87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0671 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  100 
 
 		 315 aa  600  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  61.43 
 
 		 311 aa  315  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  49.46 
 
 		 374 aa  215  9e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  50.36 
 
 		 411 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  41.08 
 
 		 341 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  45.85 
 
 		 390 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  33.11 
 
 		 332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  31.05 
 
 		 339 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  31.05 
 
 		 339 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  30.5 
 
 		 377 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  29.08 
 
 		 346 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  30.54 
 
 		 347 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  32.01 
 
 		 343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  33.81 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  34.08 
 
 		 366 aa  116  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  28.72 
 
 		 361 aa  115  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  28.72 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  28.78 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  32.65 
 
 		 361 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  28.08 
 
 		 357 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  29.15 
 
 		 332 aa  106  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  26.71 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  26.71 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  26.71 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  27.3 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  26.71 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  26.71 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  26.71 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  26.71 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  26.71 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  26.71 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  26.71 
 
 		 341 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  27.94 
 
 		 338 aa  102  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  29.23 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3924  putative ribonuclease  26.71 
 
 		 342 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3802  putative ribonuclease  26.71 
 
 		 342 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3983  putative ribonuclease  26.71 
 
 		 342 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344715 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3880  putative ribonuclease  26.71 
 
 		 342 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3815  putative ribonuclease  26.71 
 
 		 342 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13368  integral membrane protein  28.87 
 
 		 289 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25840  predicted membrane protein  28.48 
 
 		 375 aa  90.5  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14240  predicted membrane protein  31.01 
 
 		 352 aa  89.7  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00629012  normal  0.0181744 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1012  ribonuclease BN  29.9 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2955  ribonuclease BN  30.94 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00451533  decreased coverage  0.000148448 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4405  ribonuclease BN  33.45 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0898  ribonuclease BN  27.27 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0551761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5550  membrane protein-like protein  34.93 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0143  hypothetical protein  27.2 
 
 		 266 aa  75.9  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23892  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1198  ribonuclease BN  26.77 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000216425 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3967  ribonuclease BN  30.45 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.565971 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1124  ribonuclease BN  29.21 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0743  ribonuclease BN  31.86 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183226  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1997  ribonuclease BN  24.36 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  25.27 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0799  ribonuclease BN  35.02 
 
 		 367 aa  65.9  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  25.25 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  29.95 
 
 		 546 aa  62.4  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0341  ribonuclease BN  29.56 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0362  ribonuclease BN  29.56 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0352  ribonuclease BN  29.56 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.062974  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  27.44 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1654  ribonuclease BN  30.15 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00658785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5288  ribonuclease BN  29.33 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.795849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0817  ribonuclease BN  28.62 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3429  ribonuclease BN  26.59 
 
 		 320 aa  53.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  27.57 
 
 		 349 aa  52.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1463  serum resistance locus BrkB-like protein  26.62 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0764  ribonuclease BN  28.51 
 
 		 452 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01651  serum resistance locus BrkB-like protein  26.62 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.596268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4184  ribonuclease BN, putative  26.09 
 
 		 269 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.422861  normal  0.416212 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  22.96 
 
 		 306 aa  46.2  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  28.47 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0693  ribonuclease BN  25.66 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  27.74 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  27.87 
 
 		 330 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0711  ribonuclease BN, putative  27.31 
 
 		 422 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0788126  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  25.66 
 
 		 499 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2112  ribonuclease BN  28.34 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181145  normal  0.117227 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01081  serum resistance locus BrkB-like protein  24.43 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  21.38 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  25.36 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2655  ribonuclease BN  28.04 
 
 		 439 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  26.39 
 
 		 446 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  22.68 
 
 		 322 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  22.68 
 
 		 322 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  27.72 
 
 		 444 aa  42.7  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4086  putative ribonuclease BN  29.8 
 
 		 487 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.331874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>