290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1521 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1521  ribonuclease BN  100 
 
 		 441 aa  885    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00169169  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1653  putative ribonuclease BN  59.6 
 
 		 449 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.957488  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1623  ribonuclease BN  56.3 
 
 		 428 aa  442  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.722239  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1013  ribonuclease BN  51.22 
 
 		 427 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.58276 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0935  ribonuclease BN  51.59 
 
 		 432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1471  ribonuclease BN  50.37 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.604096 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1323  ribonuclease BN  51.44 
 
 		 427 aa  391  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  43.8 
 
 		 294 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  46.83 
 
 		 295 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  44.74 
 
 		 337 aa  232  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  44.74 
 
 		 337 aa  232  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  44.74 
 
 		 337 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  45.93 
 
 		 323 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  45.93 
 
 		 323 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  45.93 
 
 		 323 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  45.93 
 
 		 323 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  45.34 
 
 		 340 aa  227  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  43.75 
 
 		 320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  41.98 
 
 		 297 aa  225  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001900  ribonuclease BN  44.09 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.886374  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  44.67 
 
 		 336 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  44.72 
 
 		 298 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  42.75 
 
 		 310 aa  220  3.9999999999999997e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  44.72 
 
 		 285 aa  220  5e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  31.67 
 
 		 412 aa  219  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00593  ribonuclease BN  44.09 
 
 		 314 aa  218  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  31.42 
 
 		 412 aa  217  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  38.85 
 
 		 313 aa  216  8e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0418  ribonuclease BN  45.24 
 
 		 294 aa  209  6e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0609  ribonuclease BN  39.92 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  33.11 
 
 		 445 aa  206  7e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  43.95 
 
 		 292 aa  205  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  33.52 
 
 		 405 aa  203  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3954  ribonuclease BN  43.95 
 
 		 300 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  33.24 
 
 		 411 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  32.4 
 
 		 411 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  32.97 
 
 		 451 aa  199  9e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3404  ribonuclease BN  42.57 
 
 		 303 aa  194  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  33.6 
 
 		 408 aa  185  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  37.5 
 
 		 296 aa  185  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0693  ribonuclease BN  38.25 
 
 		 288 aa  184  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  36.54 
 
 		 290 aa  181  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  36.29 
 
 		 290 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  36.29 
 
 		 290 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  36.29 
 
 		 290 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  36.29 
 
 		 290 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  36.29 
 
 		 290 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03771  ribonuclease BN  37.05 
 
 		 290 aa  176  8e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  37.05 
 
 		 290 aa  176  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  37.05 
 
 		 290 aa  176  8e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  37.05 
 
 		 290 aa  176  8e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  37.05 
 
 		 290 aa  176  8e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  37.05 
 
 		 290 aa  176  8e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  37.05 
 
 		 290 aa  176  8e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  37.05 
 
 		 290 aa  176  8e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  37.05 
 
 		 290 aa  176  8e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0030  ribonuclease BN  37.01 
 
 		 294 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4186  ribonuclease BN  37.6 
 
 		 294 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0034  ribonuclease BN  37.01 
 
 		 294 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0452  ribonuclease BN, putative  32.38 
 
 		 426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  38.65 
 
 		 417 aa  159  9e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  29.44 
 
 		 538 aa  158  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1354  ribonuclease BN  29.9 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875268  normal  0.303489 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0901  tRNA-processing RNAse BN  29.81 
 
 		 433 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562692  decreased coverage  0.000000115397 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  34.48 
 
 		 439 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1670  ribonuclease BN  33.72 
 
 		 403 aa  153  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  29.78 
 
 		 437 aa  153  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0716  ribonuclease BN/unknown domain fusion protein  29.38 
 
 		 424 aa  151  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603481  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  30.35 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  30.35 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  30.35 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  30.35 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1519  ribonuclease BN  34.47 
 
 		 424 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  27.49 
 
 		 525 aa  151  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2769  putative ribonuclease BN  35 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  30.35 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  33.8 
 
 		 416 aa  151  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  30.08 
 
 		 437 aa  150  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0406  ribonuclease BN  30.08 
 
 		 436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  27.22 
 
 		 525 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0756  tRNA-processing ribonuclease BN  30.08 
 
 		 436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902171  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04555  ribonuclease BN/unknown domain fusion protein  30.15 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  31.61 
 
 		 447 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  30.72 
 
 		 441 aa  144  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  34.36 
 
 		 442 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  34.77 
 
 		 442 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  34.38 
 
 		 442 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  33.58 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1830  ribonuclease BN, putative  35.12 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0291213 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1895  ribonuclease BN, putative  31.35 
 
 		 410 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  33.2 
 
 		 443 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1664  ribonuclease BN  29.35 
 
 		 443 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0666088  hitchhiker  0.00703858 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1200  putative ribonuclease BN  34.55 
 
 		 429 aa  139  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  33.2 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  32.82 
 
 		 443 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  32.82 
 
 		 443 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1994  ribonuclease BN  29.08 
 
 		 443 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.20518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1119  ribonuclease BN  34.15 
 
 		 429 aa  138  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695932  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0697  ribonuclease BN, putative  29.55 
 
 		 429 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47498  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0732  ribonuclease BN  29.55 
 
 		 439 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>