More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_30197 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009356  OSTLU_30197  predicted protein  100 
 
 
411 aa  846    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08851  Centromere/microtubule-binding protein CBF5 (Centromere-binding factor 5)(Small nucleolar RNP protein CBF5)(H/ACA snoRNP protein CBF5)(rRNA pseudouridine synthase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O43100]  75.77 
 
 
481 aa  578  1e-164  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.842396  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02940  centromere/microtubule binding protein cbf5, putative  75.14 
 
 
503 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.701159  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64832  nucleolar pseuduridine synthase and putative microtubule binding protein  70.08 
 
 
475 aa  562  1.0000000000000001e-159  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20773  predicted protein  74.18 
 
 
484 aa  556  1e-157  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0461  putative rRNA pseudouridine synthase  47.04 
 
 
338 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1702  putative rRNA pseudouridine synthase  47.88 
 
 
321 aa  279  7e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.438885  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0082  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.65 
 
 
338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576501  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0406  pseudouridylate synthase subunit TruB  39.29 
 
 
332 aa  246  6e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0028  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  42.02 
 
 
331 aa  245  8e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000488795  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0155  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  40.72 
 
 
335 aa  243  5e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0988  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  40.81 
 
 
359 aa  243  5e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0080  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  40.5 
 
 
331 aa  238  2e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0985  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  39.53 
 
 
333 aa  238  2e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0128242  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0961  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  39.23 
 
 
333 aa  237  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0054  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  42.17 
 
 
333 aa  237  3e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1720  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  39.23 
 
 
333 aa  236  4e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1128  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  38.14 
 
 
328 aa  232  9e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000787218 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0089  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  39.87 
 
 
331 aa  231  2e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1222  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  37.46 
 
 
331 aa  230  3e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0538  pseudouridylate synthase  39.73 
 
 
302 aa  207  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0902248  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1369  pseudouridylate synthase TruB domain protein  40 
 
 
251 aa  204  3e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.862548  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1494  pseudouridylate synthase TruB domain protein  38.31 
 
 
286 aa  199  6e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2750  pseudouridylate synthase TruB domain protein  40.72 
 
 
299 aa  197  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2268  pseudouridylate synthase  40.07 
 
 
310 aa  192  9e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.570966  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0513  pseudouridylate synthase  39.25 
 
 
322 aa  183  6e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2322  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  36.79 
 
 
295 aa  182  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.713223  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2256  pseudouridylate synthase TruB domain protein  39.01 
 
 
304 aa  179  7e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0072  hypothetical protein  38.16 
 
 
282 aa  176  5e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00484212 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1733  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  37.32 
 
 
299 aa  171  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.17014 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1812  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  36.33 
 
 
343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.572421  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0271  pseudouridylate synthase TruB domain protein  35.49 
 
 
314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0057  PUA domain-containing protein  37.18 
 
 
233 aa  163  5.0000000000000005e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.510728 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  30.86 
 
 
309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  31.33 
 
 
294 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  30.74 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  31.79 
 
 
302 aa  111  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1512  tRNA pseudouridine synthase B  32.93 
 
 
303 aa  111  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.467082  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  33.74 
 
 
299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0998  tRNA pseudouridine synthase B  28.84 
 
 
294 aa  107  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0507198  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  30.57 
 
 
307 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  28.9 
 
 
300 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  30.25 
 
 
322 aa  106  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  31.18 
 
 
310 aa  106  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0565  tRNA pseudouridine synthase B  28.52 
 
 
309 aa  106  9e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1432  tRNA pseudouridine synthase B  34.39 
 
 
322 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000149867 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  36.97 
 
 
336 aa  105  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  30.19 
 
 
307 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  30.19 
 
 
307 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  30.19 
 
 
307 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  34.83 
 
 
306 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1703  tRNA pseudouridine synthase B  31.25 
 
 
339 aa  103  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000149412 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  30.8 
 
 
310 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  30.8 
 
 
310 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  30.8 
 
 
310 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  36.45 
 
 
293 aa  102  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  29.81 
 
 
307 aa  103  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  31.14 
 
 
295 aa  103  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3031  tRNA pseudouridine synthase B  31.11 
 
 
303 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1598  tRNA pseudouridine synthase B  28.14 
 
 
309 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00177839  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  29.43 
 
 
307 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  29.81 
 
 
307 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  29.81 
 
 
307 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  29.93 
 
 
310 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  29.81 
 
 
307 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  30.63 
 
 
310 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  33.65 
 
 
297 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  29.06 
 
 
307 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1727  tRNA pseudouridine synthase B  37 
 
 
297 aa  100  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  29.64 
 
 
310 aa  100  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2992  tRNA pseudouridine synthase B  30.15 
 
 
321 aa  99.8  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1306  tRNA pseudouridine synthase B  30.36 
 
 
295 aa  99.8  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000236822  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  32.82 
 
 
302 aa  99.8  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  29.43 
 
 
307 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1357  tRNA pseudouridine synthase B  28.76 
 
 
305 aa  99.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.531893  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  27.83 
 
 
313 aa  99.4  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1331  tRNA pseudouridine synthase B  28.76 
 
 
305 aa  99.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08010  tRNA pseudouridine 55 synthase  34.5 
 
 
340 aa  98.6  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.608305 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  30.92 
 
 
307 aa  98.6  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1031  tRNA pseudouridine synthase B  27.18 
 
 
308 aa  98.6  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  30.3 
 
 
309 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  34.33 
 
 
304 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3960  tRNA pseudouridine synthase B  35.07 
 
 
304 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1727  tRNA pseudouridine synthase B  28 
 
 
309 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.577271  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  27.34 
 
 
297 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  35.03 
 
 
292 aa  97.8  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  30.15 
 
 
302 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2029  tRNA pseudouridine synthase B  32.99 
 
 
314 aa  97.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4028  tRNA pseudouridine synthase B  29.96 
 
 
294 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0838  tRNA pseudouridine synthase B  28.2 
 
 
305 aa  97.1  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1747  tRNA pseudouridine synthase B  27.44 
 
 
304 aa  97.1  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108245  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2120  tRNA pseudouridine 55 synthase  33.67 
 
 
299 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2978  tRNA pseudouridine synthase B  30.92 
 
 
295 aa  96.7  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.09603e-22 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  29.74 
 
 
299 aa  96.3  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3589  tRNA pseudouridine synthase B  33.5 
 
 
295 aa  96.3  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0304508  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1505  tRNA pseudouridine synthase B  29.77 
 
 
321 aa  96.3  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0173  tRNA pseudouridine synthase B  29.77 
 
 
321 aa  96.3  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.016553  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2487  tRNA pseudouridine synthase B  35.27 
 
 
307 aa  96.3  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1764  tRNA pseudouridine synthase B  29.77 
 
 
302 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2136  tRNA pseudouridine synthase B  34.62 
 
 
338 aa  95.5  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0388744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>