More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1591 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  100 
 
 		 424 aa  847    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  73.42 
 
 		 307 aa  448  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  53.25 
 
 		 317 aa  335  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  54.24 
 
 		 305 aa  322  8e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  48.24 
 
 		 347 aa  293  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  46.89 
 
 		 322 aa  290  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  46.18 
 
 		 321 aa  286  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  44.63 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  45.33 
 
 		 324 aa  258  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  43.2 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  41.92 
 
 		 299 aa  234  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  40.79 
 
 		 360 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  41.16 
 
 		 299 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  34.72 
 
 		 323 aa  213  4.9999999999999996e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  38.36 
 
 		 300 aa  209  9e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  36.67 
 
 		 370 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  35.87 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  38.64 
 
 		 321 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  34.8 
 
 		 304 aa  187  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  36.16 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  38.33 
 
 		 299 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  34.16 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  38.95 
 
 		 312 aa  179  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  36.99 
 
 		 427 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  38.33 
 
 		 326 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  35.74 
 
 		 311 aa  174  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  41.73 
 
 		 329 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  38.85 
 
 		 324 aa  173  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 393 aa  172  6.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  33.7 
 
 		 443 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  33.33 
 
 		 301 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  37.01 
 
 		 303 aa  166  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  31.9 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  39.1 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  39.1 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  31.54 
 
 		 310 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  30.42 
 
 		 324 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  30.77 
 
 		 436 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  31.54 
 
 		 341 aa  159  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  31.37 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  30.8 
 
 		 311 aa  156  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  31.6 
 
 		 314 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  31.6 
 
 		 314 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  31.66 
 
 		 308 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  32.31 
 
 		 411 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  30.55 
 
 		 306 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  31.36 
 
 		 306 aa  150  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  29.96 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  29.92 
 
 		 337 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  29.92 
 
 		 307 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  29.92 
 
 		 307 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  29.92 
 
 		 307 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  29.92 
 
 		 304 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  29.92 
 
 		 307 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  32.95 
 
 		 305 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  30.95 
 
 		 302 aa  139  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  31.27 
 
 		 292 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  31.23 
 
 		 302 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  31.27 
 
 		 292 aa  133  7.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  30.9 
 
 		 320 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  31.03 
 
 		 309 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  30 
 
 		 305 aa  127  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  27.85 
 
 		 314 aa  126  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  31.36 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  29.74 
 
 		 276 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  23.86 
 
 		 307 aa  120  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  30.4 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  27.61 
 
 		 294 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  30.9 
 
 		 334 aa  107  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  32.48 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  32.48 
 
 		 305 aa  105  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  27.68 
 
 		 322 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  27.68 
 
 		 322 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  28.82 
 
 		 340 aa  94.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  28.66 
 
 		 368 aa  94  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  27.11 
 
 		 306 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  27.36 
 
 		 323 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  28.16 
 
 		 323 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  28.16 
 
 		 323 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  28.15 
 
 		 337 aa  87  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  28.16 
 
 		 323 aa  86.7  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  28.43 
 
 		 337 aa  86.3  9e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  29.09 
 
 		 295 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  27.61 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  27.39 
 
 		 416 aa  84.3  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  29.12 
 
 		 298 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  27.81 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  27.83 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  27.48 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  27.09 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1979  hypothetical protein  28.08 
 
 		 479 aa  80.1  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  25.07 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  25.34 
 
 		 294 aa  79.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  28.42 
 
 		 320 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  28.36 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  28.93 
 
 		 499 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  25.83 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  25.59 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  25.59 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  27.72 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>