234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3068 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3068  ribonuclease BN  100 
 
 		 275 aa  537  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0617893  hitchhiker  0.000205961 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  36.99 
 
 		 451 aa  149  7e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  37.35 
 
 		 416 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  38.37 
 
 		 411 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  37.98 
 
 		 411 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  35.71 
 
 		 447 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  37.4 
 
 		 444 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  34.63 
 
 		 408 aa  136  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2769  putative ribonuclease BN  35.74 
 
 		 404 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  34.4 
 
 		 525 aa  135  9e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  34.4 
 
 		 525 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  35.83 
 
 		 443 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  35.83 
 
 		 443 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  36.22 
 
 		 437 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  36.22 
 
 		 437 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  36.22 
 
 		 437 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  36.22 
 
 		 437 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  36.22 
 
 		 437 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  35.43 
 
 		 437 aa  132  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  33.2 
 
 		 437 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  35.83 
 
 		 443 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  34.9 
 
 		 442 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  34.9 
 
 		 442 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  34.14 
 
 		 417 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  34.51 
 
 		 442 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1354  ribonuclease BN  32.81 
 
 		 436 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875268  normal  0.303489 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  35.25 
 
 		 405 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  33.07 
 
 		 538 aa  129  6e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0406  ribonuclease BN  36.22 
 
 		 436 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0756  tRNA-processing ribonuclease BN  36.22 
 
 		 436 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902171  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0979  putative ribonuclease BN  32.21 
 
 		 282 aa  128  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  34.78 
 
 		 442 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0452  ribonuclease BN, putative  35.04 
 
 		 426 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1830  ribonuclease BN, putative  34.14 
 
 		 404 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0291213 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1119  ribonuclease BN  34.4 
 
 		 429 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695932  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  32.68 
 
 		 439 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1200  putative ribonuclease BN  34 
 
 		 429 aa  125  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1670  ribonuclease BN  32.13 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1664  ribonuclease BN  32.27 
 
 		 443 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0666088  hitchhiker  0.00703858 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1519  ribonuclease BN  32.66 
 
 		 424 aa  123  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1994  ribonuclease BN  32.27 
 
 		 443 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.20518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4966  ribonuclease BN  32.93 
 
 		 448 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  38.71 
 
 		 445 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1454  putative ribonuclease BN  34.4 
 
 		 446 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  31.87 
 
 		 441 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0901  tRNA-processing RNAse BN  30.68 
 
 		 433 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562692  decreased coverage  0.000000115397 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  30.42 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  29.46 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1765  YihY family protein  31.35 
 
 		 278 aa  115  8.999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0409  ribonuclease BN  31.35 
 
 		 278 aa  115  8.999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  32.2 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1895  ribonuclease BN, putative  36.33 
 
 		 410 aa  112  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3404  ribonuclease BN  32.56 
 
 		 303 aa  112  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0716  ribonuclease BN/unknown domain fusion protein  32.56 
 
 		 424 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603481  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  30.5 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  31.56 
 
 		 337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  32.43 
 
 		 337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  29.43 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  30.42 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  30.42 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  30.42 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  30.42 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  30.42 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03771  ribonuclease BN  30.42 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  30.42 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  30.42 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  31.56 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  30.42 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  30.42 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  30.42 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  30.42 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  30.42 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  30.42 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  30.92 
 
 		 412 aa  109  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0693  ribonuclease BN  28.46 
 
 		 288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2991  ribonuclease BN, putative  32.13 
 
 		 416 aa  109  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  30.92 
 
 		 412 aa  109  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  30.5 
 
 		 290 aa  108  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  31.6 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  31.6 
 
 		 323 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  31.72 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  30.62 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  31.72 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  29.92 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  27.05 
 
 		 296 aa  105  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  28.57 
 
 		 336 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0609  ribonuclease BN  30.65 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0418  ribonuclease BN  32.68 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1577  ribonuclease BN  29.6 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.274703  normal  0.013095 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0034  ribonuclease BN  26.91 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4186  ribonuclease BN  26.91 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1902  YihY family protein  30.04 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.567508  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0030  ribonuclease BN  26.91 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  28.91 
 
 		 320 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  32.03 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04555  ribonuclease BN/unknown domain fusion protein  27.51 
 
 		 425 aa  99.8  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  30.12 
 
 		 450 aa  99.4  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1636  ribonuclease BN  29.01 
 
 		 447 aa  96.7  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001900  ribonuclease BN  29.46 
 
 		 314 aa  94.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.886374  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1721  putative ribonuclease BN  27.78 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00706044  normal  0.0142065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>