174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0258 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  100 
 
 
331 aa  652    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  67.93 
 
 
334 aa  342  7e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  67.01 
 
 
305 aa  317  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  67.93 
 
 
305 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  57.57 
 
 
309 aa  299  5e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  57.28 
 
 
321 aa  298  6e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  31 
 
 
321 aa  159  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  33.88 
 
 
299 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  35.21 
 
 
311 aa  158  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  33.56 
 
 
291 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  33.82 
 
 
360 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  33.66 
 
 
306 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  35.25 
 
 
300 aa  142  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  30.88 
 
 
317 aa  142  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  36.5 
 
 
324 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  34.3 
 
 
304 aa  138  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  34.49 
 
 
310 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  33.79 
 
 
337 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  35.11 
 
 
314 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  34.49 
 
 
310 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  35.11 
 
 
314 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  33.78 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  35.8 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  30.15 
 
 
424 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  34.73 
 
 
311 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  36.25 
 
 
307 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  36.25 
 
 
307 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  36.25 
 
 
304 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  36.25 
 
 
307 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  30.36 
 
 
307 aa  132  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  30.66 
 
 
321 aa  132  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  36.11 
 
 
307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  29.58 
 
 
305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  32.9 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  32.26 
 
 
347 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  31.54 
 
 
443 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  33.22 
 
 
436 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  35.32 
 
 
411 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  32.79 
 
 
341 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  30.1 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  30.94 
 
 
329 aa  126  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  30.72 
 
 
312 aa  125  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  29.89 
 
 
322 aa  123  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  32.51 
 
 
329 aa  123  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  33.71 
 
 
299 aa  122  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  32.51 
 
 
329 aa  123  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  31.49 
 
 
427 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  33.1 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  31.89 
 
 
298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  31.4 
 
 
311 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  32.61 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  25.18 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  32.37 
 
 
326 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  30.77 
 
 
301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  33.73 
 
 
299 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  36.26 
 
 
306 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  31.99 
 
 
314 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  33.19 
 
 
292 aa  107  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  27.1 
 
 
323 aa  107  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  31.32 
 
 
305 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  30.43 
 
 
370 aa  106  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  33.19 
 
 
292 aa  106  7e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  25.08 
 
 
306 aa  105  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  32.18 
 
 
320 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  29.72 
 
 
393 aa  102  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  33.82 
 
 
303 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  26.84 
 
 
276 aa  97.4  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  30.89 
 
 
305 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  28.11 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  25.17 
 
 
320 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1463  serum resistance locus BrkB-like protein  25.81 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01651  serum resistance locus BrkB-like protein  25.81 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.596268  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  25.95 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  22.9 
 
 
307 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2623  putative ribonuclease BN  27.84 
 
 
278 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  25.18 
 
 
499 aa  63.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01081  serum resistance locus BrkB-like protein  25.54 
 
 
313 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  27.14 
 
 
341 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  25.09 
 
 
392 aa  59.3  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  24.55 
 
 
306 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  26.86 
 
 
368 aa  56.6  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  23.81 
 
 
386 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  26.22 
 
 
367 aa  55.8  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  22.48 
 
 
374 aa  55.8  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  23.43 
 
 
397 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  24.07 
 
 
328 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  23.43 
 
 
397 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0099  serum resistance locus BrkB-like protein  23.72 
 
 
306 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0625929  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  23.8 
 
 
375 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  24.64 
 
 
371 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  22.26 
 
 
322 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  22.26 
 
 
322 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02291  serum resistance locus BrkB-like protein  28.95 
 
 
314 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  22.78 
 
 
332 aa  52.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01101  serum resistance locus BrkB-like protein  23.72 
 
 
304 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  22.88 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1457  ribonuclease BN  25 
 
 
484 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  27.76 
 
 
296 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1184  ribonuclease BN  25.64 
 
 
278 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01071  serum resistance locus BrkB-like protein  21.15 
 
 
314 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.48623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>