38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14240 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_14240  predicted membrane protein  100 
 
 		 352 aa  675    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00629012  normal  0.0181744 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2955  ribonuclease BN  41.76 
 
 		 389 aa  180  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00451533  decreased coverage  0.000148448 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25840  predicted membrane protein  36.11 
 
 		 375 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200788  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1012  ribonuclease BN  38.73 
 
 		 344 aa  136  7.000000000000001e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0817  ribonuclease BN  34.07 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1198  ribonuclease BN  29.32 
 
 		 324 aa  96.7  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000216425 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0986  ribonuclease BN  32.75 
 
 		 288 aa  92.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  33.83 
 
 		 374 aa  89.7  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1124  ribonuclease BN  27.57 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  30.48 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3967  ribonuclease BN  31.17 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.565971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  25.65 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  27.54 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  28.99 
 
 		 339 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  30.4 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  25.27 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0143  hypothetical protein  26.69 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23892  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  28.57 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  26.07 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  31.05 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  23.67 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  23.67 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  23.67 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4405  ribonuclease BN  27.47 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  23.67 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  23.67 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  23.67 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  23.67 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  23.67 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  23.67 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  27.47 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  22.06 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  26.83 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  21.32 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  23.59 
 
 		 339 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  23.59 
 
 		 339 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  22.86 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  25.63 
 
 		 343 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35918 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>