123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1370 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1370  DKCLD domain protein  100 
 
 		 89 aa  185  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.834881  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0056  DKCLD domain-containing protein  55.95 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.477818 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1702  putative rRNA pseudouridine synthase  52.38 
 
 		 321 aa  85.5  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.438885  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0082  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  59.65 
 
 		 338 aa  82  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0461  putative rRNA pseudouridine synthase  50 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0155  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  54.69 
 
 		 335 aa  77  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0080  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  50.7 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0054  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  50.7 
 
 		 333 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0961  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  51.52 
 
 		 333 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0985  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  51.52 
 
 		 333 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0128242  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1128  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  47.89 
 
 		 328 aa  73.6  0.0000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000787218 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0089  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  47.62 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1720  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  50 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0406  pseudouridylate synthase subunit TruB  56.14 
 
 		 332 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0028  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  50.85 
 
 		 331 aa  70.5  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000488795  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0988  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  46.97 
 
 		 359 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1222  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  50 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02940  centromere/microtubule binding protein cbf5, putative  46.03 
 
 		 503 aa  67.8  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.701159  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20773  predicted protein  44.78 
 
 		 484 aa  67  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30197  predicted protein  44.44 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64832  nucleolar pseuduridine synthase and putative microtubule binding protein  46.03 
 
 		 475 aa  64.7  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08851  Centromere/microtubule-binding protein CBF5 (Centromere-binding factor 5)(Small nucleolar RNP protein CBF5)(H/ACA snoRNP protein CBF5)(rRNA pseudouridine synthase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O43100]  50 
 
 		 481 aa  62.8  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.842396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2322  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  50 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.713223  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1494  pseudouridylate synthase TruB domain protein  46.81 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2268  pseudouridylate synthase  53.85 
 
 		 310 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.570966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0072  hypothetical protein  62.16 
 
 		 282 aa  50.8  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00484212 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  50 
 
 		 310 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  47.37 
 
 		 309 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2256  pseudouridylate synthase TruB domain protein  39.34 
 
 		 304 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  55.26 
 
 		 303 aa  49.7  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1733  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  36.67 
 
 		 299 aa  48.9  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.17014 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2750  pseudouridylate synthase TruB domain protein  52.5 
 
 		 299 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0513  pseudouridylate synthase  48.98 
 
 		 322 aa  47.8  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1812  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  32.79 
 
 		 343 aa  47.4  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.572421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1054  tRNA pseudouridine synthase B  55.26 
 
 		 290 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156302  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1053  tRNA pseudouridine synthase B  50 
 
 		 305 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253025  hitchhiker  0.00000016309 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1642  tRNA pseudouridine synthase B  50 
 
 		 283 aa  46.2  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1659  tRNA pseudouridine synthase B  47.22 
 
 		 303 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0728  tRNA pseudouridine synthase B  58.33 
 
 		 296 aa  46.2  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  51.43 
 
 		 301 aa  45.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0071  tRNA pseudouridine synthase B  52.5 
 
 		 309 aa  45.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0071  tRNA pseudouridine synthase B  52.5 
 
 		 309 aa  45.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.861563  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3463  tRNA pseudouridine synthase B  42 
 
 		 318 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0336  tRNA pseudouridine synthase B  55.56 
 
 		 301 aa  45.4  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.636591  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0538  pseudouridylate synthase  48.72 
 
 		 302 aa  45.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0902248  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0441  tRNA pseudouridine synthase B  52.78 
 
 		 311 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0929  tRNA pseudouridine synthase B  45.95 
 
 		 305 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.590741  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0271  pseudouridylate synthase TruB domain protein  30.77 
 
 		 314 aa  45.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0998  tRNA pseudouridine synthase B  52.78 
 
 		 294 aa  44.7  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0507198  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  54.29 
 
 		 293 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  44.74 
 
 		 302 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1105  tRNA pseudouridine synthase B  42.5 
 
 		 313 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1165  tRNA pseudouridine synthase B  42.5 
 
 		 313 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1233  tRNA pseudouridine synthase B  42.5 
 
 		 313 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0870856  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3630  tRNA pseudouridine synthase B  50 
 
 		 307 aa  43.9  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.326344  normal  0.032374 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  47.37 
 
 		 294 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  47.37 
 
 		 297 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1144  tRNA pseudouridine synthase B  47.22 
 
 		 315 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.105946 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5113  tRNA pseudouridine synthase B  45.71 
 
 		 308 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  47.22 
 
 		 299 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  43.59 
 
 		 306 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0810  tRNA pseudouridine synthase B  38 
 
 		 314 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.384443  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3603  tRNA pseudouridine synthase B  38 
 
 		 314 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0328137 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  47.37 
 
 		 302 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1031  tRNA pseudouridine synthase B  40.91 
 
 		 308 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0565  tRNA pseudouridine synthase B  41.67 
 
 		 309 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  42.5 
 
 		 309 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1598  tRNA pseudouridine synthase B  41.67 
 
 		 309 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00177839  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  54.29 
 
 		 308 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3542  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 314 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3579  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 314 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.911389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3473  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 314 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3473  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 314 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3641  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 314 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5115  tRNA pseudouridine synthase B  47.06 
 
 		 310 aa  42.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.0750927 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2073  tRNA pseudouridine synthase B  52.94 
 
 		 306 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.427039 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0587  tRNA pseudouridine synthase B  38 
 
 		 314 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0827  tRNA pseudouridine synthase B  44.74 
 
 		 313 aa  42.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000378584 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  47.37 
 
 		 304 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  35.85 
 
 		 336 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  45.95 
 
 		 299 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1046  tRNA pseudouridine synthase B  51.43 
 
 		 304 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  43.59 
 
 		 302 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  51.43 
 
 		 308 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1021  tRNA pseudouridine synthase B  37.5 
 
 		 333 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  48.57 
 
 		 291 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0981  tRNA pseudouridine synthase B  47.37 
 
 		 300 aa  41.6  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl282  tRNA pseudouridine 5S synthase  47.5 
 
 		 286 aa  42  0.003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000650748  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0640  tRNA pseudouridine synthase B  44.12 
 
 		 298 aa  41.6  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.951154  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0491  tRNA pseudouridine synthase B  38 
 
 		 314 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.164014  normal  0.0135399 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11500  tRNA pseudouridine 55 synthase  41.03 
 
 		 348 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1306  tRNA pseudouridine synthase B  44.74 
 
 		 295 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000236822  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3344  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 318 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2978  tRNA pseudouridine synthase B  44.74 
 
 		 295 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.09603e-22 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1591  tRNA pseudouridine synthase B  50 
 
 		 304 aa  41.2  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00165016  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  43.59 
 
 		 295 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3960  tRNA pseudouridine synthase B  47.06 
 
 		 304 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03033  tRNA pseudouridine synthase B  38 
 
 		 314 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.975802  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  39.47 
 
 		 297 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3358  tRNA pseudouridine synthase B  38 
 
 		 314 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.928747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>