114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6469 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  100 
 
 		 339 aa  659    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  54.9 
 
 		 366 aa  339  5e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  43.32 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  43.32 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  41.45 
 
 		 346 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  41.46 
 
 		 343 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  43.23 
 
 		 347 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  38.7 
 
 		 377 aa  237  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  38.11 
 
 		 332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  41.9 
 
 		 361 aa  209  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  37.9 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  38.1 
 
 		 338 aa  207  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  39.44 
 
 		 361 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  39.08 
 
 		 366 aa  203  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  38.38 
 
 		 357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  37.02 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13368  integral membrane protein  38.99 
 
 		 289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  36.62 
 
 		 339 aa  192  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  36.33 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  36.33 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  36.33 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  36.33 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  36.33 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  36.33 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  36.33 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  36.33 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  37.16 
 
 		 332 aa  192  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  36.33 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  39.31 
 
 		 328 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3880  putative ribonuclease  35.29 
 
 		 342 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3924  putative ribonuclease  35.29 
 
 		 342 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3802  putative ribonuclease  35.29 
 
 		 342 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3983  putative ribonuclease  35.29 
 
 		 342 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344715 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3815  putative ribonuclease  35.29 
 
 		 342 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  33.13 
 
 		 341 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  33.22 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  36.11 
 
 		 374 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  34.3 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  33.45 
 
 		 390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4405  ribonuclease BN  34.78 
 
 		 343 aa  105  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  33.81 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5550  membrane protein-like protein  32.76 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0898  ribonuclease BN  28.62 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0551761 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14240  predicted membrane protein  28.07 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00629012  normal  0.0181744 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1198  ribonuclease BN  27.46 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000216425 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  27.24 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  29.56 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  27.74 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3967  ribonuclease BN  25.97 
 
 		 357 aa  69.3  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.565971 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1124  ribonuclease BN  28.98 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  26.69 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  27.63 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  28.16 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  27.61 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  25.71 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0799  ribonuclease BN  27.69 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  25.9 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  26.21 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0352  ribonuclease BN  25.18 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.062974  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0362  ribonuclease BN  25.18 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1012  ribonuclease BN  28.29 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0341  ribonuclease BN  25.18 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0743  ribonuclease BN  26.85 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183226  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1997  ribonuclease BN  28.82 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3954  ribonuclease BN  25.3 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  27.56 
 
 		 447 aa  56.2  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  22.92 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  25.66 
 
 		 546 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  24.44 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  27.09 
 
 		 393 aa  53.5  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25840  predicted membrane protein  25.49 
 
 		 375 aa  53.9  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  25.58 
 
 		 427 aa  53.1  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  30.89 
 
 		 401 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1519  ribonuclease BN  24.41 
 
 		 424 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  27.24 
 
 		 321 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  33.94 
 
 		 499 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  24.14 
 
 		 538 aa  49.7  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02750  YihY family protein  28.46 
 
 		 360 aa  50.1  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  30.46 
 
 		 331 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  25.71 
 
 		 303 aa  49.7  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0702  ribonuclease BN  25.95 
 
 		 322 aa  49.7  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  28.57 
 
 		 347 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  23.81 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  34.52 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2955  ribonuclease BN  24.33 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00451533  decreased coverage  0.000148448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  25.86 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  26.59 
 
 		 370 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  26.21 
 
 		 298 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  26.1 
 
 		 299 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  24.67 
 
 		 294 aa  46.6  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0817  ribonuclease BN  26.55 
 
 		 315 aa  46.6  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  25.17 
 
 		 312 aa  46.6  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  23.69 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  23.89 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  27.85 
 
 		 445 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  24.39 
 
 		 437 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  24.39 
 
 		 437 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  25.2 
 
 		 437 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  34.74 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0693  ribonuclease BN  23.01 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>