205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0931 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0931  putative ribonuclease BN  100 
 
 		 459 aa  925    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0764  ribonuclease BN  40.91 
 
 		 452 aa  325  9e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3053  putative ribonuclease BN  40.78 
 
 		 451 aa  296  6e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2655  ribonuclease BN  37.06 
 
 		 439 aa  294  3e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1636  ribonuclease BN  36.43 
 
 		 447 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0711  ribonuclease BN, putative  37.05 
 
 		 422 aa  238  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0788126  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1514  ribonuclease BN  35.79 
 
 		 472 aa  236  9e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.258349  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2157  ribonuclease BN, putative  35.15 
 
 		 430 aa  218  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2779  ribonuclease BN  32.48 
 
 		 453 aa  211  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00809939  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  34.14 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  30.15 
 
 		 446 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0638  putative ribonuclease BN  28.88 
 
 		 449 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00048226  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  32.76 
 
 		 417 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  30.39 
 
 		 446 aa  192  9e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1979  hypothetical protein  31.39 
 
 		 479 aa  186  9e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1819  putative ribonuclease BN  32.35 
 
 		 442 aa  172  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.193645 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3064  ribonuclease BN, putative  30.05 
 
 		 473 aa  169  8e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00183316  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4086  putative ribonuclease BN  31.39 
 
 		 487 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  30.08 
 
 		 450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2112  ribonuclease BN  30.79 
 
 		 425 aa  158  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181145  normal  0.117227 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0739  putative ribonuclease BN  33.89 
 
 		 434 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2681  ribonuclease BN  29.88 
 
 		 561 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.267088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  29.18 
 
 		 499 aa  144  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0733  ribonuclease BN  29.86 
 
 		 439 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0732  ribonuclease BN  30.88 
 
 		 439 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0697  ribonuclease BN, putative  30.4 
 
 		 429 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47498  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0595  ribonuclease BN  28.03 
 
 		 460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0958  ribonuclease BN, putative  25.38 
 
 		 411 aa  122  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.107096 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1354  ribonuclease BN  32.52 
 
 		 436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875268  normal  0.303489 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  32.11 
 
 		 437 aa  120  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0732  ribonuclease BN  25.98 
 
 		 424 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119651  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  34.01 
 
 		 443 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  33.6 
 
 		 443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  33.6 
 
 		 443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  31.75 
 
 		 437 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  31.75 
 
 		 437 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  31.75 
 
 		 437 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  31.75 
 
 		 437 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  31.75 
 
 		 437 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  32.93 
 
 		 442 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  33.2 
 
 		 442 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  31.85 
 
 		 437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  33.2 
 
 		 442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  33.2 
 
 		 442 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  31.71 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0406  ribonuclease BN  31.75 
 
 		 436 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0756  tRNA-processing ribonuclease BN  31.75 
 
 		 436 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902171  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  30.83 
 
 		 451 aa  114  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  29.84 
 
 		 525 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  29.84 
 
 		 525 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  30.5 
 
 		 441 aa  110  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  32.38 
 
 		 447 aa  110  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  30.14 
 
 		 412 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  30.14 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  29.14 
 
 		 313 aa  107  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1664  ribonuclease BN  28.31 
 
 		 443 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0666088  hitchhiker  0.00703858 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  29.27 
 
 		 444 aa  107  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1994  ribonuclease BN  28 
 
 		 443 aa  107  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.20518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  30.29 
 
 		 337 aa  106  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  30.29 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  29.04 
 
 		 320 aa  106  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  30.29 
 
 		 337 aa  106  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  31.1 
 
 		 416 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  28.79 
 
 		 297 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  27.13 
 
 		 538 aa  105  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  30.29 
 
 		 295 aa  104  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  29.96 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  26.57 
 
 		 336 aa  103  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1519  ribonuclease BN  31.08 
 
 		 424 aa  103  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  28.74 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  30.27 
 
 		 296 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2991  ribonuclease BN, putative  29.68 
 
 		 416 aa  100  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  29.62 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  29.43 
 
 		 323 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  29.43 
 
 		 323 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4966  ribonuclease BN  30.22 
 
 		 448 aa  100  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  27.94 
 
 		 285 aa  100  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  30.88 
 
 		 411 aa  100  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  29.06 
 
 		 323 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  32.08 
 
 		 411 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1830  ribonuclease BN, putative  32.14 
 
 		 404 aa  98.2  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0291213 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  29.48 
 
 		 417 aa  98.2  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1119  ribonuclease BN  28.34 
 
 		 429 aa  97.4  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695932  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1200  putative ribonuclease BN  28.03 
 
 		 429 aa  96.3  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04555  ribonuclease BN/unknown domain fusion protein  29.66 
 
 		 425 aa  96.3  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  30.52 
 
 		 405 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2958  ribonuclease BN  28.57 
 
 		 286 aa  95.1  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  32.99 
 
 		 445 aa  95.5  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2769  putative ribonuclease BN  28.51 
 
 		 404 aa  94.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0935  ribonuclease BN  26.73 
 
 		 432 aa  93.6  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  27.72 
 
 		 310 aa  93.6  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  29.07 
 
 		 408 aa  93.2  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  30.29 
 
 		 290 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  30.29 
 
 		 290 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  30.29 
 
 		 290 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  30.29 
 
 		 290 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  30.29 
 
 		 290 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1454  putative ribonuclease BN  29.3 
 
 		 446 aa  92.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  28.62 
 
 		 294 aa  92  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1670  ribonuclease BN  28.17 
 
 		 403 aa  90.9  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>