More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1131 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  78.65 
 
 		 444 aa  718    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  100 
 
 		 447 aa  895    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  68.12 
 
 		 441 aa  558  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1664  ribonuclease BN  67.65 
 
 		 443 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0666088  hitchhiker  0.00703858 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1994  ribonuclease BN  67.65 
 
 		 443 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.20518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  45.79 
 
 		 437 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1354  ribonuclease BN  46.02 
 
 		 436 aa  362  6e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875268  normal  0.303489 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  48.16 
 
 		 439 aa  342  7e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  47 
 
 		 443 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  45.07 
 
 		 442 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  45.07 
 
 		 442 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  45.07 
 
 		 442 aa  326  6e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  43.51 
 
 		 442 aa  325  9e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  43.26 
 
 		 443 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  43.26 
 
 		 443 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  46.38 
 
 		 437 aa  319  7e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  44.77 
 
 		 437 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  44.77 
 
 		 437 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  44.77 
 
 		 437 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  44.77 
 
 		 437 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  44.77 
 
 		 437 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0406  ribonuclease BN  44.77 
 
 		 436 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0756  tRNA-processing ribonuclease BN  44.77 
 
 		 436 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902171  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2769  putative ribonuclease BN  41.18 
 
 		 404 aa  262  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1519  ribonuclease BN  41.67 
 
 		 424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  40.41 
 
 		 416 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1830  ribonuclease BN, putative  41.47 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0291213 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  39.55 
 
 		 417 aa  249  6e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0452  ribonuclease BN, putative  40.62 
 
 		 426 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4966  ribonuclease BN  39.83 
 
 		 448 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1119  ribonuclease BN  38.61 
 
 		 429 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695932  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1670  ribonuclease BN  41.06 
 
 		 403 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1200  putative ribonuclease BN  38.34 
 
 		 429 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2991  ribonuclease BN, putative  39.26 
 
 		 416 aa  221  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1454  putative ribonuclease BN  38.04 
 
 		 446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  39.64 
 
 		 290 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  39.64 
 
 		 290 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  39.64 
 
 		 290 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  39.64 
 
 		 290 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  39.64 
 
 		 290 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  39.92 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  34.8 
 
 		 451 aa  210  4e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  35.9 
 
 		 408 aa  210  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  32.61 
 
 		 411 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  39.71 
 
 		 290 aa  209  7e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03771  ribonuclease BN  40.52 
 
 		 290 aa  209  8e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  40.52 
 
 		 290 aa  209  8e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  40.52 
 
 		 290 aa  209  8e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  40.52 
 
 		 290 aa  209  8e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  40.52 
 
 		 290 aa  209  8e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  40.52 
 
 		 290 aa  209  8e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  40.52 
 
 		 290 aa  209  8e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  40.52 
 
 		 290 aa  209  8e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  40.52 
 
 		 290 aa  209  8e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  40.32 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  40.32 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  40.32 
 
 		 323 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  39.92 
 
 		 323 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  40.47 
 
 		 411 aa  206  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  38.43 
 
 		 340 aa  205  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  38.34 
 
 		 285 aa  206  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  39.53 
 
 		 298 aa  205  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  38.74 
 
 		 295 aa  203  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  39.39 
 
 		 296 aa  204  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  39.37 
 
 		 337 aa  203  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  39.37 
 
 		 337 aa  204  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  39.53 
 
 		 320 aa  203  5e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  41.06 
 
 		 405 aa  202  8e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3404  ribonuclease BN  40.94 
 
 		 303 aa  202  8e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  38.98 
 
 		 337 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  38.75 
 
 		 445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  38.78 
 
 		 294 aa  200  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  33.59 
 
 		 412 aa  199  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  33.59 
 
 		 412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  36.13 
 
 		 292 aa  193  5e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0979  putative ribonuclease BN  37.18 
 
 		 282 aa  192  7e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  30.27 
 
 		 525 aa  192  9e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0030  ribonuclease BN  36.9 
 
 		 294 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0034  ribonuclease BN  36.9 
 
 		 294 aa  192  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4186  ribonuclease BN  36.9 
 
 		 294 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0418  ribonuclease BN  38.49 
 
 		 294 aa  190  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  30.29 
 
 		 525 aa  189  5.999999999999999e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0716  ribonuclease BN/unknown domain fusion protein  34.83 
 
 		 424 aa  186  6e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603481  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  36.54 
 
 		 538 aa  183  6e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  35.71 
 
 		 313 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0693  ribonuclease BN  34.32 
 
 		 288 aa  179  9e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04555  ribonuclease BN/unknown domain fusion protein  32.51 
 
 		 425 aa  179  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0609  ribonuclease BN  36.02 
 
 		 303 aa  178  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3954  ribonuclease BN  35.23 
 
 		 300 aa  178  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1895  ribonuclease BN, putative  39.19 
 
 		 410 aa  176  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0901  tRNA-processing RNAse BN  32.21 
 
 		 433 aa  171  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562692  decreased coverage  0.000000115397 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 297 aa  169  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1471  ribonuclease BN  30.05 
 
 		 422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.604096 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  34.13 
 
 		 310 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001900  ribonuclease BN  32.12 
 
 		 314 aa  162  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.886374  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00593  ribonuclease BN  34.46 
 
 		 314 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1013  ribonuclease BN  28.11 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.58276 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1623  ribonuclease BN  36.82 
 
 		 428 aa  154  4e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.722239  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2625  tRNA-processing RNAse BN  41.26 
 
 		 440 aa  153  7e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.721412  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3068  ribonuclease BN  35.71 
 
 		 275 aa  144  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0617893  hitchhiker  0.000205961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>