197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4184 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4184  ribonuclease BN, putative  100 
 
 
269 aa  546  1e-154  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.422861  normal  0.416212 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  31.58 
 
 
447 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  24.73 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0609  ribonuclease BN  22.81 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0702  ribonuclease BN  25 
 
 
322 aa  65.5  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  24.06 
 
 
525 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  23.53 
 
 
290 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  23.53 
 
 
290 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  23.53 
 
 
290 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  23.53 
 
 
290 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  23.53 
 
 
290 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0958  ribonuclease BN, putative  25.57 
 
 
411 aa  64.3  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.107096 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  24.06 
 
 
525 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.031655 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03771  ribonuclease BN  24.43 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  24.43 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  24.43 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  24.43 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  24.43 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  24.43 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  24.43 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  24.43 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  24.43 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  27.88 
 
 
444 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  23.9 
 
 
290 aa  62  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  24.32 
 
 
408 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  25.81 
 
 
301 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  24.64 
 
 
320 aa  61.6  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  24.2 
 
 
405 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  28.04 
 
 
441 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  27.83 
 
 
307 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  24.62 
 
 
336 aa  60.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  23.48 
 
 
323 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  22.81 
 
 
291 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  23.48 
 
 
323 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  23.48 
 
 
323 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  23.27 
 
 
446 aa  58.9  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  25.65 
 
 
443 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  21.51 
 
 
337 aa  58.9  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  21.51 
 
 
337 aa  58.9  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  23.88 
 
 
305 aa  58.9  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  23.57 
 
 
298 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  22.69 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2779  ribonuclease BN  23.6 
 
 
453 aa  58.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00809939  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  23.11 
 
 
323 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  22.61 
 
 
298 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  21.13 
 
 
337 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  25.58 
 
 
411 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  23.41 
 
 
411 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  22.91 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1819  putative ribonuclease BN  29.01 
 
 
442 aa  57  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.193645 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  23.41 
 
 
411 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1994  ribonuclease BN  26.39 
 
 
443 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.20518  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1664  ribonuclease BN  26.39 
 
 
443 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0666088  hitchhiker  0.00703858 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  26.59 
 
 
443 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  28.08 
 
 
439 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0931  putative ribonuclease BN  25.37 
 
 
459 aa  56.2  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  26.22 
 
 
443 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0711  ribonuclease BN, putative  25.1 
 
 
422 aa  56.2  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0788126  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  26.22 
 
 
443 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  23.48 
 
 
325 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  24.07 
 
 
341 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  26.62 
 
 
442 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  28.09 
 
 
442 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  22.35 
 
 
277 aa  55.5  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  28.09 
 
 
442 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0739  putative ribonuclease BN  24.03 
 
 
434 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  24.71 
 
 
299 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  21.99 
 
 
370 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  23.75 
 
 
424 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  22.39 
 
 
285 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  24.24 
 
 
340 aa  54.3  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  22.22 
 
 
311 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  27.72 
 
 
442 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  21.07 
 
 
283 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  22.78 
 
 
446 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  23.62 
 
 
297 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  22.39 
 
 
294 aa  53.9  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2112  ribonuclease BN  28 
 
 
425 aa  53.9  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181145  normal  0.117227 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1200  putative ribonuclease BN  25.94 
 
 
429 aa  53.1  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0418  ribonuclease BN  23.22 
 
 
294 aa  53.1  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  26.36 
 
 
277 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  24.68 
 
 
341 aa  52.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5841  ribonuclease BN  24.34 
 
 
290 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  21.99 
 
 
538 aa  52.8  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  24.71 
 
 
437 aa  52  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1119  ribonuclease BN  25.56 
 
 
429 aa  52  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695932  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  22.38 
 
 
296 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  24.46 
 
 
437 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  24.46 
 
 
437 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0034  ribonuclease BN  23.44 
 
 
294 aa  51.6  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4186  ribonuclease BN  23.44 
 
 
294 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0452  ribonuclease BN, putative  25.69 
 
 
426 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0733  ribonuclease BN  28.02 
 
 
439 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0030  ribonuclease BN  23.44 
 
 
294 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  21.59 
 
 
310 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2769  putative ribonuclease BN  27.85 
 
 
404 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  24.46 
 
 
437 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  26.27 
 
 
417 aa  51.6  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  24.46 
 
 
437 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  27.57 
 
 
437 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>