95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0077 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  100 
 
 		 307 aa  615  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  34.27 
 
 		 306 aa  179  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  36.24 
 
 		 302 aa  166  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  28.28 
 
 		 307 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  29.45 
 
 		 321 aa  142  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  28.77 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  29.67 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  27.68 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  23.51 
 
 		 424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  29.25 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  26.62 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  27.02 
 
 		 322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  26.46 
 
 		 347 aa  128  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  26.07 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  29.18 
 
 		 312 aa  125  9e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  27.37 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  26.6 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  29.56 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  29.09 
 
 		 304 aa  112  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  25.56 
 
 		 299 aa  109  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  28.93 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  24.18 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  25.5 
 
 		 321 aa  105  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  29.07 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  26.19 
 
 		 427 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  25 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  25.99 
 
 		 329 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  25.99 
 
 		 329 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  23.17 
 
 		 311 aa  99.4  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  24.56 
 
 		 324 aa  95.9  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  25.91 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  24.83 
 
 		 370 aa  93.6  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  24.34 
 
 		 324 aa  92.8  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  25.19 
 
 		 329 aa  92.4  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  26.36 
 
 		 326 aa  89.7  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  26.8 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  25.44 
 
 		 311 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  25.57 
 
 		 314 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  25.57 
 
 		 314 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  23.88 
 
 		 341 aa  87  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  25.19 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  26.27 
 
 		 393 aa  86.3  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  23.72 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  23.72 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  28.22 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  26.79 
 
 		 443 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  24.15 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  25.2 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  24.57 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  25.22 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  25.22 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  25.39 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  25.39 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  25.39 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  25.39 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  25.39 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  24.71 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  23.55 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  25.39 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  23.44 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  24.24 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  41.25 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  21.25 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  23.77 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  22.94 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  20.34 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  23.57 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  21.9 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  22.88 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  24.23 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  21.63 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  20.61 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4184  ribonuclease BN, putative  24.1 
 
 		 269 aa  53.1  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.422861  normal  0.416212 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  22.4 
 
 		 322 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  22.4 
 
 		 322 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  21.63 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0901  tRNA-processing RNAse BN  20.16 
 
 		 433 aa  49.7  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562692  decreased coverage  0.000000115397 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1895  ribonuclease BN, putative  25.6 
 
 		 410 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  22.68 
 
 		 305 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  22.88 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  21.54 
 
 		 320 aa  47.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  22.61 
 
 		 443 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  22.61 
 
 		 443 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  19.38 
 
 		 538 aa  45.8  0.0009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  21.94 
 
 		 446 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  22.77 
 
 		 363 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  22.61 
 
 		 443 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  24.24 
 
 		 408 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0716  ribonuclease BN/unknown domain fusion protein  22.89 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603481  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  23.24 
 
 		 442 aa  43.5  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  22.55 
 
 		 441 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  26.55 
 
 		 417 aa  43.1  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1119  ribonuclease BN  24.16 
 
 		 429 aa  42.7  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695932  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1200  putative ribonuclease BN  24.16 
 
 		 429 aa  42.7  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  21.58 
 
 		 446 aa  42.7  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>