138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2292 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2292  ribonuclease BN  100 
 
 
328 aa  641    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  54.97 
 
 
337 aa  346  3e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0352  ribonuclease BN  55.91 
 
 
387 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.062974  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0362  ribonuclease BN  55.91 
 
 
387 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0341  ribonuclease BN  55.91 
 
 
387 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3865  ribonuclease BN  56.65 
 
 
341 aa  296  4e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.769033  normal  0.0435739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  48.75 
 
 
349 aa  290  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1862  ribonuclease BN  47.4 
 
 
351 aa  243  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0591139  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  45.91 
 
 
546 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  42.2 
 
 
294 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1654  ribonuclease BN  43.34 
 
 
345 aa  189  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00658785  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1997  ribonuclease BN  39.02 
 
 
350 aa  186  7e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5288  ribonuclease BN  41.5 
 
 
316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.795849  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3429  ribonuclease BN  41.96 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  28.38 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  27.68 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  25.44 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  28.47 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  29.52 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  26.49 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  24.82 
 
 
343 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  28.19 
 
 
349 aa  64.3  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  25.61 
 
 
361 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  26.04 
 
 
341 aa  62.8  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  25.61 
 
 
366 aa  62.8  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  22.29 
 
 
392 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  29.43 
 
 
299 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  27.52 
 
 
374 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  30.32 
 
 
330 aa  60.1  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  26.24 
 
 
332 aa  59.7  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  26.05 
 
 
360 aa  59.3  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  25.26 
 
 
357 aa  59.3  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  22.56 
 
 
324 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  26.14 
 
 
339 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  26.64 
 
 
276 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  28 
 
 
370 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  25.29 
 
 
338 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  26.28 
 
 
499 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  26.1 
 
 
361 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  25.77 
 
 
424 aa  56.6  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  25.18 
 
 
363 aa  56.6  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  27.93 
 
 
311 aa  56.2  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  27.92 
 
 
347 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  29.26 
 
 
377 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  25.17 
 
 
341 aa  55.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  25 
 
 
339 aa  55.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  26.64 
 
 
291 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  24.15 
 
 
316 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  24.26 
 
 
339 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  24.26 
 
 
339 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  25.86 
 
 
338 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  27.59 
 
 
347 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  25.47 
 
 
311 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  25 
 
 
321 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  28.37 
 
 
301 aa  53.9  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  23.11 
 
 
377 aa  53.9  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  26.62 
 
 
328 aa  53.1  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  26.62 
 
 
306 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  25.54 
 
 
307 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  23.44 
 
 
332 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  26.98 
 
 
322 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  27.21 
 
 
322 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  24.64 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  24.64 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  24.64 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  24.64 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  24.64 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  24.64 
 
 
337 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  24.64 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  24.64 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  24.64 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  29.04 
 
 
401 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  24.35 
 
 
288 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  24.35 
 
 
288 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  27.68 
 
 
315 aa  49.7  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  27.34 
 
 
301 aa  49.7  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  27.97 
 
 
377 aa  49.7  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02750  YihY family protein  30.43 
 
 
360 aa  49.3  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  30 
 
 
331 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  24.43 
 
 
317 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  24.41 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  27.97 
 
 
390 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0732  ribonuclease BN  26.77 
 
 
439 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2359  ribonuclease BN  31.6 
 
 
437 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.389707  normal  0.121008 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  27.34 
 
 
328 aa  48.9  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3484  ribonuclease BN  26.22 
 
 
378 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  25 
 
 
299 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  28.47 
 
 
320 aa  47.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  27.86 
 
 
316 aa  47.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2446  ribonuclease BN  33.06 
 
 
263 aa  47.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.805614  hitchhiker  0.00565169 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  24.81 
 
 
384 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0733  ribonuclease BN  26.38 
 
 
439 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  23.58 
 
 
525 aa  47  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  27.27 
 
 
299 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  27.21 
 
 
334 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  31.18 
 
 
365 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  23.27 
 
 
525 aa  46.6  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  23.92 
 
 
289 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  27.34 
 
 
304 aa  46.6  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  26.56 
 
 
359 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>