100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4405 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4405  ribonuclease BN  100 
 
 		 343 aa  660    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  34.7 
 
 		 339 aa  159  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  33.22 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  35.34 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  32.34 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  32.34 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  34.12 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  34.92 
 
 		 366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  36.18 
 
 		 374 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  30.77 
 
 		 343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  30.85 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  28.19 
 
 		 338 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  28.49 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  29.59 
 
 		 366 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  27.49 
 
 		 377 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  29.59 
 
 		 361 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  32.28 
 
 		 361 aa  123  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  32.79 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  35.87 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  27.24 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  27.24 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  27.53 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  27.53 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  27.53 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  27.53 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  27.53 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  27.53 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  27.53 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  27.53 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  27.53 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  34.75 
 
 		 311 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  29.66 
 
 		 357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  30.94 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  27.4 
 
 		 332 aa  110  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3802  putative ribonuclease  26.37 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3983  putative ribonuclease  26.55 
 
 		 342 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344715 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3815  putative ribonuclease  26.55 
 
 		 342 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3924  putative ribonuclease  26.55 
 
 		 342 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3880  putative ribonuclease  26.55 
 
 		 342 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13368  integral membrane protein  28.52 
 
 		 289 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5550  membrane protein-like protein  35.09 
 
 		 302 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  32.65 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14240  predicted membrane protein  28.26 
 
 		 352 aa  87  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00629012  normal  0.0181744 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1012  ribonuclease BN  30.75 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0898  ribonuclease BN  27.56 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0551761 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2955  ribonuclease BN  26.99 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00451533  decreased coverage  0.000148448 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0143  hypothetical protein  28.95 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23892  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0799  ribonuclease BN  26.69 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  25.28 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  22.97 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  22.97 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25840  predicted membrane protein  26.77 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3967  ribonuclease BN  25.5 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.565971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0352  ribonuclease BN  25.93 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.062974  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0341  ribonuclease BN  25.93 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0362  ribonuclease BN  25.93 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  24.46 
 
 		 306 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  23.29 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2769  putative ribonuclease BN  26.25 
 
 		 404 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  27.36 
 
 		 349 aa  53.9  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  27.66 
 
 		 321 aa  53.5  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0743  ribonuclease BN  24.72 
 
 		 307 aa  53.5  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183226  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  28.62 
 
 		 416 aa  52.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0817  ribonuclease BN  24.2 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1198  ribonuclease BN  26.12 
 
 		 324 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000216425 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  26.07 
 
 		 300 aa  50.4  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1457  ribonuclease BN  28.08 
 
 		 484 aa  50.1  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1670  ribonuclease BN  27.4 
 
 		 403 aa  49.7  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  25.52 
 
 		 316 aa  49.7  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  25.56 
 
 		 304 aa  49.7  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  26.23 
 
 		 411 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3429  ribonuclease BN  26.89 
 
 		 320 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  26.23 
 
 		 411 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0702  ribonuclease BN  27.48 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  27.57 
 
 		 408 aa  47.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  25.35 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1997  ribonuclease BN  27.88 
 
 		 350 aa  47.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  31.09 
 
 		 445 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  25.58 
 
 		 405 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  21.4 
 
 		 321 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0609  ribonuclease BN  23.55 
 
 		 303 aa  47  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1124  ribonuclease BN  23.38 
 
 		 329 aa  47  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  26.62 
 
 		 397 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  26.62 
 
 		 397 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  24.64 
 
 		 294 aa  46.6  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  22.7 
 
 		 307 aa  46.2  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1830  ribonuclease BN, putative  27.4 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0291213 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  22.19 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  28.27 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  24.47 
 
 		 427 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01651  serum resistance locus BrkB-like protein  20.2 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.596268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3053  putative ribonuclease BN  26.45 
 
 		 451 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1463  serum resistance locus BrkB-like protein  20.2 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0764  ribonuclease BN  25.36 
 
 		 452 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  21.45 
 
 		 538 aa  44.3  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2655  ribonuclease BN  26.42 
 
 		 439 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  21.83 
 
 		 291 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0363  serum resistance locus BrkB-like  24.92 
 
 		 332 aa  43.5  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  21.26 
 
 		 306 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3954  ribonuclease BN  22.92 
 
 		 300 aa  42.7  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>