35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1078 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1078  ribonuclease BN  100 
 
 
297 aa  555  1e-157  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.332903 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2672  ribonuclease BN  57.59 
 
 
266 aa  275  8e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.324554  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  30.08 
 
 
360 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  25.76 
 
 
300 aa  52  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0979  putative ribonuclease BN  31.21 
 
 
282 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0702  ribonuclease BN  24.71 
 
 
322 aa  50.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  24.18 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  24.05 
 
 
332 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  23.33 
 
 
289 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  23.33 
 
 
289 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  23.33 
 
 
289 aa  45.8  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  23.33 
 
 
289 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  23.33 
 
 
289 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  25.56 
 
 
316 aa  45.8  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  23.33 
 
 
289 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  26.56 
 
 
313 aa  45.8  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  21.67 
 
 
338 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4184  ribonuclease BN, putative  25.36 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.422861  normal  0.416212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  28.57 
 
 
306 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  21.29 
 
 
317 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  30.93 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  31.4 
 
 
346 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  20.68 
 
 
338 aa  43.9  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  26.98 
 
 
377 aa  44.3  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  32.09 
 
 
294 aa  44.3  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0869  putative ribonuclease BN  37.04 
 
 
134 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.119828  normal  0.359688 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  23 
 
 
289 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  21.52 
 
 
339 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  22.9 
 
 
286 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  24.89 
 
 
366 aa  43.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  24.89 
 
 
361 aa  43.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  22.3 
 
 
299 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  26.41 
 
 
313 aa  42.7  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  23.33 
 
 
341 aa  42.7  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  34.44 
 
 
336 aa  42.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>