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3954  ribonuclease BN  24.91 
 
 
300 aa  46.6  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0979  putative ribonuclease BN  31.46 
 
 
282 aa  46.6  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  24.73 
 
 
321 aa  46.6  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2446  ribonuclease BN  27.98 
 
 
263 aa  46.6  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.805614  hitchhiker  0.00565169 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1346  ribonuclease BN  23.32 
 
 
268 aa  46.2  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1225  YihY family protein  23.32 
 
 
268 aa  46.2  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.308333  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0518  YihY family protein  23.77 
 
 
276 aa  45.8  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0775636  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  24.66 
 
 
303 aa  45.8  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  25.68 
 
 
321 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  24.71 
 
 
313 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  33.33 
 
 
350 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  33.33 
 
 
350 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  33.33 
 
 
350 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  31.86 
 
 
322 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  31.86 
 
 
322 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  24.54 
 
 
311 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  24.81 
 
 
295 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  24.09 
 
 
427 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  25.1 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  24.81 
 
 
337 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  24.81 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  28.68 
 
 
347 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  24.25 
 
 
316 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0716  ribonuclease BN/unknown domain fusion protein  26.45 
 
 
424 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603481  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  30.95 
 
 
402 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  23.66 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  21.61 
 
 
317 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1535  ribonuclease BN  34.31 
 
 
469 aa  44.3  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1514  ribonuclease BN  27.42 
 
 
472 aa  44.3  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.258349  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0964  ribonuclease BN  28.73 
 
 
285 aa  43.9  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  24.84 
 
 
334 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  25.1 
 
 
283 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  31.62 
 
 
401 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  27.61 
 
 
322 aa  43.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  24.44 
 
 
337 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  23.62 
 
 
310 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  24.05 
 
 
451 aa  43.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  24.55 
 
 
297 aa  42.7  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  23.62 
 
 
310 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  23.95 
 
 
321 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3484  ribonuclease BN  32.73 
 
 
378 aa  43.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  25.81 
 
 
328 aa  42.7  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  27.52 
 
 
301 aa  42.7  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  22.73 
 
 
392 aa  42.4  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  23.99 
 
 
299 aa  42.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  29.55 
 
 
326 aa  42.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  32.26 
 
 
339 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  30.83 
 
 
300 aa  42.4  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  32.26 
 
 
339 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  26.14 
 
 
538 aa  42.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  24.07 
 
 
307 aa  42.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  24.83 
 
 
319 aa  42.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>