132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4870 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  100 
 
 		 346 aa  687    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  76.59 
 
 		 347 aa  495  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  67.2 
 
 		 339 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  67.2 
 
 		 339 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  69.55 
 
 		 343 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13368  integral membrane protein  58.33 
 
 		 289 aa  293  3e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  48.68 
 
 		 332 aa  289  5.0000000000000004e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  44.7 
 
 		 377 aa  258  9e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  41.45 
 
 		 339 aa  242  7.999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  41.33 
 
 		 366 aa  238  8e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  37.18 
 
 		 337 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  37.18 
 
 		 337 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  37.18 
 
 		 337 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  37.18 
 
 		 337 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  37.18 
 
 		 337 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  37.18 
 
 		 337 aa  189  7e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  37.18 
 
 		 337 aa  189  8e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  37.18 
 
 		 337 aa  189  8e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  37.18 
 
 		 337 aa  189  8e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  34.98 
 
 		 341 aa  183  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  34.93 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  34.16 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  34.59 
 
 		 366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  34.35 
 
 		 338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  34.04 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  33.12 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  35.19 
 
 		 339 aa  171  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3802  putative ribonuclease  35.02 
 
 		 342 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3815  putative ribonuclease  35.02 
 
 		 342 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3880  putative ribonuclease  35.02 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3924  putative ribonuclease  35.02 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3983  putative ribonuclease  35.02 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344715 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  32.75 
 
 		 332 aa  159  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  34.56 
 
 		 328 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  32.08 
 
 		 341 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  31.83 
 
 		 374 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  30.55 
 
 		 311 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4405  ribonuclease BN  33.57 
 
 		 343 aa  109  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  28.78 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  30.07 
 
 		 390 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  30.04 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0898  ribonuclease BN  27.37 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0551761 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  31 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  24.41 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5550  membrane protein-like protein  29.85 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14240  predicted membrane protein  25.27 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00629012  normal  0.0181744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  27.21 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0743  ribonuclease BN  29.79 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183226  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1198  ribonuclease BN  26.16 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000216425 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2955  ribonuclease BN  25.99 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00451533  decreased coverage  0.000148448 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3967  ribonuclease BN  24.88 
 
 		 357 aa  62  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.565971 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0799  ribonuclease BN  30.15 
 
 		 367 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  22.87 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  23.05 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  25.24 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0352  ribonuclease BN  28.04 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.062974  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0362  ribonuclease BN  28.04 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0341  ribonuclease BN  28.04 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  25.36 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  24.15 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  22.69 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  24.48 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  24.48 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1124  ribonuclease BN  27.78 
 
 		 329 aa  57  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02750  YihY family protein  30.73 
 
 		 360 aa  57  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1819  putative ribonuclease BN  21.09 
 
 		 442 aa  53.9  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.193645 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  25.74 
 
 		 308 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25840  predicted membrane protein  24.78 
 
 		 375 aa  53.5  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  23.84 
 
 		 374 aa  53.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  25.37 
 
 		 314 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  25.37 
 
 		 314 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1997  ribonuclease BN  24.85 
 
 		 350 aa  53.5  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  30.84 
 
 		 300 aa  53.1  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  23.03 
 
 		 417 aa  52.8  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  23.89 
 
 		 306 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  24.71 
 
 		 300 aa  52.8  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  24.58 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  24.91 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  27.17 
 
 		 386 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  24.58 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  22.91 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  24.91 
 
 		 307 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  27.57 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  24.58 
 
 		 304 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  24.91 
 
 		 307 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0817  ribonuclease BN  27.32 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1012  ribonuclease BN  24.83 
 
 		 344 aa  50.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  27.9 
 
 		 546 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  27.72 
 
 		 298 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  21.56 
 
 		 304 aa  50.8  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2112  ribonuclease BN  23.7 
 
 		 425 aa  50.4  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181145  normal  0.117227 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0143  hypothetical protein  24.32 
 
 		 266 aa  49.7  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23892  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2672  ribonuclease BN  30.94 
 
 		 266 aa  49.7  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.324554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  24.55 
 
 		 325 aa  49.7  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  26.19 
 
 		 397 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1463  serum resistance locus BrkB-like protein  23.93 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  24.57 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01651  serum resistance locus BrkB-like protein  23.93 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.596268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  22.61 
 
 		 307 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  22.59 
 
 		 424 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>