101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1240 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  100 
 
 		 343 aa  674    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  76.33 
 
 		 339 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  76.33 
 
 		 339 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  67.85 
 
 		 346 aa  457  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  71.29 
 
 		 347 aa  424  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13368  integral membrane protein  61.23 
 
 		 289 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  46.03 
 
 		 332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  41.61 
 
 		 377 aa  260  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  41.62 
 
 		 339 aa  253  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  42.9 
 
 		 366 aa  253  5.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  36.77 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  36.77 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  36.77 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  36.77 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  36.77 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  37.1 
 
 		 337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  36.77 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  36.77 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  36.77 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  35.69 
 
 		 341 aa  176  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  35.79 
 
 		 361 aa  176  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  35.44 
 
 		 366 aa  176  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  35.22 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  35.44 
 
 		 357 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  36.93 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  35.4 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3880  putative ribonuclease  36.4 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3924  putative ribonuclease  36.4 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3802  putative ribonuclease  36.4 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3815  putative ribonuclease  36.4 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3983  putative ribonuclease  36.4 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344715 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  33.55 
 
 		 332 aa  162  9e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  35.29 
 
 		 328 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  29.77 
 
 		 361 aa  142  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  32.17 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  30.96 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  30.36 
 
 		 374 aa  102  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4405  ribonuclease BN  31.54 
 
 		 343 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  30.1 
 
 		 390 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  28.83 
 
 		 411 aa  96.3  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0898  ribonuclease BN  28.67 
 
 		 307 aa  92.8  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0551761 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  32.06 
 
 		 315 aa  90.1  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  24.33 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0743  ribonuclease BN  28.43 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183226  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  30.62 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5550  membrane protein-like protein  28.72 
 
 		 302 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0799  ribonuclease BN  25.83 
 
 		 367 aa  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  23.83 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  27.27 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0143  hypothetical protein  24.44 
 
 		 266 aa  58.9  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23892  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3429  ribonuclease BN  26.18 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  25.4 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3967  ribonuclease BN  22.9 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.565971 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  21.84 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0693  ribonuclease BN  26.52 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0352  ribonuclease BN  28.21 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.062974  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0362  ribonuclease BN  28.21 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0341  ribonuclease BN  28.21 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  21.43 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  23.31 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1124  ribonuclease BN  27.14 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  24.7 
 
 		 450 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02750  YihY family protein  27.78 
 
 		 360 aa  55.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1997  ribonuclease BN  23.08 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  24.01 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2955  ribonuclease BN  24.93 
 
 		 389 aa  54.3  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00451533  decreased coverage  0.000148448 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  25.37 
 
 		 300 aa  53.9  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  24.15 
 
 		 306 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25840  predicted membrane protein  25.24 
 
 		 375 aa  52.8  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0409  ribonuclease BN  24.12 
 
 		 278 aa  52.8  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1765  YihY family protein  24.12 
 
 		 278 aa  52.8  0.000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  24.78 
 
 		 417 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  24.28 
 
 		 316 aa  50.8  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14240  predicted membrane protein  25.26 
 
 		 352 aa  50.8  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00629012  normal  0.0181744 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  24.19 
 
 		 370 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  24.5 
 
 		 311 aa  49.7  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  22.55 
 
 		 499 aa  49.3  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  22.96 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  24.53 
 
 		 424 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1012  ribonuclease BN  25.16 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  28.65 
 
 		 445 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2672  ribonuclease BN  26.81 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.324554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  21.62 
 
 		 428 aa  47.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000260717  hitchhiker  0.000176219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0638  putative ribonuclease BN  22.22 
 
 		 449 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00048226  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1198  ribonuclease BN  23.93 
 
 		 324 aa  46.6  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000216425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  21.8 
 
 		 306 aa  46.6  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0817  ribonuclease BN  25.84 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  26.86 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1862  ribonuclease BN  22.83 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0591139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  23.76 
 
 		 363 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  25.17 
 
 		 401 aa  43.9  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  24.64 
 
 		 546 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  23.47 
 
 		 341 aa  43.5  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  25 
 
 		 397 aa  43.5  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  25 
 
 		 397 aa  43.1  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  24.65 
 
 		 329 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  24.65 
 
 		 329 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  21.2 
 
 		 347 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  21.48 
 
 		 397 aa  42.7  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1979  hypothetical protein  23.93 
 
 		 479 aa  42.7  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>