More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0988 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0988  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  100 
 
 
359 aa  733    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0961  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  84.92 
 
 
333 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0985  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  83.89 
 
 
333 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0128242  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1720  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  84.31 
 
 
333 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1222  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  67.27 
 
 
331 aa  476  1e-133  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0028  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  51.26 
 
 
331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000488795  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1702  putative rRNA pseudouridine synthase  51.11 
 
 
321 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.438885  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0082  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  49.69 
 
 
338 aa  327  3e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576501  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0461  putative rRNA pseudouridine synthase  48.16 
 
 
338 aa  316  4e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0155  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  47.5 
 
 
335 aa  312  4.999999999999999e-84  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0089  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  45.06 
 
 
331 aa  296  3e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1494  pseudouridylate synthase TruB domain protein  49.32 
 
 
286 aa  295  7e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0054  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.21 
 
 
333 aa  288  8e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0080  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.52 
 
 
331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1128  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.93 
 
 
328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000787218 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08851  Centromere/microtubule-binding protein CBF5 (Centromere-binding factor 5)(Small nucleolar RNP protein CBF5)(H/ACA snoRNP protein CBF5)(rRNA pseudouridine synthase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O43100]  46.25 
 
 
481 aa  277  2e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.842396  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0538  pseudouridylate synthase  50.34 
 
 
302 aa  276  5e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0902248  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64832  nucleolar pseuduridine synthase and putative microtubule binding protein  44.38 
 
 
475 aa  272  8.000000000000001e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02940  centromere/microtubule binding protein cbf5, putative  44.1 
 
 
503 aa  271  9e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.701159  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0406  pseudouridylate synthase subunit TruB  42.95 
 
 
332 aa  271  2e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20773  predicted protein  40.93 
 
 
484 aa  248  1e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2750  pseudouridylate synthase TruB domain protein  43.39 
 
 
299 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2322  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  42.37 
 
 
295 aa  237  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.713223  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2256  pseudouridylate synthase TruB domain protein  42.52 
 
 
304 aa  236  4e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2268  pseudouridylate synthase  42.01 
 
 
310 aa  232  9e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.570966  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1733  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  42.38 
 
 
299 aa  231  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.17014 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30197  predicted protein  40.81 
 
 
411 aa  231  1e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0513  pseudouridylate synthase  42.43 
 
 
322 aa  231  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0271  pseudouridylate synthase TruB domain protein  40.13 
 
 
314 aa  226  5.0000000000000005e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1812  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  40.76 
 
 
343 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.572421  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1369  pseudouridylate synthase TruB domain protein  42.74 
 
 
251 aa  208  1e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.862548  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0072  hypothetical protein  43.08 
 
 
282 aa  206  6e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00484212 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0057  PUA domain-containing protein  42.11 
 
 
233 aa  186  7e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.510728 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  35.98 
 
 
302 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  36.02 
 
 
304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  34.75 
 
 
305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  34.59 
 
 
302 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  34.36 
 
 
305 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  34.36 
 
 
305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1904  tRNA pseudouridine synthase B  33.07 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000415787  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  30.13 
 
 
310 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2978  tRNA pseudouridine synthase B  34.26 
 
 
295 aa  125  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.09603e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1306  tRNA pseudouridine synthase B  32.95 
 
 
295 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000236822  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1591  tRNA pseudouridine synthase B  31.97 
 
 
304 aa  123  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00165016  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0838  tRNA pseudouridine synthase B  32.13 
 
 
305 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4488  tRNA pseudouridine synthase B  34.89 
 
 
305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140717  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  32.97 
 
 
303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  35.17 
 
 
305 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  35.71 
 
 
297 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  31.76 
 
 
304 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  33.33 
 
 
305 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  34.7 
 
 
292 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4178  tRNA pseudouridine synthase B  33.62 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.224491  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  34.47 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1125  tRNA pseudouridine synthase B  30 
 
 
303 aa  117  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0059  tRNA pseudouridine synthase B  31.06 
 
 
366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1357  tRNA pseudouridine synthase B  32.17 
 
 
305 aa  116  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.531893  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1331  tRNA pseudouridine synthase B  32.17 
 
 
305 aa  116  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  31.02 
 
 
301 aa  116  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  34.55 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01305  tRNA pseudouridine synthase B  31.2 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.19887  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  31.56 
 
 
295 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  30.5 
 
 
304 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  28.17 
 
 
309 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  30.5 
 
 
304 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1311  tRNA pseudouridine synthase B  37.56 
 
 
249 aa  113  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0354136  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0084  tRNA pseudouridine synthase B  32.53 
 
 
302 aa  113  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2609  tRNA pseudouridine synthase B  31.5 
 
 
354 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0816  tRNA pseudouridine synthase B  34.55 
 
 
297 aa  112  8.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0170651  normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0033  tRNA pseudouridine synthase B  30.83 
 
 
412 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4620  tRNA pseudouridine synthase B  31.82 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29706  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  35.05 
 
 
314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  29.92 
 
 
307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  33.02 
 
 
313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0229  tRNA pseudouridine synthase B  31.23 
 
 
368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00860319  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1747  tRNA pseudouridine synthase B  30.12 
 
 
304 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108245  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  30.08 
 
 
300 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0438  tRNA pseudouridine synthase B  30.83 
 
 
366 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0603  tRNA pseudouridine synthase B  31.23 
 
 
351 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3630  tRNA pseudouridine synthase B  33.33 
 
 
307 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.326344  normal  0.032374 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  33.64 
 
 
294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  31.97 
 
 
307 aa  110  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1144  tRNA pseudouridine synthase B  31.14 
 
 
315 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.105946 
 
 
-
 
NC_002936  DET0981  tRNA pseudouridine synthase B  28.4 
 
 
300 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  28.02 
 
 
300 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05391  tRNA pseudouridine synthase B  36.19 
 
 
323 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2750  tRNA pseudouridine synthase B  37.62 
 
 
318 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2293  tRNA pseudouridine synthase B  31.05 
 
 
299 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1655  tRNA pseudouridine synthase B  30.77 
 
 
294 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0903  pseudouridylate synthase  30.94 
 
 
299 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  33.64 
 
 
314 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3849  tRNA pseudouridine synthase B  30.59 
 
 
371 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0712752  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1054  tRNA pseudouridine synthase B  36.23 
 
 
290 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156302  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  30.11 
 
 
310 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  29.74 
 
 
310 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3725  tRNA pseudouridine synthase B  30.2 
 
 
342 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0838427 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  32.21 
 
 
306 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1105  tRNA pseudouridine synthase B  28.67 
 
 
313 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  32.06 
 
 
311 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  30.48 
 
 
310 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0346238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>