More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2256 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2256  pseudouridylate synthase TruB domain protein  100 
 
 		 304 aa  604  9.999999999999999e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0271  pseudouridylate synthase TruB domain protein  75.16 
 
 		 314 aa  454  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1812  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  64.86 
 
 		 343 aa  379  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.572421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2322  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  65.46 
 
 		 295 aa  376  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.713223  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1733  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  64.33 
 
 		 299 aa  354  1e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.17014 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1494  pseudouridylate synthase TruB domain protein  45.79 
 
 		 286 aa  249  4e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1702  putative rRNA pseudouridine synthase  45.13 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.438885  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0028  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  42.19 
 
 		 331 aa  240  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000488795  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0082  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  44.04 
 
 		 338 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0461  putative rRNA pseudouridine synthase  45.32 
 
 		 338 aa  237  2e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0988  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  42.52 
 
 		 359 aa  236  3e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1720  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  41.52 
 
 		 333 aa  223  4e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0961  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  41.52 
 
 		 333 aa  221  9e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0985  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  41.52 
 
 		 333 aa  219  5e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0128242  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0406  pseudouridylate synthase subunit TruB  39.53 
 
 		 332 aa  216  4e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1222  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  40.58 
 
 		 331 aa  215  7e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0155  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  38.31 
 
 		 335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0080  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  39.58 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1128  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  38.41 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000787218 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0054  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  39.22 
 
 		 333 aa  203  3e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0072  hypothetical protein  40.44 
 
 		 282 aa  202  7e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00484212 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0089  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  37.75 
 
 		 331 aa  202  8e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2750  pseudouridylate synthase TruB domain protein  44.28 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0538  pseudouridylate synthase  42.44 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0902248  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2268  pseudouridylate synthase  41.32 
 
 		 310 aa  185  8e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.570966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20773  predicted protein  38.08 
 
 		 484 aa  183  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0513  pseudouridylate synthase  38.87 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64832  nucleolar pseuduridine synthase and putative microtubule binding protein  36.61 
 
 		 475 aa  179  2.9999999999999997e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08851  Centromere/microtubule-binding protein CBF5 (Centromere-binding factor 5)(Small nucleolar RNP protein CBF5)(H/ACA snoRNP protein CBF5)(rRNA pseudouridine synthase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O43100]  37.37 
 
 		 481 aa  178  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.842396  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02940  centromere/microtubule binding protein cbf5, putative  37.14 
 
 		 503 aa  175  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.701159  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1369  pseudouridylate synthase TruB domain protein  36.29 
 
 		 251 aa  160  3e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.862548  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30197  predicted protein  39.01 
 
 		 411 aa  159  7e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0057  PUA domain-containing protein  37.56 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.510728 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  30.94 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1659  tRNA pseudouridine synthase B  33.21 
 
 		 303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  27.99 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  32.86 
 
 		 307 aa  113  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  28.34 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  32.16 
 
 		 309 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  30.88 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  29.64 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1694  tRNA pseudouridine synthase B  31.06 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00112277  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  29.77 
 
 		 301 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  30.53 
 
 		 305 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2203  tRNA pseudouridine synthase B  30.67 
 
 		 302 aa  105  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.147231  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1946  tRNA pseudouridine synthase B  34.78 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0313874 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3346  tRNA pseudouridine synthase B  32.23 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  30.29 
 
 		 306 aa  103  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0929  tRNA pseudouridine synthase B  32.74 
 
 		 305 aa  102  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.590741  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  30.77 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0291  tRNA pseudouridine synthase B  32.09 
 
 		 363 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0204129 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1747  tRNA pseudouridine synthase B  30.49 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108245  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0903  pseudouridylate synthase  28.44 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0460  tRNA pseudouridine synthase B  27.02 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3725  tRNA pseudouridine synthase B  29.93 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0838427 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  30.69 
 
 		 291 aa  100  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  31.93 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  29.49 
 
 		 304 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  30.13 
 
 		 304 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  25.47 
 
 		 303 aa  99.8  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0159  tRNA pseudouridine synthase B  34.43 
 
 		 344 aa  99.4  7e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  28.84 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1306  tRNA pseudouridine synthase B  29.76 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000236822  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  29.32 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0076  tRNA pseudouridine synthase B  30.88 
 
 		 359 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.908993 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1222  tRNA pseudouridine synthase B  32.89 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.732593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  29.83 
 
 		 314 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0629  tRNA pseudouridine synthase B  26.01 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  29.23 
 
 		 302 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  31.28 
 
 		 314 aa  97.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3932  tRNA pseudouridine synthase B  31.64 
 
 		 312 aa  97.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.138388  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0069  tRNA pseudouridine synthase B  28.76 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00601892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1005  tRNA pseudouridine synthase B  30.94 
 
 		 307 aa  96.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319279  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  30.15 
 
 		 307 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  30.71 
 
 		 304 aa  96.3  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3042  tRNA pseudouridine synthase B  32.23 
 
 		 304 aa  96.3  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.877322 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2817  tRNA pseudouridine synthase B  31.6 
 
 		 241 aa  95.9  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  hitchhiker  0.00223059 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1105  tRNA pseudouridine synthase B  33.81 
 
 		 313 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0600  tRNA pseudouridine synthase B  29.63 
 
 		 318 aa  95.9  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2750  tRNA pseudouridine synthase B  32.58 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1862  tRNA pseudouridine synthase B  30.45 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.552372  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  28.76 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2118  tRNA pseudouridine synthase B  31.37 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206379  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  27.62 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0033  tRNA pseudouridine synthase B  32.71 
 
 		 412 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  28.28 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4620  tRNA pseudouridine synthase B  30.33 
 
 		 335 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29706  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1598  tRNA pseudouridine synthase B  28.39 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00177839  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  30.26 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1165  tRNA pseudouridine synthase B  33.22 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705511  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  30.15 
 
 		 307 aa  94  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0695  tRNA pseudouridine synthase B  29.22 
 
 		 298 aa  93.6  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.392139  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3783  tRNA pseudouridine synthase B  31.85 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1655  tRNA pseudouridine synthase B  25.91 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  29.1 
 
 		 291 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0491  tRNA pseudouridine synthase B  30.55 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.444271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  30.22 
 
 		 293 aa  93.6  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3031  tRNA pseudouridine synthase B  32.58 
 
 		 303 aa  93.2  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  31.16 
 
 		 301 aa  93.6  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3630  tRNA pseudouridine synthase B  36.19 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.326344  normal  0.032374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>