158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0692 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0692  ribonuclease BN  100 
 
 		 266 aa  514  1.0000000000000001e-145  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.139852  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0327  ribonuclease BN  66.27 
 
 		 274 aa  331  8e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0769545  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1329  putative molybdopterin biosynthesis protein  63.24 
 
 		 273 aa  293  2e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1593  ribonuclease BN  51.92 
 
 		 273 aa  248  6e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.949461  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1217  tRNA-processing ribonuclease BN  52.77 
 
 		 270 aa  231  6e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.130001  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1346  ribonuclease BN  52.5 
 
 		 268 aa  229  4e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1225  YihY family protein  52.5 
 
 		 268 aa  229  4e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.308333  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0518  YihY family protein  52.08 
 
 		 276 aa  228  8e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0775636  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0373  ribonuclease BN  41.83 
 
 		 277 aa  195  5.000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  26.82 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  33.47 
 
 		 538 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1664  ribonuclease BN  29.37 
 
 		 443 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0666088  hitchhiker  0.00703858 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1994  ribonuclease BN  28.97 
 
 		 443 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.20518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  33.88 
 
 		 525 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  33.88 
 
 		 525 aa  115  7.999999999999999e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  26.24 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  27.03 
 
 		 323 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  27.03 
 
 		 323 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  27.03 
 
 		 323 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  27.03 
 
 		 323 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03771  ribonuclease BN  26.64 
 
 		 290 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  26.64 
 
 		 290 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  26.64 
 
 		 290 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  26.64 
 
 		 290 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  26.64 
 
 		 290 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  26.64 
 
 		 290 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  26.64 
 
 		 290 aa  112  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  26.64 
 
 		 290 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  26.64 
 
 		 290 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  25.88 
 
 		 451 aa  112  9e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  28.98 
 
 		 445 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  29.73 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1471  ribonuclease BN  27.27 
 
 		 422 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.604096 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  26.25 
 
 		 337 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  26.25 
 
 		 337 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  26.25 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  25.98 
 
 		 447 aa  108  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3954  ribonuclease BN  28.75 
 
 		 300 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  26.25 
 
 		 337 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  27.1 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  26.04 
 
 		 290 aa  107  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  28.02 
 
 		 441 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  25.87 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  25.87 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  25.87 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  25.87 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  25.87 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0034  ribonuclease BN  26.15 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  28.52 
 
 		 442 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  28.52 
 
 		 442 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4186  ribonuclease BN  26.15 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0030  ribonuclease BN  26.15 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  27.65 
 
 		 439 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  29.8 
 
 		 442 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  25.87 
 
 		 298 aa  105  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  27.06 
 
 		 437 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  27.06 
 
 		 437 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  27.06 
 
 		 437 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  27.06 
 
 		 437 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  27.06 
 
 		 437 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0693  ribonuclease BN  27.13 
 
 		 288 aa  105  9e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  28.85 
 
 		 443 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0739  putative ribonuclease BN  28.52 
 
 		 434 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  28.85 
 
 		 443 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  28.85 
 
 		 443 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0406  ribonuclease BN  27.34 
 
 		 436 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0756  tRNA-processing ribonuclease BN  27.34 
 
 		 436 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902171  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  28.09 
 
 		 412 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  25.98 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  29.02 
 
 		 442 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  28.09 
 
 		 412 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  26.25 
 
 		 292 aa  102  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  26.67 
 
 		 437 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  25.1 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  26.82 
 
 		 437 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  27.13 
 
 		 444 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0418  ribonuclease BN  26.25 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  25.38 
 
 		 499 aa  99.8  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1354  ribonuclease BN  27.67 
 
 		 436 aa  99.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875268  normal  0.303489 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  25.87 
 
 		 313 aa  99.8  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  28.57 
 
 		 405 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0733  ribonuclease BN  26.74 
 
 		 439 aa  99  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0732  ribonuclease BN  26.74 
 
 		 439 aa  99  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0697  ribonuclease BN, putative  26.36 
 
 		 429 aa  99  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47498  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0452  ribonuclease BN, putative  27.1 
 
 		 426 aa  97.8  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  26.67 
 
 		 310 aa  96.3  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0935  ribonuclease BN  25.51 
 
 		 432 aa  95.1  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1623  ribonuclease BN  27.89 
 
 		 428 aa  95.1  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.722239  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3404  ribonuclease BN  25.29 
 
 		 303 aa  94.7  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  26.02 
 
 		 408 aa  94  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1013  ribonuclease BN  26.17 
 
 		 427 aa  93.6  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.58276 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1979  hypothetical protein  26.02 
 
 		 479 aa  93.6  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  24.31 
 
 		 397 aa  92.8  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  26.4 
 
 		 411 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1323  ribonuclease BN  27.64 
 
 		 427 aa  92  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2779  ribonuclease BN  28.85 
 
 		 453 aa  92  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00809939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  26.4 
 
 		 411 aa  92  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  25.83 
 
 		 297 aa  90.5  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0638  putative ribonuclease BN  24.71 
 
 		 449 aa  89.7  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00048226  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1670  ribonuclease BN  26.09 
 
 		 403 aa  89  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>