258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10418 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  649    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  42.61 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  42.71 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  37.29 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  34.34 
 
 		 424 aa  212  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  41.81 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  40.07 
 
 		 305 aa  206  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  35.91 
 
 		 317 aa  206  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  38.62 
 
 		 347 aa  205  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  38.55 
 
 		 360 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  36.96 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  36.13 
 
 		 322 aa  202  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  40.07 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  39.56 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  34.81 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  35.5 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  35.15 
 
 		 370 aa  175  8e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  35 
 
 		 321 aa  173  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  32.55 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  38.4 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  40.65 
 
 		 427 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  37.13 
 
 		 301 aa  165  8e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  36.73 
 
 		 329 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  37.59 
 
 		 312 aa  164  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  36.73 
 
 		 329 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  38.77 
 
 		 329 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  35.92 
 
 		 324 aa  155  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  34.14 
 
 		 299 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  33.91 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  34.34 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  31.8 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  32.4 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  31.42 
 
 		 314 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  31.42 
 
 		 314 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  31.54 
 
 		 311 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  33.44 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  31.3 
 
 		 443 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  34.87 
 
 		 303 aa  139  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  30.08 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  29.5 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  32.56 
 
 		 325 aa  133  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  35.92 
 
 		 393 aa  132  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  31.34 
 
 		 307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  31.34 
 
 		 307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  31.34 
 
 		 337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  31.34 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  31.34 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  29.92 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  29.89 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  30.99 
 
 		 307 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  29.5 
 
 		 310 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  29.62 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  29.23 
 
 		 411 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  27.52 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  26.01 
 
 		 306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  30.42 
 
 		 305 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  28.46 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  28.46 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  26.17 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  27.24 
 
 		 276 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  28.46 
 
 		 320 aa  109  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  27.91 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  25.58 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  28.47 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  27.4 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  27.1 
 
 		 331 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  27.43 
 
 		 309 aa  93.6  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  26.37 
 
 		 305 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  26.27 
 
 		 334 aa  86.7  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  25.25 
 
 		 322 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  25.25 
 
 		 322 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  27.11 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  24.37 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0697  ribonuclease BN, putative  22.99 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47498  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  24.59 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  24.83 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0732  ribonuclease BN  22.63 
 
 		 439 aa  72.8  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1463  serum resistance locus BrkB-like protein  25.25 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0733  ribonuclease BN  22.63 
 
 		 439 aa  72.8  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01651  serum resistance locus BrkB-like protein  25.25 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.596268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  24.81 
 
 		 320 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  25.89 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  26.46 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  25.46 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  23.65 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0732  ribonuclease BN  27.86 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119651  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  24.66 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  26.67 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  23.92 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  26.06 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  24.38 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  25.37 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  25.7 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3954  ribonuclease BN  25.97 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  25.37 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  23.47 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  25.37 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  25.37 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  25.52 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01081  serum resistance locus BrkB-like protein  23.03 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>