More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_64832 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001303  ANIA_08851  Centromere/microtubule-binding protein CBF5 (Centromere-binding factor 5)(Small nucleolar RNP protein CBF5)(H/ACA snoRNP protein CBF5)(rRNA pseudouridine synthase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O43100]  70.56 
 
 		 481 aa  652    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.842396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64832  nucleolar pseuduridine synthase and putative microtubule binding protein  100 
 
 		 475 aa  969    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02940  centromere/microtubule binding protein cbf5, putative  77.08 
 
 		 503 aa  653    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.701159  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20773  predicted protein  65.16 
 
 		 484 aa  605  9.999999999999999e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30197  predicted protein  73.5 
 
 		 411 aa  536  1e-151  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0461  putative rRNA pseudouridine synthase  44.69 
 
 		 338 aa  290  6e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1702  putative rRNA pseudouridine synthase  47.06 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.438885  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0082  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.79 
 
 		 338 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0988  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  44.51 
 
 		 359 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0028  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.14 
 
 		 331 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000488795  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0961  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  45.17 
 
 		 333 aa  263  4e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0985  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  45.17 
 
 		 333 aa  263  6.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0128242  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1720  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  44.86 
 
 		 333 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0155  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  42.48 
 
 		 335 aa  252  1e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0054  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  41.75 
 
 		 333 aa  243  6e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0406  pseudouridylate synthase subunit TruB  40.79 
 
 		 332 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1222  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  40.19 
 
 		 331 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0089  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  39.81 
 
 		 331 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0080  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  40.2 
 
 		 331 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1128  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  38.75 
 
 		 328 aa  231  2e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000787218 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1369  pseudouridylate synthase TruB domain protein  40.82 
 
 		 251 aa  210  5e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.862548  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1494  pseudouridylate synthase TruB domain protein  39.12 
 
 		 286 aa  207  3e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2268  pseudouridylate synthase  39.94 
 
 		 310 aa  207  4e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.570966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0538  pseudouridylate synthase  40.07 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0902248  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2322  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  36.49 
 
 		 295 aa  196  7e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.713223  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0513  pseudouridylate synthase  37.41 
 
 		 322 aa  188  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2750  pseudouridylate synthase TruB domain protein  40 
 
 		 299 aa  188  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1733  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  35.29 
 
 		 299 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.17014 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2256  pseudouridylate synthase TruB domain protein  36.61 
 
 		 304 aa  179  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0057  PUA domain-containing protein  41.38 
 
 		 233 aa  178  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.510728 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0072  hypothetical protein  40.47 
 
 		 282 aa  177  4e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00484212 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1812  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  35.5 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.572421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0271  pseudouridylate synthase TruB domain protein  33.12 
 
 		 314 aa  162  9e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  31.89 
 
 		 302 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  33.47 
 
 		 294 aa  114  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  31.53 
 
 		 302 aa  113  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1512  tRNA pseudouridine synthase B  36.76 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.467082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  30.74 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  29.81 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  33.78 
 
 		 336 aa  107  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  29.78 
 
 		 309 aa  107  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0565  tRNA pseudouridine synthase B  28.52 
 
 		 309 aa  103  6e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1331  tRNA pseudouridine synthase B  29.18 
 
 		 305 aa  103  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1357  tRNA pseudouridine synthase B  29.18 
 
 		 305 aa  103  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.531893  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  29.06 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  29.06 
 
 		 307 aa  103  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  28.68 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  33.66 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  27.92 
 
 		 307 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  27.92 
 
 		 307 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  32.2 
 
 		 314 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  29.06 
 
 		 307 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  29.06 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  29.06 
 
 		 307 aa  101  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3031  tRNA pseudouridine synthase B  30.42 
 
 		 303 aa  101  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0287  tRNA pseudouridine synthase B  31.17 
 
 		 367 aa  100  5e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2992  tRNA pseudouridine synthase B  34.31 
 
 		 321 aa  100  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  28.68 
 
 		 307 aa  100  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0998  tRNA pseudouridine synthase B  29.49 
 
 		 294 aa  100  7e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0507198  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  33.5 
 
 		 293 aa  100  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08010  tRNA pseudouridine 55 synthase  31.29 
 
 		 340 aa  100  7e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.608305 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1432  tRNA pseudouridine synthase B  34.27 
 
 		 322 aa  100  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000149867 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  29.06 
 
 		 307 aa  100  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1237  tRNA pseudouridine synthase B  30.1 
 
 		 330 aa  99.8  9e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.657883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  31.28 
 
 		 297 aa  99.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5115  tRNA pseudouridine synthase B  33.66 
 
 		 310 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.0750927 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  34.83 
 
 		 295 aa  99.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1598  tRNA pseudouridine synthase B  28.14 
 
 		 309 aa  99  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00177839  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4028  tRNA pseudouridine synthase B  28.74 
 
 		 294 aa  99  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  33.49 
 
 		 299 aa  99  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3589  tRNA pseudouridine synthase B  33.82 
 
 		 295 aa  99  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0304508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1727  tRNA pseudouridine synthase B  32.59 
 
 		 297 aa  99  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  31.38 
 
 		 309 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  29.37 
 
 		 299 aa  97.8  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  31.71 
 
 		 314 aa  97.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1000  tRNA pseudouridine synthase B  30.46 
 
 		 280 aa  97.4  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.263341  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  32.35 
 
 		 313 aa  97.1  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  34.67 
 
 		 304 aa  96.7  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2078  tRNA pseudouridine synthase B  29.66 
 
 		 297 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0804076  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2095  tRNA pseudouridine synthase B  29.66 
 
 		 297 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2141  tRNA pseudouridine synthase B  29.66 
 
 		 297 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.024046 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2009  tRNA pseudouridine synthase B  32.09 
 
 		 347 aa  96.7  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.845229  normal  0.607065 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10340  tRNA pseudouridine synthase B  31.74 
 
 		 318 aa  96.7  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182635  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  29.23 
 
 		 310 aa  96.7  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0838  tRNA pseudouridine synthase B  26.97 
 
 		 305 aa  96.3  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  28.05 
 
 		 322 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  28.87 
 
 		 310 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  28.87 
 
 		 310 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  28.87 
 
 		 310 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  31.9 
 
 		 297 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  33.5 
 
 		 302 aa  95.9  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2029  tRNA pseudouridine synthase B  32.59 
 
 		 314 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1306  tRNA pseudouridine synthase B  31.86 
 
 		 295 aa  95.5  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000236822  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  33.66 
 
 		 306 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  30 
 
 		 302 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2750  tRNA pseudouridine synthase B  32.11 
 
 		 318 aa  94.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  30.96 
 
 		 306 aa  94.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  29.17 
 
 		 300 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  29.28 
 
 		 307 aa  94.7  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  32.39 
 
 		 304 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>