281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0535 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0535  putative ribonuclease BN  100 
 
 		 329 aa  649    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3981  ribonuclease BN, putative  49.49 
 
 		 301 aa  285  9e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1606  putative ribonuclease BN  46.8 
 
 		 311 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.945482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1764  ribonuclease BN  47.39 
 
 		 313 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3591  ribonuclease BN  46.4 
 
 		 311 aa  259  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.595872 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2719  ribonuclease BN  51.06 
 
 		 294 aa  258  8e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3095  ribonuclease BN, putative  47.84 
 
 		 302 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1313  ribonuclease BN  47.87 
 
 		 300 aa  249  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0115904  normal  0.255561 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5294  ribonuclease BN  47.84 
 
 		 300 aa  229  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2419  ribonuclease BN, putative  45.58 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0234  ribonuclease BN  42.86 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2400  hypothetical protein  72.46 
 
 		 80 aa  106  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  25.87 
 
 		 405 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2779  ribonuclease BN  26.04 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00809939  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0958  ribonuclease BN, putative  27.82 
 
 		 411 aa  72.8  0.000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.107096 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  25.51 
 
 		 417 aa  72.8  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  26.81 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  23.47 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  25.31 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  25.91 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2112  ribonuclease BN  29.31 
 
 		 425 aa  69.7  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181145  normal  0.117227 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0732  ribonuclease BN  23.2 
 
 		 424 aa  69.3  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119651  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  24.91 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0609  ribonuclease BN  23.55 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1514  ribonuclease BN  26.76 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.258349  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  24.32 
 
 		 397 aa  67  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  23.81 
 
 		 386 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1457  ribonuclease BN  28.32 
 
 		 484 aa  66.6  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0638  putative ribonuclease BN  21.59 
 
 		 449 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00048226  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  23.7 
 
 		 439 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  25.86 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  23.9 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  24.54 
 
 		 446 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  25.68 
 
 		 408 aa  65.9  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  22.89 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1636  ribonuclease BN  27.51 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  22.18 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1471  ribonuclease BN  22.71 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.604096 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  25.42 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  23.79 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  23.79 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1979  hypothetical protein  25.26 
 
 		 479 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  23.79 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  22.91 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  23.79 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  22.91 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  23.49 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  22.91 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  25.46 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  22.91 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0711  ribonuclease BN, putative  34.35 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0788126  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1323  ribonuclease BN  24.31 
 
 		 427 aa  62  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  22.48 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  26.74 
 
 		 411 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  26.64 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  26.74 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3495  ribonuclease BN  27.71 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.385493 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  25.82 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  26.4 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  25.26 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0739  putative ribonuclease BN  28.91 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  36.73 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  22.57 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  23.43 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  24.65 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  22.14 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  26.74 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  36 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  24.91 
 
 		 388 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3954  ribonuclease BN  23.61 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0693  ribonuclease BN  21.89 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  22.18 
 
 		 437 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  22.18 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  23.95 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  22.18 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  22.18 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0818  ribonuclease BN  24.54 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00593  ribonuclease BN  24.82 
 
 		 314 aa  59.3  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001900  ribonuclease BN  23.1 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.886374  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  22.18 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  35.71 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  35.71 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  26.14 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  35.71 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2655  ribonuclease BN  27.65 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  23.25 
 
 		 525 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0406  ribonuclease BN  22.57 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  26.99 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  23.25 
 
 		 525 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  26.14 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0409  ribonuclease BN  27.92 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1013  ribonuclease BN  22.42 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.58276 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1765  YihY family protein  27.92 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0756  tRNA-processing ribonuclease BN  22.57 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902171  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  25.66 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  24.26 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3053  putative ribonuclease BN  26.07 
 
 		 451 aa  56.6  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  24.57 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  22.18 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  25.89 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>