More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0513 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0513  pseudouridylate synthase  100 
 
 		 322 aa  655    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2750  pseudouridylate synthase TruB domain protein  65.62 
 
 		 299 aa  380  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0538  pseudouridylate synthase  63.45 
 
 		 302 aa  373  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0902248  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0072  hypothetical protein  53.76 
 
 		 282 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00484212 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2268  pseudouridylate synthase  52.17 
 
 		 310 aa  295  7e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.570966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0082  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  45.85 
 
 		 338 aa  279  6e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0461  putative rRNA pseudouridine synthase  46.2 
 
 		 338 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1702  putative rRNA pseudouridine synthase  46.58 
 
 		 321 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.438885  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0985  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.28 
 
 		 333 aa  253  3e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0128242  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1720  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.42 
 
 		 333 aa  252  6e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0961  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.42 
 
 		 333 aa  252  6e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0155  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.49 
 
 		 335 aa  250  3e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0028  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.06 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000488795  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0089  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.1 
 
 		 331 aa  236  3e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0988  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  42.43 
 
 		 359 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1222  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  42.19 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1128  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  41.78 
 
 		 328 aa  229  6e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000787218 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0080  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  42.36 
 
 		 331 aa  226  3e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0406  pseudouridylate synthase subunit TruB  42.56 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0054  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  41.08 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1494  pseudouridylate synthase TruB domain protein  44.84 
 
 		 286 aa  216  5e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1369  pseudouridylate synthase TruB domain protein  41.63 
 
 		 251 aa  210  3e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.862548  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2322  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  44.1 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.713223  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20773  predicted protein  38.7 
 
 		 484 aa  195  9e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08851  Centromere/microtubule-binding protein CBF5 (Centromere-binding factor 5)(Small nucleolar RNP protein CBF5)(H/ACA snoRNP protein CBF5)(rRNA pseudouridine synthase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O43100]  39.12 
 
 		 481 aa  191  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.842396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1812  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  42.98 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.572421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64832  nucleolar pseuduridine synthase and putative microtubule binding protein  37.54 
 
 		 475 aa  188  1e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1733  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.21 
 
 		 299 aa  186  5e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.17014 
 
 
-
 
NC_006686  CND02940  centromere/microtubule binding protein cbf5, putative  37.67 
 
 		 503 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.701159  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0057  PUA domain-containing protein  40.77 
 
 		 233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.510728 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2256  pseudouridylate synthase TruB domain protein  38.87 
 
 		 304 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0271  pseudouridylate synthase TruB domain protein  34.3 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30197  predicted protein  39.46 
 
 		 411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1694  tRNA pseudouridine synthase B  35.91 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00112277  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  33.9 
 
 		 310 aa  123  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  32.41 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  32.41 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  32.41 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3031  tRNA pseudouridine synthase B  35.8 
 
 		 303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  32.71 
 
 		 306 aa  119  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  34.29 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  33.58 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  31.82 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1311  tRNA pseudouridine synthase B  36.32 
 
 		 249 aa  116  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0354136  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4488  tRNA pseudouridine synthase B  31.38 
 
 		 305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140717  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  35.07 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  32.46 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  33.21 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  31.38 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4178  tRNA pseudouridine synthase B  31.38 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.224491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  33.46 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  35 
 
 		 304 aa  112  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  30.23 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  32.28 
 
 		 309 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0629  tRNA pseudouridine synthase B  28.72 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0159  tRNA pseudouridine synthase B  31.13 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  30.42 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  31.62 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1862  tRNA pseudouridine synthase B  30.07 
 
 		 313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.552372  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1946  tRNA pseudouridine synthase B  33.59 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0313874 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  33.73 
 
 		 310 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  31.76 
 
 		 310 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  31.76 
 
 		 310 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  28.96 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0612  tRNA pseudouridine synthase B  29.53 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.259864  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1727  tRNA pseudouridine synthase B  32.96 
 
 		 309 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.577271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  30 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1634  tRNA pseudouridine synthase B  33.96 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.767781  hitchhiker  0.000962415 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1005  tRNA pseudouridine synthase B  32.56 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319279  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  31.25 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  30.48 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1031  tRNA pseudouridine synthase B  30.28 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2818  tRNA pseudouridine synthase B  26.9 
 
 		 303 aa  106  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0059  tRNA pseudouridine synthase B  32.16 
 
 		 366 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0600  tRNA pseudouridine synthase B  29.76 
 
 		 318 aa  105  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1512  tRNA pseudouridine synthase B  37.44 
 
 		 303 aa  105  9e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.467082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0069  tRNA pseudouridine synthase B  29.1 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00601892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0033  tRNA pseudouridine synthase B  32.43 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  30 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1692  tRNA pseudouridine synthase B  29.25 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0229  tRNA pseudouridine synthase B  32.42 
 
 		 368 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00860319  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3932  tRNA pseudouridine synthase B  32.94 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.138388  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1511  tRNA pseudouridine synthase B  27.27 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3728  tRNA pseudouridine synthase B  28.62 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124557  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3995  tRNA pseudouridine synthase B  28.62 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.866434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0438  tRNA pseudouridine synthase B  33.46 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1125  tRNA pseudouridine synthase B  26.94 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  32.64 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3594  tRNA pseudouridine synthase B  28.62 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0311816  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  32.56 
 
 		 293 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2203  tRNA pseudouridine synthase B  29.19 
 
 		 302 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.147231  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2321  tRNA pseudouridine synthase B  29.18 
 
 		 280 aa  103  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2687  tRNA pseudouridine synthase B  26.55 
 
 		 303 aa  102  8e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  31.18 
 
 		 299 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0026  tRNA pseudouridine synthase B  32.68 
 
 		 358 aa  102  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  32.68 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2118  tRNA pseudouridine synthase B  31.84 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206379  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0071  tRNA pseudouridine synthase B  29.79 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.861563  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0603  tRNA pseudouridine synthase B  32.03 
 
 		 351 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  27.17 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>