More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0985 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0961  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  99.1 
 
 		 333 aa  672    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1720  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  98.49 
 
 		 333 aa  669    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0985  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  100 
 
 		 333 aa  681    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0128242  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0988  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  83.89 
 
 		 359 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1222  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  68.79 
 
 		 331 aa  483  1e-135  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0028  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  52.2 
 
 		 331 aa  338  9e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000488795  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0082  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  50 
 
 		 338 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1702  putative rRNA pseudouridine synthase  49.52 
 
 		 321 aa  323  2e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.438885  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0155  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  47.96 
 
 		 335 aa  322  4e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0461  putative rRNA pseudouridine synthase  48.74 
 
 		 338 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0089  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  44.31 
 
 		 331 aa  298  6e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0054  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.69 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0538  pseudouridylate synthase  52.04 
 
 		 302 aa  291  1e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0902248  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0080  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  44 
 
 		 331 aa  291  1e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1494  pseudouridylate synthase TruB domain protein  50.51 
 
 		 286 aa  288  7e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1128  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.48 
 
 		 328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000787218 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0406  pseudouridylate synthase subunit TruB  41.39 
 
 		 332 aa  268  1e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.189117 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08851  Centromere/microtubule-binding protein CBF5 (Centromere-binding factor 5)(Small nucleolar RNP protein CBF5)(H/ACA snoRNP protein CBF5)(rRNA pseudouridine synthase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O43100]  46.13 
 
 		 481 aa  266  4e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.842396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64832  nucleolar pseuduridine synthase and putative microtubule binding protein  45.17 
 
 		 475 aa  262  4.999999999999999e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02940  centromere/microtubule binding protein cbf5, putative  43.17 
 
 		 503 aa  256  3e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.701159  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0513  pseudouridylate synthase  43.28 
 
 		 322 aa  249  3e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2750  pseudouridylate synthase TruB domain protein  43.96 
 
 		 299 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20773  predicted protein  42.72 
 
 		 484 aa  243  5e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2268  pseudouridylate synthase  43.43 
 
 		 310 aa  238  6.999999999999999e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.570966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30197  predicted protein  39.53 
 
 		 411 aa  227  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2322  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  40.68 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.713223  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1733  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  41.53 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.17014 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2256  pseudouridylate synthase TruB domain protein  41.52 
 
 		 304 aa  219  6e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1812  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  39.24 
 
 		 343 aa  217  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.572421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0072  hypothetical protein  40.93 
 
 		 282 aa  212  9e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00484212 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0271  pseudouridylate synthase TruB domain protein  37.54 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1369  pseudouridylate synthase TruB domain protein  43.15 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.862548  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0057  PUA domain-containing protein  44.3 
 
 		 233 aa  195  9e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.510728 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  38.2 
 
 		 304 aa  135  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1904  tRNA pseudouridine synthase B  33.46 
 
 		 310 aa  132  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000415787  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  32.97 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1306  tRNA pseudouridine synthase B  32.31 
 
 		 295 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000236822  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  33.86 
 
 		 305 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  33.46 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2978  tRNA pseudouridine synthase B  32.65 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.09603e-22 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  34.09 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  34.25 
 
 		 305 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  33.46 
 
 		 305 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1591  tRNA pseudouridine synthase B  33.83 
 
 		 304 aa  125  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00165016  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  32.62 
 
 		 303 aa  123  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  33.07 
 
 		 292 aa  122  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  29.19 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  33.6 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  33.62 
 
 		 306 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4488  tRNA pseudouridine synthase B  33.62 
 
 		 305 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140717  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1045  tRNA pseudouridine synthase B  29.62 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  33.9 
 
 		 305 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0059  tRNA pseudouridine synthase B  31.44 
 
 		 366 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1311  tRNA pseudouridine synthase B  36.68 
 
 		 249 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0354136  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  30.03 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4178  tRNA pseudouridine synthase B  32.77 
 
 		 305 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.224491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2609  tRNA pseudouridine synthase B  30.97 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1125  tRNA pseudouridine synthase B  29.23 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0084  tRNA pseudouridine synthase B  33.22 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  34.38 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05391  tRNA pseudouridine synthase B  36.19 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  30.71 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  30.71 
 
 		 304 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3630  tRNA pseudouridine synthase B  37.32 
 
 		 307 aa  112  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.326344  normal  0.032374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4620  tRNA pseudouridine synthase B  30.77 
 
 		 335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29706  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2293  tRNA pseudouridine synthase B  28.74 
 
 		 299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  34.6 
 
 		 293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0438  tRNA pseudouridine synthase B  31.5 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  32.79 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0612  tRNA pseudouridine synthase B  28.19 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.259864  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0229  tRNA pseudouridine synthase B  31.1 
 
 		 368 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00860319  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3725  tRNA pseudouridine synthase B  30.98 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0838427 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0903  pseudouridylate synthase  30.57 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0033  tRNA pseudouridine synthase B  32.16 
 
 		 412 aa  110  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1747  tRNA pseudouridine synthase B  28.57 
 
 		 304 aa  110  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108245  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0482  tRNA pseudouridine synthase B  32.02 
 
 		 387 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.266724  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  31.76 
 
 		 307 aa  109  8.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0838  tRNA pseudouridine synthase B  28.73 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0026  tRNA pseudouridine synthase B  31.01 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_002936  DET0981  tRNA pseudouridine synthase B  29.53 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  29.55 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1108  tRNA pseudouridine synthase B  34.98 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.610694  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0629  tRNA pseudouridine synthase B  29.03 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2922  tRNA pseudouridine synthase B  34.57 
 
 		 301 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680034  normal  0.150523 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0745  tRNA pseudouridine synthase B  34.38 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.555354  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01305  tRNA pseudouridine synthase B  30.4 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.19887  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  27.5 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0603  tRNA pseudouridine synthase B  31.1 
 
 		 351 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1655  tRNA pseudouridine synthase B  31.3 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2073  tRNA pseudouridine synthase B  30.08 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.427039 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  27.95 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  32.09 
 
 		 314 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  30.85 
 
 		 295 aa  106  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3042  tRNA pseudouridine synthase B  34.3 
 
 		 304 aa  106  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.877322 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  33.02 
 
 		 294 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3932  tRNA pseudouridine synthase B  30.62 
 
 		 312 aa  105  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.138388  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  30.31 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1256  tRNA pseudouridine synthase B  29.18 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1357  tRNA pseudouridine synthase B  30.08 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.531893  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0816  tRNA pseudouridine synthase B  29.41 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0170651  normal  0.0612098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>