More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1576 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1576  ribonuclease BN-like family protein  100 
 
 
282 aa  541  1e-153  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1381  putative ribonuclease BN  33.98 
 
 
296 aa  160  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.528846  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0701  ribonuclease BN-like family protein  32.99 
 
 
307 aa  149  7e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  29.43 
 
 
277 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  28.32 
 
 
289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  29.76 
 
 
289 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  28.91 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  29.18 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0632  ribonuclease BN-like family protein  29.28 
 
 
301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  29.18 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  28.02 
 
 
289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  28.02 
 
 
289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  28.02 
 
 
289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  28.02 
 
 
289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  28.02 
 
 
289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  28.02 
 
 
289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  27.44 
 
 
276 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  27.37 
 
 
316 aa  98.2  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  27.11 
 
 
316 aa  97.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0495  ribonuclease BN-like family protein  28.15 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.582599  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  28.29 
 
 
277 aa  92.4  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  28.98 
 
 
392 aa  89  8e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  25.19 
 
 
359 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0847  ribonuclease BN, putative  24.54 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1515  ribonuclease BN-like family protein  24.01 
 
 
314 aa  84  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  26.42 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  25.61 
 
 
283 aa  79  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  26.69 
 
 
336 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  27.99 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  23.68 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  28.85 
 
 
414 aa  77  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  24.47 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19220  predicted membrane protein  26.6 
 
 
463 aa  76.6  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.234203  normal  0.518782 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  26.05 
 
 
350 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  26.05 
 
 
350 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  26.05 
 
 
350 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  24.36 
 
 
374 aa  75.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  25.46 
 
 
338 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  27.76 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  24.54 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  24.54 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  25 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  26.04 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  24.44 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  26.52 
 
 
340 aa  72  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1937  putative ribonuclease BN  31.19 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.666523  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1971  putative ribonuclease BN  31.19 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.493707  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3478  ribonuclease BN  22.61 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1616  ribonuclease BN  26.14 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119172  normal  0.116701 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  25.09 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  29.18 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5922  ribonuclease BN  26.14 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  0.574915 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  28.72 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  25.19 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  24.82 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3404  ribonuclease BN  26.54 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2678  ribonuclease BN  27.5 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00324748  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  22.87 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  22.52 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  25.77 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  25.38 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  23.55 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  24.15 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  24.15 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  25.77 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  24.15 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  24.15 
 
 
323 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  23.7 
 
 
316 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20430  predicted membrane protein  25.68 
 
 
388 aa  67  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0112406  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5841  ribonuclease BN  24.44 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  25.29 
 
 
337 aa  67  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  27.43 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  24.15 
 
 
377 aa  65.9  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  25.89 
 
 
360 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  23.95 
 
 
320 aa  65.1  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  23.29 
 
 
323 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  23.5 
 
 
321 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  28.74 
 
 
330 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  25.09 
 
 
313 aa  64.3  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  27.63 
 
 
322 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  29.61 
 
 
318 aa  63.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  25.77 
 
 
320 aa  63.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  25.17 
 
 
322 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  25.17 
 
 
322 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  22.83 
 
 
318 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  25.23 
 
 
319 aa  63.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  25.36 
 
 
397 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  25.98 
 
 
396 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  22.83 
 
 
319 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  25.36 
 
 
397 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1249  ribonuclease BN  24.71 
 
 
360 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00563624  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  21.92 
 
 
289 aa  62.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  24.91 
 
 
294 aa  62.8  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0750  ribonuclease BN  23.81 
 
 
297 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2446  ribonuclease BN  24.9 
 
 
263 aa  61.6  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.805614  hitchhiker  0.00565169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  22.37 
 
 
318 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  26.41 
 
 
306 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  25.27 
 
 
313 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  28.06 
 
 
388 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  25.85 
 
 
291 aa  60.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>