248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2769 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1830  ribonuclease BN, putative  80.94 
 
 
404 aa  635    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0291213 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2769  putative ribonuclease BN  100 
 
 
404 aa  799    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  65.17 
 
 
417 aa  506  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2991  ribonuclease BN, putative  65.34 
 
 
416 aa  491  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1670  ribonuclease BN  62.76 
 
 
403 aa  483  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1454  putative ribonuclease BN  64.27 
 
 
446 aa  478  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4966  ribonuclease BN  61.27 
 
 
448 aa  468  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1119  ribonuclease BN  60.2 
 
 
429 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695932  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1200  putative ribonuclease BN  59.95 
 
 
429 aa  464  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  56.71 
 
 
416 aa  435  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1519  ribonuclease BN  53.57 
 
 
424 aa  393  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  43.42 
 
 
443 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  44.41 
 
 
442 aa  269  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1664  ribonuclease BN  44.92 
 
 
443 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0666088  hitchhiker  0.00703858 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  43.42 
 
 
443 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  43.42 
 
 
442 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  43.42 
 
 
443 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  43.42 
 
 
442 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  43.42 
 
 
442 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  44.63 
 
 
441 aa  265  8e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  40.78 
 
 
437 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1994  ribonuclease BN  44.07 
 
 
443 aa  263  6e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.20518  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  40.5 
 
 
437 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  40.5 
 
 
437 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  40.5 
 
 
437 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  40.5 
 
 
437 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  40.5 
 
 
437 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  41.18 
 
 
447 aa  262  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  41.24 
 
 
444 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0406  ribonuclease BN  40.5 
 
 
436 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0756  tRNA-processing ribonuclease BN  40.5 
 
 
436 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902171  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  38.55 
 
 
437 aa  255  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1354  ribonuclease BN  38.55 
 
 
436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875268  normal  0.303489 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  37.71 
 
 
439 aa  242  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  39.22 
 
 
336 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0452  ribonuclease BN, putative  39.2 
 
 
426 aa  192  7e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  37.25 
 
 
298 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  41.29 
 
 
337 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  41.29 
 
 
337 aa  190  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  40.23 
 
 
285 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  41.38 
 
 
337 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  39.79 
 
 
295 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  34.51 
 
 
451 aa  187  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  39.77 
 
 
323 aa  186  9e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  39.77 
 
 
323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  39.77 
 
 
323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  39.39 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  40.53 
 
 
340 aa  182  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  39.38 
 
 
405 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0418  ribonuclease BN  41.67 
 
 
294 aa  178  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  38.7 
 
 
320 aa  177  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  36.13 
 
 
445 aa  176  6e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  38.55 
 
 
411 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  38.55 
 
 
411 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3404  ribonuclease BN  39.39 
 
 
303 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  39.11 
 
 
412 aa  173  5e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  39.11 
 
 
412 aa  172  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  36.68 
 
 
294 aa  171  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  37.8 
 
 
408 aa  169  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3954  ribonuclease BN  38.82 
 
 
300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001900  ribonuclease BN  37.74 
 
 
314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.886374  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  38.24 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0693  ribonuclease BN  36.92 
 
 
288 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0935  ribonuclease BN  36.43 
 
 
432 aa  163  6e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  37.3 
 
 
297 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  36.43 
 
 
292 aa  161  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0979  putative ribonuclease BN  34.94 
 
 
282 aa  160  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  37.85 
 
 
310 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  38.76 
 
 
290 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  38.76 
 
 
290 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  38.76 
 
 
290 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  38.76 
 
 
290 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  38.76 
 
 
290 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  38.72 
 
 
290 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00593  ribonuclease BN  38.13 
 
 
314 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0609  ribonuclease BN  35.29 
 
 
303 aa  157  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  36.96 
 
 
296 aa  157  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03771  ribonuclease BN  38.37 
 
 
290 aa  156  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  38.37 
 
 
290 aa  156  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  38.37 
 
 
290 aa  156  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  38.37 
 
 
290 aa  156  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  38.37 
 
 
290 aa  156  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  38.37 
 
 
290 aa  156  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  38.37 
 
 
290 aa  156  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  38.37 
 
 
290 aa  156  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  38.37 
 
 
290 aa  156  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1623  ribonuclease BN  35.59 
 
 
428 aa  155  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.722239  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0716  ribonuclease BN/unknown domain fusion protein  33.05 
 
 
424 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603481  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04555  ribonuclease BN/unknown domain fusion protein  33.25 
 
 
425 aa  153  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4186  ribonuclease BN  34.63 
 
 
294 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0030  ribonuclease BN  34.63 
 
 
294 aa  149  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0034  ribonuclease BN  34.63 
 
 
294 aa  149  8e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1521  ribonuclease BN  35.21 
 
 
441 aa  147  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00169169  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1471  ribonuclease BN  30.4 
 
 
422 aa  145  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.604096 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  32.85 
 
 
525 aa  144  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  32.48 
 
 
525 aa  143  5e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  33.7 
 
 
538 aa  142  8e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1323  ribonuclease BN  34.68 
 
 
427 aa  141  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1653  putative ribonuclease BN  34.05 
 
 
449 aa  139  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.957488  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3068  ribonuclease BN  35.74 
 
 
275 aa  136  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0617893  hitchhiker  0.000205961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>