More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2801 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  100 
 
 		 307 aa  600  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  73.42 
 
 		 424 aa  429  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  56.04 
 
 		 317 aa  328  9e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  53.77 
 
 		 305 aa  315  6e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  51.67 
 
 		 347 aa  301  8.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  48.33 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  46.98 
 
 		 322 aa  272  6e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  48.61 
 
 		 324 aa  263  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  43.79 
 
 		 291 aa  245  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  42.09 
 
 		 306 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  42.36 
 
 		 299 aa  232  6e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  42.09 
 
 		 360 aa  221  9e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  37.68 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  38.54 
 
 		 370 aa  211  9e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  40.57 
 
 		 316 aa  209  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  41.84 
 
 		 300 aa  206  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  42.07 
 
 		 321 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  41.61 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  36.52 
 
 		 298 aa  189  5.999999999999999e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  38.94 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  35.23 
 
 		 304 aa  182  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  38.1 
 
 		 427 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  40.35 
 
 		 326 aa  179  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  36.36 
 
 		 311 aa  179  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  43.2 
 
 		 329 aa  179  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  37.13 
 
 		 321 aa  176  6e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  36.39 
 
 		 301 aa  176  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  39.02 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  41.58 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  38.99 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  36.94 
 
 		 393 aa  162  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  42.69 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 443 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  42.69 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  33.46 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  32.29 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  34.64 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  32.75 
 
 		 310 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  33.57 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  32.39 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  33.96 
 
 		 314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  33.96 
 
 		 314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  33.96 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  32.44 
 
 		 302 aa  150  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  32.09 
 
 		 436 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  34.12 
 
 		 411 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  29.57 
 
 		 306 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  31.84 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  33.58 
 
 		 305 aa  142  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  31.82 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  31.82 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  31.82 
 
 		 337 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  31.82 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  31.82 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  31.35 
 
 		 320 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  31.82 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  34.47 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  35 
 
 		 292 aa  135  7.000000000000001e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  30.94 
 
 		 314 aa  132  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  32.97 
 
 		 302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  33.11 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  27.4 
 
 		 307 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  33.93 
 
 		 321 aa  126  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  30.48 
 
 		 276 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  33.82 
 
 		 305 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  30.36 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  33.46 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  31.84 
 
 		 334 aa  113  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  30.47 
 
 		 294 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  32.36 
 
 		 368 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  29.71 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  29.71 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  29.14 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  29.01 
 
 		 320 aa  89.4  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  27.13 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  28.1 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  30.04 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  27.64 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  27.64 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  26.94 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  27.64 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  27.74 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  28.1 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  27.74 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  27.88 
 
 		 408 aa  79  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  26.5 
 
 		 450 aa  79  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  26.94 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  30.95 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  27.41 
 
 		 499 aa  78.2  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  28.62 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  29.32 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  27.68 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  27.24 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  27.41 
 
 		 411 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  27.41 
 
 		 411 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0901  tRNA-processing RNAse BN  24.83 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562692  decreased coverage  0.000000115397 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  29.24 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  25.61 
 
 		 446 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>