More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2268 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2268  pseudouridylate synthase  100 
 
 
310 aa  625  1e-178  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.570966  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2750  pseudouridylate synthase TruB domain protein  55.67 
 
 
299 aa  298  7e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0513  pseudouridylate synthase  52.17 
 
 
322 aa  290  2e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0538  pseudouridylate synthase  51.72 
 
 
302 aa  286  4e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0902248  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0072  hypothetical protein  49.44 
 
 
282 aa  257  2e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00484212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0082  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  44.76 
 
 
338 aa  252  7e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576501  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0461  putative rRNA pseudouridine synthase  43.69 
 
 
338 aa  247  2e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1222  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  44.08 
 
 
331 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0155  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  42.86 
 
 
335 aa  242  7e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0080  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  44.79 
 
 
331 aa  240  2e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1128  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  45.14 
 
 
328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000787218 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1702  putative rRNA pseudouridine synthase  44.25 
 
 
321 aa  239  4e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.438885  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0985  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.43 
 
 
333 aa  238  6.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0128242  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0089  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  44.1 
 
 
331 aa  238  9e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0961  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.43 
 
 
333 aa  237  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1720  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.43 
 
 
333 aa  237  2e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0054  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.4 
 
 
333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0028  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  41.32 
 
 
331 aa  232  5e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000488795  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0988  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  42.01 
 
 
359 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1494  pseudouridylate synthase TruB domain protein  44.2 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64832  nucleolar pseuduridine synthase and putative microtubule binding protein  40.61 
 
 
475 aa  205  6e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0406  pseudouridylate synthase subunit TruB  40 
 
 
332 aa  205  7e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.189117 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08851  Centromere/microtubule-binding protein CBF5 (Centromere-binding factor 5)(Small nucleolar RNP protein CBF5)(H/ACA snoRNP protein CBF5)(rRNA pseudouridine synthase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O43100]  40.82 
 
 
481 aa  204  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.842396  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2322  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  45.18 
 
 
295 aa  204  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.713223  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02940  centromere/microtubule binding protein cbf5, putative  39.67 
 
 
503 aa  205  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.701159  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20773  predicted protein  40.68 
 
 
484 aa  204  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1733  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.03 
 
 
299 aa  196  3e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.17014 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1812  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  41.74 
 
 
343 aa  194  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.572421  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1369  pseudouridylate synthase TruB domain protein  41.04 
 
 
251 aa  189  4e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.862548  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2256  pseudouridylate synthase TruB domain protein  41.32 
 
 
304 aa  185  8e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0271  pseudouridylate synthase TruB domain protein  38.31 
 
 
314 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30197  predicted protein  40.07 
 
 
411 aa  175  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0057  PUA domain-containing protein  38.03 
 
 
233 aa  160  4e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.510728 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1311  tRNA pseudouridine synthase B  39.07 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0354136  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  36.12 
 
 
302 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  35.71 
 
 
304 aa  126  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  34.35 
 
 
302 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  35.42 
 
 
295 aa  123  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  35.29 
 
 
310 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1031  tRNA pseudouridine synthase B  30.17 
 
 
308 aa  123  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  35.29 
 
 
310 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  35.29 
 
 
310 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  35.29 
 
 
310 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  30.38 
 
 
306 aa  122  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  32.55 
 
 
311 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1727  tRNA pseudouridine synthase B  35.94 
 
 
309 aa  122  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.577271  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3031  tRNA pseudouridine synthase B  34.75 
 
 
303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1694  tRNA pseudouridine synthase B  36.15 
 
 
328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00112277  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1659  tRNA pseudouridine synthase B  35.38 
 
 
303 aa  120  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  35.02 
 
 
310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  32.31 
 
 
305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  30.38 
 
 
310 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  32.31 
 
 
305 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  33.46 
 
 
310 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  36.43 
 
 
293 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  33.33 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  32.65 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4028  tRNA pseudouridine synthase B  32.58 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1634  tRNA pseudouridine synthase B  31.88 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.767781  hitchhiker  0.000962415 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0393  tRNA pseudouridine synthase B  30.72 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  31.97 
 
 
305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  29.9 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0557  tRNA pseudouridine synthase B  30.72 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1904  tRNA pseudouridine synthase B  30.56 
 
 
310 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000415787  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  33.99 
 
 
301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  34.86 
 
 
299 aa  116  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  32.21 
 
 
307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3327  tRNA pseudouridine synthase B  34.22 
 
 
289 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212932  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  31.58 
 
 
307 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  32.21 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  32.21 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  33.21 
 
 
302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  31.84 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  33.73 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  31.84 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  31.35 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  31.58 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  32 
 
 
302 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  32.2 
 
 
306 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1125  tRNA pseudouridine synthase B  30.66 
 
 
303 aa  114  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  31.84 
 
 
307 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  31.84 
 
 
307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4178  tRNA pseudouridine synthase B  30.27 
 
 
305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.224491  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  33.2 
 
 
304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  31.23 
 
 
303 aa  113  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  30.17 
 
 
304 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1512  tRNA pseudouridine synthase B  33.97 
 
 
303 aa  113  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.467082  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4488  tRNA pseudouridine synthase B  30.95 
 
 
305 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140717  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  31.46 
 
 
307 aa  112  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1598  tRNA pseudouridine synthase B  30.98 
 
 
309 aa  112  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00177839  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0173  tRNA pseudouridine synthase B  31.67 
 
 
321 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.016553  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1059  tRNA pseudouridine synthase B  31.67 
 
 
311 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00436099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1505  tRNA pseudouridine synthase B  31.67 
 
 
321 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  31.67 
 
 
302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0565  tRNA pseudouridine synthase B  30.98 
 
 
309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1764  tRNA pseudouridine synthase B  31.67 
 
 
302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  30.17 
 
 
304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0993  tRNA pseudouridine synthase B  31.67 
 
 
302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05391  tRNA pseudouridine synthase B  33.59 
 
 
323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2750  tRNA pseudouridine synthase B  32.77 
 
 
318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>