More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0324 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  100 
 
 
314 aa  621  1e-177  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  76.28 
 
 
292 aa  398  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  76.28 
 
 
292 aa  397  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  73.01 
 
 
320 aa  395  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  32.28 
 
 
291 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  32.86 
 
 
306 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  32.97 
 
 
299 aa  153  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  36.33 
 
 
300 aa  149  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  34.33 
 
 
443 aa  145  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  32.05 
 
 
360 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  33.99 
 
 
324 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  34.1 
 
 
299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  31.29 
 
 
307 aa  139  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  34.66 
 
 
298 aa  138  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  33.44 
 
 
325 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  29.07 
 
 
324 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  32.86 
 
 
299 aa  137  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  34.31 
 
 
436 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  33.98 
 
 
321 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  31.82 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  36.59 
 
 
411 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  34.94 
 
 
307 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  34.94 
 
 
304 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  34.56 
 
 
337 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  34.94 
 
 
307 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  34.94 
 
 
307 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  34.07 
 
 
307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  28.27 
 
 
317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  28.16 
 
 
424 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  33.57 
 
 
370 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  30.77 
 
 
341 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  30.92 
 
 
427 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  32.47 
 
 
347 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  33.71 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  32.33 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  32.33 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  31.95 
 
 
308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  32.25 
 
 
310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  32.06 
 
 
311 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  31.88 
 
 
310 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  32.22 
 
 
311 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  30.84 
 
 
305 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  30.25 
 
 
321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  30.47 
 
 
321 aa  120  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  28.1 
 
 
322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  30.49 
 
 
311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  28.29 
 
 
323 aa  119  9e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  30.58 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  30.91 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  32.63 
 
 
329 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  32.85 
 
 
329 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  32.85 
 
 
329 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  33.33 
 
 
305 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  32.43 
 
 
324 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  31.84 
 
 
305 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  31.92 
 
 
326 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  32.08 
 
 
303 aa  106  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  32.73 
 
 
321 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  33.44 
 
 
331 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  28.92 
 
 
302 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  37.93 
 
 
306 aa  102  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  33.68 
 
 
334 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  33.04 
 
 
393 aa  99.4  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  26.72 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  32.79 
 
 
309 aa  93.6  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  33.33 
 
 
305 aa  91.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  32.74 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  28.66 
 
 
332 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  28.62 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  28.2 
 
 
296 aa  77  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001900  ribonuclease BN  27.24 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.886374  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  26.46 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  29.72 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  29.29 
 
 
441 aa  75.9  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  24.75 
 
 
340 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  26.1 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  26.1 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  26.1 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  24.75 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  26.1 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  26.1 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  21.96 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1457  ribonuclease BN  28.68 
 
 
484 aa  72.4  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  26.89 
 
 
302 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  23.61 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03771  ribonuclease BN  24.07 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  24.07 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  24.07 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  24.07 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  24.07 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  24.07 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  24.07 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  24.07 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  24.07 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  26.43 
 
 
437 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0030  ribonuclease BN  27.21 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  24.3 
 
 
336 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  28.74 
 
 
442 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0034  ribonuclease BN  27.7 
 
 
294 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  26.15 
 
 
439 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>