More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2460 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  100 
 
 		 397 aa  801    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2779  ribonuclease BN  70.48 
 
 		 453 aa  551  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00809939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0638  putative ribonuclease BN  58.97 
 
 		 449 aa  481  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00048226  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  56.91 
 
 		 417 aa  403  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  51.99 
 
 		 446 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  51.41 
 
 		 446 aa  381  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1979  hypothetical protein  48.75 
 
 		 479 aa  341  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3064  ribonuclease BN, putative  40.4 
 
 		 473 aa  275  9e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00183316  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2112  ribonuclease BN  42.38 
 
 		 425 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181145  normal  0.117227 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0764  ribonuclease BN  37.5 
 
 		 452 aa  265  8.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1819  putative ribonuclease BN  36.73 
 
 		 442 aa  260  4e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.193645 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2681  ribonuclease BN  35.9 
 
 		 561 aa  235  8e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.267088 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  34.01 
 
 		 450 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3053  putative ribonuclease BN  36.83 
 
 		 451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4086  putative ribonuclease BN  36.97 
 
 		 487 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1636  ribonuclease BN  34.26 
 
 		 447 aa  226  6e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0595  ribonuclease BN  37.53 
 
 		 460 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2655  ribonuclease BN  32.41 
 
 		 439 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0931  putative ribonuclease BN  34.14 
 
 		 459 aa  213  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2157  ribonuclease BN, putative  36.15 
 
 		 430 aa  208  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0711  ribonuclease BN, putative  34.73 
 
 		 422 aa  203  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0788126  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2958  ribonuclease BN  47.62 
 
 		 286 aa  202  9e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  33.09 
 
 		 499 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1514  ribonuclease BN  35.13 
 
 		 472 aa  189  7e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.258349  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0958  ribonuclease BN, putative  30.84 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.107096 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0739  putative ribonuclease BN  30.3 
 
 		 434 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0697  ribonuclease BN, putative  32.48 
 
 		 429 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47498  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0732  ribonuclease BN  29.78 
 
 		 424 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0733  ribonuclease BN  31.46 
 
 		 439 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0732  ribonuclease BN  31.71 
 
 		 439 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  32.34 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  30.47 
 
 		 337 aa  139  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  31.72 
 
 		 451 aa  139  7e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  33.09 
 
 		 295 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  32.53 
 
 		 337 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  31.16 
 
 		 443 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  32.73 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 340 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  34.11 
 
 		 320 aa  136  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  32.18 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0818  ribonuclease BN  24.8 
 
 		 405 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  34.25 
 
 		 285 aa  133  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  30.94 
 
 		 442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3404  ribonuclease BN  37.9 
 
 		 303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  33.72 
 
 		 323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  33.72 
 
 		 323 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  30.26 
 
 		 294 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  33.72 
 
 		 323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  30.11 
 
 		 439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  30.94 
 
 		 442 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  28.87 
 
 		 437 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  32.24 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  33.72 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  29.67 
 
 		 297 aa  131  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  32.67 
 
 		 298 aa  131  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  30.58 
 
 		 442 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  29.94 
 
 		 443 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0935  ribonuclease BN  27.73 
 
 		 432 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1354  ribonuclease BN  28.97 
 
 		 436 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875268  normal  0.303489 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  31.34 
 
 		 437 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  29.65 
 
 		 442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  31.34 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  31.34 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  31.34 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 313 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  31.34 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  30.6 
 
 		 437 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  29.64 
 
 		 443 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  31.56 
 
 		 405 aa  126  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  29.96 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1471  ribonuclease BN  31.58 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.604096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  33.59 
 
 		 411 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  33.2 
 
 		 411 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0756  tRNA-processing ribonuclease BN  31.34 
 
 		 436 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902171  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0406  ribonuclease BN  31.34 
 
 		 436 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  31.56 
 
 		 441 aa  123  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1670  ribonuclease BN  27.54 
 
 		 403 aa  122  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  28.57 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  29.12 
 
 		 290 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  29.12 
 
 		 290 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  29.12 
 
 		 290 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  29.12 
 
 		 290 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  29.12 
 
 		 290 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4966  ribonuclease BN  32.14 
 
 		 448 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  28.57 
 
 		 412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  28.41 
 
 		 296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  30.3 
 
 		 408 aa  119  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  32.83 
 
 		 445 aa  119  9e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0609  ribonuclease BN  29.39 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  32.66 
 
 		 292 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.384798 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03771  ribonuclease BN  28.41 
 
 		 290 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  28.41 
 
 		 290 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  28.41 
 
 		 290 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  28.41 
 
 		 290 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  28.41 
 
 		 290 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1013  ribonuclease BN  31.91 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.58276 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  28.41 
 
 		 290 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  28.41 
 
 		 290 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  28.41 
 
 		 290 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1200  putative ribonuclease BN  31.25 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.510939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>