115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0170 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0170  ribonuclease BN  100 
 
 
583 aa  1152    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000105612  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1979  hypothetical protein  27.08 
 
 
479 aa  102  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2779  ribonuclease BN  23.33 
 
 
453 aa  91.7  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00809939  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3064  ribonuclease BN, putative  22.26 
 
 
473 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00183316  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1819  putative ribonuclease BN  26.28 
 
 
442 aa  89  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.193645 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0638  putative ribonuclease BN  23.37 
 
 
449 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00048226  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  25.11 
 
 
397 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  25.66 
 
 
417 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  23.05 
 
 
446 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  21.93 
 
 
446 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2112  ribonuclease BN  28.57 
 
 
425 aa  73.9  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181145  normal  0.117227 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0764  ribonuclease BN  25.93 
 
 
452 aa  73.6  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2681  ribonuclease BN  25.38 
 
 
561 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.267088 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  22.65 
 
 
450 aa  70.9  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0958  ribonuclease BN, putative  23.77 
 
 
411 aa  70.1  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.107096 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  27.18 
 
 
412 aa  69.7  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  27.18 
 
 
412 aa  69.3  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  25.85 
 
 
525 aa  68.9  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0595  ribonuclease BN  23.08 
 
 
460 aa  69.3  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  25.42 
 
 
525 aa  67  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  25.6 
 
 
447 aa  65.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3053  putative ribonuclease BN  23.21 
 
 
451 aa  65.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  27.57 
 
 
445 aa  64.7  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  25.45 
 
 
320 aa  63.9  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  28.65 
 
 
444 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  30 
 
 
336 aa  63.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  25.79 
 
 
337 aa  62  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  25.11 
 
 
340 aa  62.4  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  25.79 
 
 
337 aa  61.6  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1514  ribonuclease BN  25.23 
 
 
472 aa  61.2  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.258349  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1636  ribonuclease BN  22.37 
 
 
447 aa  60.5  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  26.61 
 
 
538 aa  60.5  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  27.56 
 
 
313 aa  60.1  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  24.54 
 
 
337 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  26.79 
 
 
323 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  26.79 
 
 
323 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  26.79 
 
 
323 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2655  ribonuclease BN  28.24 
 
 
439 aa  60.1  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0452  ribonuclease BN, putative  26.27 
 
 
426 aa  58.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  27.92 
 
 
297 aa  58.9  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  26.79 
 
 
323 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4086  putative ribonuclease BN  22.78 
 
 
487 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1664  ribonuclease BN  25.22 
 
 
443 aa  57.4  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0666088  hitchhiker  0.00703858 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1994  ribonuclease BN  25.33 
 
 
443 aa  57.4  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.20518  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0732  ribonuclease BN  24.71 
 
 
424 aa  57.4  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119651  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  25.73 
 
 
441 aa  56.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  25.12 
 
 
295 aa  56.6  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1830  ribonuclease BN, putative  22.64 
 
 
404 aa  56.2  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0291213 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  24.38 
 
 
416 aa  56.6  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1354  ribonuclease BN  24.53 
 
 
436 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875268  normal  0.303489 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  27.54 
 
 
417 aa  56.2  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  24.87 
 
 
298 aa  55.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  24.63 
 
 
451 aa  55.5  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0733  ribonuclease BN  27.56 
 
 
439 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  23.44 
 
 
439 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  24.53 
 
 
437 aa  55.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0732  ribonuclease BN  27.56 
 
 
439 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  27.05 
 
 
292 aa  53.9  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  28.57 
 
 
285 aa  53.9  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1670  ribonuclease BN  24.06 
 
 
403 aa  53.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2769  putative ribonuclease BN  24.02 
 
 
404 aa  53.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1200  putative ribonuclease BN  23.97 
 
 
429 aa  53.5  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2991  ribonuclease BN, putative  26.77 
 
 
416 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0901  tRNA-processing RNAse BN  23.27 
 
 
433 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562692  decreased coverage  0.000000115397 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3404  ribonuclease BN  28.49 
 
 
303 aa  52.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  26.58 
 
 
408 aa  52.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  26.5 
 
 
294 aa  52.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1119  ribonuclease BN  23.55 
 
 
429 aa  52.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695932  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1653  putative ribonuclease BN  28.71 
 
 
449 aa  52  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.957488  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  28.5 
 
 
405 aa  52  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0739  putative ribonuclease BN  23.85 
 
 
434 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1519  ribonuclease BN  23.5 
 
 
424 aa  51.6  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0418  ribonuclease BN  25 
 
 
294 aa  50.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0931  putative ribonuclease BN  21 
 
 
459 aa  50.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  22.81 
 
 
499 aa  50.4  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0697  ribonuclease BN, putative  26.77 
 
 
429 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47498  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  26.05 
 
 
321 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0711  ribonuclease BN, putative  25 
 
 
422 aa  49.3  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0788126  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  22.79 
 
 
442 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  22.38 
 
 
443 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  22.79 
 
 
442 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  22.38 
 
 
443 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4966  ribonuclease BN  27.18 
 
 
448 aa  47.8  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  21.9 
 
 
443 aa  47.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2157  ribonuclease BN, putative  20.64 
 
 
430 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001900  ribonuclease BN  26.4 
 
 
314 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.886374  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3954  ribonuclease BN  25 
 
 
300 aa  46.6  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  26.78 
 
 
411 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0406  ribonuclease BN  23.47 
 
 
436 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0756  tRNA-processing ribonuclease BN  23.47 
 
 
436 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902171  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  26.78 
 
 
411 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  27.5 
 
 
442 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  22.38 
 
 
442 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0818  ribonuclease BN  19.82 
 
 
405 aa  46.6  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  26.42 
 
 
310 aa  47  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0030  ribonuclease BN  26.44 
 
 
294 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0034  ribonuclease BN  26.44 
 
 
294 aa  46.2  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4186  ribonuclease BN  26.44 
 
 
294 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1013  ribonuclease BN  24.2 
 
 
427 aa  46.2  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.58276 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  23 
 
 
437 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>