267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1577 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1577  ribonuclease BN  100 
 
 		 294 aa  590  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.274703  normal  0.013095 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1902  YihY family protein  100 
 
 		 262 aa  517  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.567508  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  32.14 
 
 		 451 aa  127  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1765  YihY family protein  31.62 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0409  ribonuclease BN  31.62 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  29.96 
 
 		 412 aa  115  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  32.67 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  29.57 
 
 		 412 aa  113  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  32.27 
 
 		 411 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  30.6 
 
 		 405 aa  112  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0716  ribonuclease BN/unknown domain fusion protein  29.89 
 
 		 424 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603481  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3068  ribonuclease BN  30.35 
 
 		 275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0617893  hitchhiker  0.000205961 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  31.89 
 
 		 313 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  29.53 
 
 		 336 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0638  putative ribonuclease BN  28.4 
 
 		 449 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00048226  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  28.68 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  27.53 
 
 		 525 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  28.63 
 
 		 525 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  29.55 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  30.04 
 
 		 439 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1519  ribonuclease BN  31.17 
 
 		 424 aa  106  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  31.05 
 
 		 437 aa  106  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  28.63 
 
 		 538 aa  105  8e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  30.12 
 
 		 437 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  29.89 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  29.89 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  29.89 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  29.41 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  29.89 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  31.05 
 
 		 437 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  31.05 
 
 		 437 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  31.05 
 
 		 437 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  31.05 
 
 		 437 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  31.05 
 
 		 437 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  29.8 
 
 		 441 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1354  ribonuclease BN  29.72 
 
 		 436 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875268  normal  0.303489 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  29.59 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  30.94 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  31.84 
 
 		 416 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  31.82 
 
 		 442 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  28.23 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  28.24 
 
 		 337 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  27.97 
 
 		 337 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  27.97 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  29.78 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  30.74 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0406  ribonuclease BN  31.05 
 
 		 436 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0756  tRNA-processing ribonuclease BN  31.05 
 
 		 436 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902171  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  31.44 
 
 		 442 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  31.44 
 
 		 442 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  30.71 
 
 		 443 aa  99  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  30.71 
 
 		 443 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  30.68 
 
 		 442 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04555  ribonuclease BN/unknown domain fusion protein  28.74 
 
 		 425 aa  98.2  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  27.34 
 
 		 397 aa  96.3  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  28.41 
 
 		 290 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  29.92 
 
 		 443 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  28.41 
 
 		 290 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  28.41 
 
 		 290 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  28.41 
 
 		 290 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  28.41 
 
 		 290 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  27.13 
 
 		 294 aa  95.9  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1664  ribonuclease BN  28.16 
 
 		 443 aa  96.3  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0666088  hitchhiker  0.00703858 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0693  ribonuclease BN  25.65 
 
 		 288 aa  96.3  6e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  29.41 
 
 		 310 aa  95.9  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1994  ribonuclease BN  28.16 
 
 		 443 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.20518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  27.76 
 
 		 360 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0418  ribonuclease BN  29.12 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03771  ribonuclease BN  27.65 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  27.65 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  27.65 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  27.65 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1979  hypothetical protein  30.47 
 
 		 479 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  27.65 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  27.65 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  27.65 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  33.07 
 
 		 417 aa  94.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  27.65 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  27.65 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0901  tRNA-processing RNAse BN  28.03 
 
 		 433 aa  94  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562692  decreased coverage  0.000000115397 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1670  ribonuclease BN  30 
 
 		 403 aa  93.6  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2779  ribonuclease BN  27.55 
 
 		 453 aa  92.8  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00809939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  29.07 
 
 		 446 aa  92.8  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  27.91 
 
 		 446 aa  92.4  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1653  putative ribonuclease BN  29.62 
 
 		 449 aa  92.4  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.957488  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1323  ribonuclease BN  30.14 
 
 		 427 aa  92.4  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  28.93 
 
 		 447 aa  92.4  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0030  ribonuclease BN  28.46 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4186  ribonuclease BN  28.46 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0452  ribonuclease BN, putative  29.44 
 
 		 426 aa  91.3  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0034  ribonuclease BN  28.46 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  27.72 
 
 		 322 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  32.44 
 
 		 445 aa  91.3  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1200  putative ribonuclease BN  31.02 
 
 		 429 aa  89.7  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1119  ribonuclease BN  31.02 
 
 		 429 aa  89.7  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695932  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  28.73 
 
 		 291 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2769  putative ribonuclease BN  29.7 
 
 		 404 aa  89.7  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4966  ribonuclease BN  30.71 
 
 		 448 aa  89.7  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  27.08 
 
 		 444 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1013  ribonuclease BN  28.57 
 
 		 427 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.58276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>