169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4768 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4768  ribonuclease BN  100 
 
 
307 aa  614  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211591  normal  0.0891393 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0656  ribonuclease BN  50.66 
 
 
355 aa  276  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.173698 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0050  ribonuclease BN  46.18 
 
 
344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1292  ribonuclease BN family protein  27.24 
 
 
271 aa  87.8  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  26.56 
 
 
349 aa  86.3  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  27.02 
 
 
288 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  27.02 
 
 
288 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  25.49 
 
 
276 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  28.02 
 
 
401 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  27.94 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3250  ribonuclease BN  30.2 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4509  ribonuclease BN  31.05 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581699  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  25.6 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  25.6 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  25.6 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  25.6 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  25.6 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  25.6 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  25.6 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  25.2 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0280  ribonuclease BN  27.34 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  28.92 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4573  ribonuclease BN  31.3 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101037  hitchhiker  0.00311377 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4005  ribonuclease transmembrane protein  29.29 
 
 
298 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  25.18 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0308  putative ribonuclease BN  29.39 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.686269  normal  0.0663425 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3849  ribonuclease BN  28.52 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  23.05 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3028  putative ribonuclease BN  26.32 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2377  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  25.1 
 
 
363 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1137  ribonuclease BN-like family transmembrane protein  28.9 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  27.7 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  25.68 
 
 
367 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  26.25 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  26.78 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  23.59 
 
 
320 aa  72.8  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  24.71 
 
 
377 aa  72.4  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3556  ribonuclease BN  29.2 
 
 
307 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176466  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  25.94 
 
 
317 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0750  ribonuclease BN  28.08 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  25.36 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  22.05 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  28.36 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  25.36 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0504  ribonuclease BN  25.45 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0979638  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  21.67 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0529  YihY family protein  25 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  27.27 
 
 
371 aa  69.3  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4883  ribonuclease BN  27.86 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178095  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  26.15 
 
 
374 aa  68.9  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3484  ribonuclease BN  27 
 
 
297 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  23.18 
 
 
386 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  23.57 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  23.57 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  23.57 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  23.47 
 
 
396 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  24.64 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  27.35 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  29.07 
 
 
377 aa  66.2  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0701  ribonuclease BN-like family protein  23.84 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5235  ribonuclease BN  26.3 
 
 
297 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.192166  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  24.15 
 
 
330 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  29.04 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  24.38 
 
 
316 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0927  ribonuclease BN  28.19 
 
 
297 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  25.81 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2527  putative ribonuclease BN  26.09 
 
 
290 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.322273 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2188  ribonuclease BN  30.98 
 
 
317 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.811945  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  22.85 
 
 
347 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0816  ribonuclease BN  26.25 
 
 
297 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.941783  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  24.21 
 
 
331 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  30.61 
 
 
338 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  24.26 
 
 
277 aa  62.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3833  ribonuclease BN  24.91 
 
 
310 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  25.36 
 
 
367 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  21.94 
 
 
392 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  27.04 
 
 
323 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  26.61 
 
 
321 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  25.77 
 
 
316 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  24.11 
 
 
356 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  20.43 
 
 
317 aa  60.8  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  25.2 
 
 
445 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  23.88 
 
 
316 aa  60.1  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  26.77 
 
 
348 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1978  ribonuclease BN, putative  24.62 
 
 
286 aa  60.1  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1903  YihY family protein  24.62 
 
 
286 aa  60.1  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1252  ribonuclease BN  22.46 
 
 
324 aa  59.7  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1004  putative ribonuclease BN  25.18 
 
 
288 aa  59.7  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  25.5 
 
 
351 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  24.36 
 
 
384 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  22.67 
 
 
277 aa  59.3  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1180  ribonuclease BN, putative  25.8 
 
 
288 aa  58.5  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.012264  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  28.98 
 
 
338 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  28.98 
 
 
338 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  23.59 
 
 
334 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3558  ribonuclease BN, putative  24.03 
 
 
325 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  23.9 
 
 
351 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3487  putative ribonuclease BN  22.41 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  26.77 
 
 
283 aa  58.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  24.18 
 
 
414 aa  57.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.460306 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>