More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0861 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0861  general secretion pathway protein D  100 
 
 		 759 aa  1552    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.473391  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  26.64 
 
 		 420 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1622  type II and III secretion system protein  25.59 
 
 		 673 aa  97.8  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  26.91 
 
 		 422 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  22.59 
 
 		 745 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  25.81 
 
 		 420 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  24.71 
 
 		 763 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  23.62 
 
 		 833 aa  94.7  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3236  type II and III secretion system protein  23.3 
 
 		 711 aa  95.1  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  22.83 
 
 		 799 aa  94.7  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  26.55 
 
 		 784 aa  94.4  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  25.78 
 
 		 779 aa  93.2  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  26.54 
 
 		 776 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0996  type IV pilus secretin PilQ  25.53 
 
 		 864 aa  92.8  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3759  type IV pilus secretin PilQ  26.92 
 
 		 465 aa  92  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180527  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  25.55 
 
 		 420 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3205  type II/III secretion system protein  26.92 
 
 		 462 aa  92  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.278596  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2798  type II/III secretion system protein  26.92 
 
 		 462 aa  92  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3701  type IV pilus secretin PilQ  26.92 
 
 		 462 aa  92  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0441702  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2748  type II/III secretion system protein  26.92 
 
 		 527 aa  91.7  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3730  type II/III secretion system protein  26.92 
 
 		 575 aa  91.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  28.77 
 
 		 874 aa  91.7  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1756  type II/III secretion system protein  26.92 
 
 		 616 aa  91.7  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  25.26 
 
 		 891 aa  91.3  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0206  type IV pilus assembly protein PilQ  26.61 
 
 		 745 aa  91.3  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292447  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3025  type II/III secretion system protein  26.57 
 
 		 576 aa  90.9  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  26.86 
 
 		 944 aa  90.1  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2795  type IV pilus secretin PilQ  26.86 
 
 		 523 aa  90.1  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.747994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  24.05 
 
 		 819 aa  90.5  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2923  type II and III secretion system protein  25.91 
 
 		 710 aa  88.6  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  25.34 
 
 		 710 aa  88.6  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  26.57 
 
 		 894 aa  88.2  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  25.94 
 
 		 718 aa  87.8  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  26.33 
 
 		 870 aa  87.8  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  27.06 
 
 		 706 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45260  secretion system protein  26.42 
 
 		 717 aa  87.4  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  23.58 
 
 		 696 aa  86.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1004  general secretion pathway protein D  25.09 
 
 		 640 aa  85.5  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  24.91 
 
 		 692 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3488  type II and III secretion system protein  26.19 
 
 		 543 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  25.77 
 
 		 660 aa  85.1  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  26.57 
 
 		 668 aa  85.1  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1980  type IV pilus secretin PilQ  27.15 
 
 		 693 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0209745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3269  general secretion pathway protein D  25.09 
 
 		 640 aa  84.7  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000207036  hitchhiker  0.00000000000000178028 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0953  general secretion pathway protein D  25.09 
 
 		 640 aa  84.7  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.198389  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  25.42 
 
 		 718 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0319  type IV pilus secretin PilQ  27.27 
 
 		 553 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.935194 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0310  type IV pilus secretin PilQ  27.4 
 
 		 553 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  26.15 
 
 		 591 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2716  Type IV pilus secretin PilQ  26.62 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00921837  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0391  type IV pilus secretin PilQ  26.62 
 
 		 543 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0785  type II and III secretion system protein  26.23 
 
 		 717 aa  84  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  25.54 
 
 		 926 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0370  type IV pilus secretin PilQ  26.69 
 
 		 543 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3249  type IV pilus secretin PilQ  25 
 
 		 721 aa  84  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0358  putative fimbrial type-4 assembly signal peptide, PilQ-like  26.5 
 
 		 567 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2902  type IV pilus secretin PilQ  25 
 
 		 721 aa  84  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.123013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66620  type 4 fimbrial biogenesis outer membrane protein PilQ precursor  22.61 
 
 		 710 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.601921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3020  Type II secretory pathway component PulD-like protein  22.3 
 
 		 696 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000150174  decreased coverage  0.00000000799268 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  24.5 
 
 		 714 aa  82  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5918  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  24.65 
 
 		 588 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.033473  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  23.61 
 
 		 670 aa  81.3  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  25.18 
 
 		 946 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3067  general secretion pathway protein D  23.94 
 
 		 803 aa  80.9  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0574712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0546  type IV pilus secretin PilQ  24.2 
 
 		 706 aa  80.9  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0294  type IV pilus secretin PilQ  26.35 
 
 		 573 aa  80.9  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.882341 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0779  general secretion pathway protein D  25.07 
 
 		 775 aa  80.5  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00261901  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2255  type II and III secretion system protein  24.65 
 
 		 372 aa  80.5  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.936423  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0866  general secretory pathway protein D precursor  25.07 
 
 		 775 aa  79.7  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00112703  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  24.63 
 
 		 729 aa  79.7  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  21.56 
 
 		 720 aa  79.3  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  22.85 
 
 		 650 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  22.93 
 
 		 681 aa  79.3  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  22.85 
 
 		 654 aa  78.6  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1056  type II and III secretion system protein  29.72 
 
 		 541 aa  78.6  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0036675  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  22.85 
 
 		 654 aa  78.6  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0226374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0703  type IV pilus secretin PilQ  25.96 
 
 		 696 aa  78.6  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853833  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0381  general secretion pathway protein D  20.08 
 
 		 650 aa  78.2  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.693227  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0734  type IV pilus secretin PilQ  25.61 
 
 		 696 aa  78.2  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0375525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1144  type IV pilus secretin PilQ  25.57 
 
 		 714 aa  77.8  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  25.09 
 
 		 733 aa  77.8  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0018  type IV pilus secretin PilQ  25.32 
 
 		 712 aa  77.4  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18620  type II and III secretion system protein  31.71 
 
 		 602 aa  77.4  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0329  fimbrial assembly protein PilQ  28.57 
 
 		 729 aa  77.4  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  24.55 
 
 		 1421 aa  77.4  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1879  fimbrial assembly protein PilQ  25.52 
 
 		 756 aa  77  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000275793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1587  general secretion pathway protein D  23.86 
 
 		 801 aa  76.6  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.089404 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  20.99 
 
 		 681 aa  77  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5577  type IV pilus secretin PilQ  26.52 
 
 		 716 aa  76.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515424 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3281  type II and III secretion system protein  26.6 
 
 		 915 aa  75.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0337  putative outer membrane porin HofQ  27.62 
 
 		 426 aa  76.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  21.71 
 
 		 686 aa  76.3  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  21.29 
 
 		 675 aa  75.9  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0078  general secretion pathway protein D  24.38 
 
 		 660 aa  75.5  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2608  general secretion pathway protein D  23.67 
 
 		 842 aa  75.5  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1336  type II and III secretion system protein  26.32 
 
 		 653 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.474923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  23.78 
 
 		 658 aa  75.5  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  24.53 
 
 		 712 aa  75.1  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02686  general secretion pathway protein D  23.32 
 
 		 766 aa  75.1  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.91159  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2639  type II and III secretion system protein  22.77 
 
 		 733 aa  75.1  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0449107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>