254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1654 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1654  ribonuclease BN  100 
 
 		 345 aa  672    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00658785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1997  ribonuclease BN  44.71 
 
 		 350 aa  263  2e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  40.76 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5288  ribonuclease BN  43.61 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.795849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  41.79 
 
 		 294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3429  ribonuclease BN  43.27 
 
 		 320 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  40.8 
 
 		 546 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0352  ribonuclease BN  42 
 
 		 387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.062974  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0362  ribonuclease BN  42 
 
 		 387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0341  ribonuclease BN  42 
 
 		 387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  35.92 
 
 		 349 aa  186  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2292  ribonuclease BN  42.33 
 
 		 328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3865  ribonuclease BN  40.29 
 
 		 341 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.769033  normal  0.0435739 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1862  ribonuclease BN  35.82 
 
 		 351 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0591139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  27.01 
 
 		 370 aa  82.8  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  27.37 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  27.48 
 
 		 360 aa  79.3  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  29.89 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  28.93 
 
 		 306 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  24.73 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  28.89 
 
 		 300 aa  72.4  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  28.46 
 
 		 347 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  27.57 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  29.37 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  25.38 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  25.32 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  28 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  28.04 
 
 		 316 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  28.27 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  28.05 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  25.48 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  23.02 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  29.59 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  26.48 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  23.88 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  26.13 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  22.78 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  24.06 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  29.09 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  25.71 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  24.65 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  25 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  29.45 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  25.72 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  25.72 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  25.72 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  25.72 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  25.72 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  25.72 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  25.72 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  25.72 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  23.64 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  22.93 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  26.26 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  26.04 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  22.95 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  25.72 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  27.78 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  25.47 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  26.04 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  29.04 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  27.97 
 
 		 300 aa  59.3  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  25 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  24.32 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  30.31 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  25.83 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  28.67 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  23.26 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  26.07 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  26.64 
 
 		 349 aa  57  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  28.74 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  26.79 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  28.74 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  28.74 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  25 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  28.74 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  28.74 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  25.63 
 
 		 437 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  26.4 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  21.77 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  26.34 
 
 		 304 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  23.84 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0764  ribonuclease BN  25.1 
 
 		 452 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  23.84 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0958  ribonuclease BN, putative  26.55 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.107096 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0756  tRNA-processing ribonuclease BN  29.75 
 
 		 436 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902171  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  25.44 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  24.23 
 
 		 427 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  23.53 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  25.6 
 
 		 312 aa  55.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  26.05 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1514  ribonuclease BN  26.98 
 
 		 472 aa  54.7  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.258349  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  24.53 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  25.16 
 
 		 411 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  24.25 
 
 		 538 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0406  ribonuclease BN  29.75 
 
 		 436 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  25.38 
 
 		 288 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  24.73 
 
 		 311 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  26.38 
 
 		 301 aa  54.7  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  25.38 
 
 		 288 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>