More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1222 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1222  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  100 
 
 
331 aa  679    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1720  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  69.39 
 
 
333 aa  489  1e-137  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0961  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  69.09 
 
 
333 aa  486  1e-136  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0985  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  68.79 
 
 
333 aa  483  1e-135  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0128242  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0988  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  67.27 
 
 
359 aa  476  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0028  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  48.63 
 
 
331 aa  331  1e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000488795  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0082  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  48.94 
 
 
338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576501  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0461  putative rRNA pseudouridine synthase  45.92 
 
 
338 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1702  putative rRNA pseudouridine synthase  45.68 
 
 
321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.438885  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0089  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.9 
 
 
331 aa  295  6e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0155  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.21 
 
 
335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1494  pseudouridylate synthase TruB domain protein  51.65 
 
 
286 aa  285  5.999999999999999e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0080  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.16 
 
 
331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1128  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.03 
 
 
328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000787218 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0054  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.29 
 
 
333 aa  281  8.000000000000001e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0538  pseudouridylate synthase  48.36 
 
 
302 aa  268  8e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0902248  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0406  pseudouridylate synthase subunit TruB  41.03 
 
 
332 aa  263  3e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_006686  CND02940  centromere/microtubule binding protein cbf5, putative  40 
 
 
503 aa  245  6.999999999999999e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.701159  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2268  pseudouridylate synthase  44.08 
 
 
310 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.570966  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08851  Centromere/microtubule-binding protein CBF5 (Centromere-binding factor 5)(Small nucleolar RNP protein CBF5)(H/ACA snoRNP protein CBF5)(rRNA pseudouridine synthase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O43100]  41.01 
 
 
481 aa  239  4e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.842396  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64832  nucleolar pseuduridine synthase and putative microtubule binding protein  39.09 
 
 
475 aa  239  5e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20773  predicted protein  38.97 
 
 
484 aa  235  7e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2750  pseudouridylate synthase TruB domain protein  42.57 
 
 
299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0513  pseudouridylate synthase  42.19 
 
 
322 aa  228  9e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2322  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.33 
 
 
295 aa  223  4e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.713223  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1733  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.12 
 
 
299 aa  219  5e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.17014 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30197  predicted protein  37.46 
 
 
411 aa  219  6e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2256  pseudouridylate synthase TruB domain protein  40.58 
 
 
304 aa  215  8e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1369  pseudouridylate synthase TruB domain protein  42.86 
 
 
251 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.862548  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1812  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  42.63 
 
 
343 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.572421  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0271  pseudouridylate synthase TruB domain protein  38.38 
 
 
314 aa  204  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0072  hypothetical protein  38.26 
 
 
282 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00484212 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0057  PUA domain-containing protein  42.44 
 
 
233 aa  194  2e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.510728 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  34.9 
 
 
304 aa  132  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  33.21 
 
 
302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  36.6 
 
 
304 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  33.33 
 
 
302 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  33.33 
 
 
305 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1904  tRNA pseudouridine synthase B  32.16 
 
 
310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000415787  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1591  tRNA pseudouridine synthase B  34.3 
 
 
304 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00165016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2978  tRNA pseudouridine synthase B  32.96 
 
 
295 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.09603e-22 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  33.85 
 
 
305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1306  tRNA pseudouridine synthase B  32.21 
 
 
295 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000236822  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  33.07 
 
 
305 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1045  tRNA pseudouridine synthase B  30.27 
 
 
300 aa  119  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128429  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  35.55 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1125  tRNA pseudouridine synthase B  29.5 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  30.72 
 
 
297 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  34.14 
 
 
309 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1331  tRNA pseudouridine synthase B  32.81 
 
 
305 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1357  tRNA pseudouridine synthase B  32.81 
 
 
305 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.531893  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0838  tRNA pseudouridine synthase B  32.1 
 
 
305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0059  tRNA pseudouridine synthase B  32.44 
 
 
366 aa  116  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  30.94 
 
 
300 aa  116  5e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  32.29 
 
 
305 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  29.93 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2293  tRNA pseudouridine synthase B  28.63 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  32.41 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0438  tRNA pseudouridine synthase B  32.7 
 
 
366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1165  tRNA pseudouridine synthase B  32.58 
 
 
313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705511  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  31.6 
 
 
306 aa  112  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4488  tRNA pseudouridine synthase B  30.9 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140717  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1311  tRNA pseudouridine synthase B  35.43 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0354136  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1634  tRNA pseudouridine synthase B  29.31 
 
 
311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.767781  hitchhiker  0.000962415 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1233  tRNA pseudouridine synthase B  31.84 
 
 
313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0870856  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4178  tRNA pseudouridine synthase B  31.25 
 
 
305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.224491  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  29.93 
 
 
322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0229  tRNA pseudouridine synthase B  31.94 
 
 
368 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00860319  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  30.65 
 
 
307 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0816  tRNA pseudouridine synthase B  28.62 
 
 
297 aa  110  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0170651  normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  30.74 
 
 
310 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  30.71 
 
 
303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  28.97 
 
 
311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  30.15 
 
 
310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  28.85 
 
 
300 aa  109  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1747  tRNA pseudouridine synthase B  29.62 
 
 
304 aa  109  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108245  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1105  tRNA pseudouridine synthase B  32.21 
 
 
313 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1655  tRNA pseudouridine synthase B  31.68 
 
 
294 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1237  tRNA pseudouridine synthase B  30.56 
 
 
330 aa  109  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.657883  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0033  tRNA pseudouridine synthase B  32.7 
 
 
412 aa  109  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0603  tRNA pseudouridine synthase B  31.56 
 
 
351 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2073  tRNA pseudouridine synthase B  30.11 
 
 
306 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.427039 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  28.89 
 
 
310 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  28.06 
 
 
309 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  30 
 
 
310 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0482  tRNA pseudouridine synthase B  31.68 
 
 
387 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.266724  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0071  tRNA pseudouridine synthase B  28.75 
 
 
309 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.861563  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0981  tRNA pseudouridine synthase B  30.77 
 
 
300 aa  108  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  30.27 
 
 
307 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  32.85 
 
 
306 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  28.93 
 
 
307 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  30.42 
 
 
307 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  30.8 
 
 
307 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  34.6 
 
 
293 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0026  tRNA pseudouridine synthase B  30.94 
 
 
358 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  33.8 
 
 
302 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1937  tRNA pseudouridine synthase B  31.68 
 
 
294 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1727  tRNA pseudouridine synthase B  28.97 
 
 
309 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.577271  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  29.78 
 
 
310 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  30.8 
 
 
307 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>