More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2184 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2184  trypsin-like serine protease  100 
 
 		 266 aa  543  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2063  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.41 
 
 		 308 aa  99  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239523  hitchhiker  0.000119694 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0274  protease Do  36.03 
 
 		 509 aa  90.1  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.408213 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  27.31 
 
 		 472 aa  89.4  5e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  30.26 
 
 		 418 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  31.12 
 
 		 467 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  29.72 
 
 		 476 aa  86.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2507  protease Do  33.03 
 
 		 461 aa  86.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0254484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  31.19 
 
 		 492 aa  85.5  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  29.18 
 
 		 474 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  32.09 
 
 		 492 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  31.97 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  30.91 
 
 		 464 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  35.46 
 
 		 474 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.17 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  32.09 
 
 		 492 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  29.18 
 
 		 474 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  31.18 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  33.33 
 
 		 488 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2668  exported serine protease  31.16 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00113896  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  33.8 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0912  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.36 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000212061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  36.17 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0388  protease Do  31.97 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  29.86 
 
 		 467 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  31.8 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  30.57 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.21 
 
 		 428 aa  83.2  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.99 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  29.33 
 
 		 468 aa  82.8  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  36.13 
 
 		 473 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  33.76 
 
 		 513 aa  82.8  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  29.68 
 
 		 463 aa  82  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3822  peptidase S1C, Do  32.08 
 
 		 501 aa  82  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  31.34 
 
 		 490 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  33.8 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  35.21 
 
 		 383 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  30.24 
 
 		 483 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  32.84 
 
 		 472 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  33.33 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  30.24 
 
 		 483 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  33.53 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  33.08 
 
 		 474 aa  81.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  31.88 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  32.31 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2993  protease Do  32.31 
 
 		 476 aa  80.5  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.700896 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  34.59 
 
 		 491 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  30.82 
 
 		 514 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  32.85 
 
 		 469 aa  80.1  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2041  protease Do  29.7 
 
 		 480 aa  80.1  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  29.73 
 
 		 485 aa  80.1  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24150  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  32.79 
 
 		 515 aa  79.7  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004515  outer membrane stress sensor protease DegS  30.49 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.497623  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0403  protease Do  32.33 
 
 		 483 aa  80.1  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.95 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  32.35 
 
 		 520 aa  79.7  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0855  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.76 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1649  protease Do  29.51 
 
 		 474 aa  79.7  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.25 
 
 		 412 aa  79.3  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2317  protease Do  34.56 
 
 		 487 aa  79.3  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1624  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.1 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  35.21 
 
 		 471 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  35.66 
 
 		 476 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  32.26 
 
 		 464 aa  79  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  35.92 
 
 		 476 aa  79  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  29.02 
 
 		 407 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0904  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.76 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313384  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  28.89 
 
 		 496 aa  79  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  31.85 
 
 		 504 aa  79  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0175  trypsin-like serine protease  32.63 
 
 		 347 aa  79  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0707716  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1396  serine protease, DO/DeqQ family  29.71 
 
 		 479 aa  79  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.333333  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1117  protease Do  29.71 
 
 		 491 aa  79  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0590546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0900  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.76 
 
 		 301 aa  78.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.38111  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  31.69 
 
 		 407 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2688  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.78 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  33.1 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  29.55 
 
 		 499 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  33.1 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  30.97 
 
 		 489 aa  78.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  30.16 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  29.55 
 
 		 500 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  30.67 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  33.1 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  32.59 
 
 		 503 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  28.57 
 
 		 484 aa  78.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  33.09 
 
 		 383 aa  78.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.58 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  29.55 
 
 		 499 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  35.92 
 
 		 476 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  29.55 
 
 		 490 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  29.48 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  32.14 
 
 		 497 aa  77.8  0.0000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  33.1 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  29.3 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  28.51 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  29.91 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  33.1 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0471  protease Do  31.39 
 
 		 500 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0438945 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2485  serine protease  33.13 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  29.55 
 
 		 498 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>