More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2322 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2322  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  100 
 
 
295 aa  584  1e-166  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.713223  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2256  pseudouridylate synthase TruB domain protein  65.79 
 
 
304 aa  384  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1733  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  66.78 
 
 
299 aa  382  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.17014 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1812  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  64.47 
 
 
343 aa  371  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.572421  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0271  pseudouridylate synthase TruB domain protein  61.61 
 
 
314 aa  370  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1702  putative rRNA pseudouridine synthase  46.6 
 
 
321 aa  268  7e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.438885  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0028  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  42.96 
 
 
331 aa  247  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000488795  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0082  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  46.07 
 
 
338 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576501  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1494  pseudouridylate synthase TruB domain protein  43.66 
 
 
286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0461  putative rRNA pseudouridine synthase  47.21 
 
 
338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0988  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  42.37 
 
 
359 aa  240  2e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1720  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  40.61 
 
 
333 aa  231  1e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0961  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  40.68 
 
 
333 aa  230  2e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0985  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  40.68 
 
 
333 aa  228  9e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0128242  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0406  pseudouridylate synthase subunit TruB  40.61 
 
 
332 aa  227  2e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1222  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  40.89 
 
 
331 aa  226  4e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0155  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  39.1 
 
 
335 aa  224  2e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0089  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  41.5 
 
 
331 aa  223  4e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0080  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  40.48 
 
 
331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0054  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  40.14 
 
 
333 aa  217  2e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1128  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  39.8 
 
 
328 aa  216  4e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000787218 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2268  pseudouridylate synthase  45.02 
 
 
310 aa  207  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.570966  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20773  predicted protein  38.31 
 
 
484 aa  204  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64832  nucleolar pseuduridine synthase and putative microtubule binding protein  36.49 
 
 
475 aa  201  9.999999999999999e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02940  centromere/microtubule binding protein cbf5, putative  36.15 
 
 
503 aa  199  3e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.701159  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0513  pseudouridylate synthase  44.21 
 
 
322 aa  200  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0538  pseudouridylate synthase  45.25 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0902248  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2750  pseudouridylate synthase TruB domain protein  46.12 
 
 
299 aa  191  9e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08851  Centromere/microtubule-binding protein CBF5 (Centromere-binding factor 5)(Small nucleolar RNP protein CBF5)(H/ACA snoRNP protein CBF5)(rRNA pseudouridine synthase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O43100]  34.68 
 
 
481 aa  189  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.842396  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0072  hypothetical protein  40.77 
 
 
282 aa  182  6e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00484212 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30197  predicted protein  36.79 
 
 
411 aa  167  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0057  PUA domain-containing protein  40.18 
 
 
233 aa  161  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.510728 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1369  pseudouridylate synthase TruB domain protein  35.42 
 
 
251 aa  160  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.862548  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  34.36 
 
 
305 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  32.25 
 
 
310 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  33.98 
 
 
305 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  33.98 
 
 
305 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  35.14 
 
 
306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  33.98 
 
 
304 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  33.98 
 
 
304 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4488  tRNA pseudouridine synthase B  33.59 
 
 
305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140717  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4178  tRNA pseudouridine synthase B  33.2 
 
 
305 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.224491  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3728  tRNA pseudouridine synthase B  32.44 
 
 
324 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124557  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3995  tRNA pseudouridine synthase B  32.44 
 
 
324 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.866434  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3594  tRNA pseudouridine synthase B  32.44 
 
 
324 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0311816  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  32.82 
 
 
305 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  33.98 
 
 
305 aa  122  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  33.59 
 
 
294 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  34.67 
 
 
302 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  30.38 
 
 
306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  32.35 
 
 
302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1659  tRNA pseudouridine synthase B  34.62 
 
 
303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1946  tRNA pseudouridine synthase B  31.6 
 
 
308 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0313874 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0629  tRNA pseudouridine synthase B  27.91 
 
 
317 aa  119  4.9999999999999996e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  30.26 
 
 
309 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  28.72 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  35.32 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0727  tRNA pseudouridine synthase B  31.48 
 
 
319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0491  tRNA pseudouridine synthase B  32.83 
 
 
314 aa  115  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.164014  normal  0.0135399 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0069  tRNA pseudouridine synthase B  29.41 
 
 
302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00601892  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0393  tRNA pseudouridine synthase B  32.42 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0557  tRNA pseudouridine synthase B  32.42 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0600  tRNA pseudouridine synthase B  30.04 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2009  tRNA pseudouridine synthase B  36.36 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.845229  normal  0.607065 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1694  tRNA pseudouridine synthase B  32.51 
 
 
328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00112277  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1029  tRNA pseudouridine synthase B  34.45 
 
 
308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0929  tRNA pseudouridine synthase B  33.21 
 
 
305 aa  112  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.590741  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1005  tRNA pseudouridine synthase B  30.65 
 
 
307 aa  112  9e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319279  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  32.17 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0587  tRNA pseudouridine synthase B  31.54 
 
 
314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  33.59 
 
 
304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  32.09 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3031  tRNA pseudouridine synthase B  33.72 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002611  tRNA pseudouridine synthase B  30.53 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  32.09 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03033  tRNA pseudouridine synthase B  31.32 
 
 
314 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.975802  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0539  tRNA pseudouridine synthase B  31.32 
 
 
314 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3346  tRNA pseudouridine synthase B  30.65 
 
 
307 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3358  tRNA pseudouridine synthase B  31.32 
 
 
314 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.928747  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0532  tRNA pseudouridine synthase B  31.32 
 
 
314 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405191 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1904  tRNA pseudouridine synthase B  32.55 
 
 
310 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000415787  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  32.09 
 
 
310 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  32.18 
 
 
297 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3462  tRNA pseudouridine synthase B  31.32 
 
 
314 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.266438 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02984  hypothetical protein  31.32 
 
 
314 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3344  tRNA pseudouridine synthase B  31.18 
 
 
318 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0176  tRNA pseudouridine synthase B  31.56 
 
 
312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721931  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4487  tRNA pseudouridine synthase B  31.2 
 
 
314 aa  109  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2817  tRNA pseudouridine synthase B  34.86 
 
 
241 aa  109  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  hitchhiker  0.00223059 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3605  tRNA pseudouridine synthase B  30.94 
 
 
314 aa  109  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0823  tRNA pseudouridine synthase B  30.08 
 
 
308 aa  109  6e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.939729  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3641  tRNA pseudouridine synthase B  31.2 
 
 
314 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0695  tRNA pseudouridine synthase B  30.47 
 
 
298 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.392139  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3473  tRNA pseudouridine synthase B  30.94 
 
 
314 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  32.75 
 
 
310 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3650  tRNA pseudouridine synthase B  30.94 
 
 
314 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07030  tRNA pseudouridine synthase B  35.19 
 
 
298 aa  107  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3579  tRNA pseudouridine synthase B  31.32 
 
 
314 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.911389  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3542  tRNA pseudouridine synthase B  30.94 
 
 
314 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3473  tRNA pseudouridine synthase B  30.94 
 
 
314 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>