256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1819 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1819  putative ribonuclease BN  100 
 
 		 442 aa  889    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.193645 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  46.54 
 
 		 450 aa  423  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0595  ribonuclease BN  42.62 
 
 		 460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1979  hypothetical protein  39.22 
 
 		 479 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0638  putative ribonuclease BN  40.05 
 
 		 449 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00048226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2779  ribonuclease BN  35.67 
 
 		 453 aa  298  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00809939  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  36.73 
 
 		 397 aa  260  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0958  ribonuclease BN, putative  33.82 
 
 		 411 aa  256  7e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.107096 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  35.44 
 
 		 446 aa  254  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  34.65 
 
 		 446 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3064  ribonuclease BN, putative  33.71 
 
 		 473 aa  253  6e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00183316  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2112  ribonuclease BN  34.41 
 
 		 425 aa  236  8e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181145  normal  0.117227 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  36.18 
 
 		 417 aa  233  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0764  ribonuclease BN  31.25 
 
 		 452 aa  211  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0732  ribonuclease BN  28.98 
 
 		 424 aa  208  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119651  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2655  ribonuclease BN  32.14 
 
 		 439 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3053  putative ribonuclease BN  29.68 
 
 		 451 aa  186  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1636  ribonuclease BN  31.21 
 
 		 447 aa  182  7e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2681  ribonuclease BN  30.49 
 
 		 561 aa  182  7e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.267088 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4086  putative ribonuclease BN  30.03 
 
 		 487 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0711  ribonuclease BN, putative  31.63 
 
 		 422 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0788126  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0818  ribonuclease BN  29.53 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0931  putative ribonuclease BN  32.85 
 
 		 459 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  28.72 
 
 		 499 aa  173  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2157  ribonuclease BN, putative  31.78 
 
 		 430 aa  157  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1514  ribonuclease BN  31.25 
 
 		 472 aa  154  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.258349  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0739  putative ribonuclease BN  27.78 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  30.04 
 
 		 439 aa  130  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  26.64 
 
 		 437 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  26.65 
 
 		 443 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2958  ribonuclease BN  32.84 
 
 		 286 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0697  ribonuclease BN, putative  28.57 
 
 		 429 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47498  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0733  ribonuclease BN  29.03 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  25.66 
 
 		 437 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1354  ribonuclease BN  27.15 
 
 		 436 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875268  normal  0.303489 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  26.19 
 
 		 437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  26.19 
 
 		 437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  26.19 
 
 		 437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0732  ribonuclease BN  27.94 
 
 		 439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  26.19 
 
 		 437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  26.19 
 
 		 437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  30.24 
 
 		 323 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  31.1 
 
 		 336 aa  121  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  30 
 
 		 442 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  30 
 
 		 442 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  30 
 
 		 442 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  30.24 
 
 		 323 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  28.57 
 
 		 451 aa  120  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  30.24 
 
 		 323 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  30 
 
 		 443 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  28.57 
 
 		 442 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0756  tRNA-processing ribonuclease BN  26.19 
 
 		 436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902171  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  30.24 
 
 		 323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  30 
 
 		 443 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0406  ribonuclease BN  26.19 
 
 		 436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  30.07 
 
 		 295 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  29.9 
 
 		 337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  28.73 
 
 		 412 aa  116  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1664  ribonuclease BN  30.65 
 
 		 443 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0666088  hitchhiker  0.00703858 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  27.85 
 
 		 447 aa  116  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  29.55 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1994  ribonuclease BN  30.65 
 
 		 443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.20518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  29.97 
 
 		 337 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  28.36 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  30.47 
 
 		 285 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  29.86 
 
 		 340 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  30.35 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  27.69 
 
 		 525 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  29.32 
 
 		 444 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  29.93 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  27.39 
 
 		 525 aa  111  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  30.27 
 
 		 441 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0418  ribonuclease BN  31.53 
 
 		 294 aa  109  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  30.47 
 
 		 411 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  27.8 
 
 		 538 aa  106  7e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  28.47 
 
 		 297 aa  106  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  30.47 
 
 		 411 aa  106  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  27.67 
 
 		 313 aa  106  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  28.74 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0901  tRNA-processing RNAse BN  25.81 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562692  decreased coverage  0.000000115397 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  28.89 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1519  ribonuclease BN  28.68 
 
 		 424 aa  99  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3404  ribonuclease BN  29.17 
 
 		 303 aa  99.4  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  27.27 
 
 		 292 aa  99.4  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1521  ribonuclease BN  26.92 
 
 		 441 aa  98.6  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00169169  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  26.77 
 
 		 310 aa  97.4  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  29.33 
 
 		 445 aa  96.7  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0935  ribonuclease BN  25.07 
 
 		 432 aa  95.9  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1670  ribonuclease BN  27.69 
 
 		 403 aa  96.3  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1895  ribonuclease BN, putative  30.58 
 
 		 410 aa  95.5  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  25.87 
 
 		 416 aa  95.1  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  25.6 
 
 		 294 aa  93.2  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  27.13 
 
 		 417 aa  93.2  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001900  ribonuclease BN  25.54 
 
 		 314 aa  92  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.886374  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0170  ribonuclease BN  26.28 
 
 		 583 aa  91.7  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000105612  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0409  ribonuclease BN  28.24 
 
 		 278 aa  91.7  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1765  YihY family protein  28.24 
 
 		 278 aa  91.7  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2769  putative ribonuclease BN  28.84 
 
 		 404 aa  91.3  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3068  ribonuclease BN  26.95 
 
 		 275 aa  90.9  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0617893  hitchhiker  0.000205961 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1200  putative ribonuclease BN  24.71 
 
 		 429 aa  90.9  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.510939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>