144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5745 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5745  Rhomboid family protein  100 
 
 		 207 aa  410  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3557  Rhomboid family protein  64.25 
 
 		 206 aa  263  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0460  rhomboid-like protein  49.51 
 
 		 204 aa  188  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0322234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3769  Rhomboid family protein  46.77 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0472391 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2666  Rhomboid family protein  45.81 
 
 		 208 aa  175  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0426657 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00672  peptidase, S54 (rhomboid) family  49.26 
 
 		 202 aa  173  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.271958  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1387  hypothetical protein  46.8 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0256989  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0099  Rhomboid family protein  42.64 
 
 		 205 aa  165  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.36939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1317  rhomboid family protein  46.8 
 
 		 202 aa  165  4e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.175415  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1367  Rhomboid family protein  45.23 
 
 		 205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.870184  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0278  rhomboid family protein  48.66 
 
 		 202 aa  161  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0305  rhomboid-like protein  48.13 
 
 		 230 aa  161  7e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0312  rhomboid family protein  46.52 
 
 		 206 aa  161  7e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000705799  hitchhiker  0.00414604 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6787  Rhomboid family protein  35.18 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132625 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13218  hypothetical protein  38.92 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2304  Rhomboid family protein  38.25 
 
 		 203 aa  115  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0147214  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1836  Rhomboid family protein  39.09 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.76231  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4502  rhomboid family protein  35.9 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0287  hypothetical protein  31.75 
 
 		 279 aa  102  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.742971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  34.2 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8424  predicted protein  31.76 
 
 		 160 aa  64.7  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.339927  normal  0.0315766 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  31.37 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  32.48 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  32.53 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  35.29 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  32.91 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1588  Rhomboid family protein  28.04 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  32.17 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  30.1 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  32.28 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  34.78 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  31.48 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  33.59 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1360  Rhomboid family protein  28.88 
 
 		 492 aa  55.8  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.165337  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 276 aa  54.7  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  35.48 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  35.77 
 
 		 292 aa  53.9  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  30.18 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  35.48 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  28.82 
 
 		 579 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  34.84 
 
 		 444 aa  53.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  31.48 
 
 		 264 aa  53.1  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0015  rhomboid family membrane protein  27.62 
 
 		 264 aa  52  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  29.88 
 
 		 283 aa  51.6  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1026  hypothetical protein  30.86 
 
 		 259 aa  51.2  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.877096  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  28.1 
 
 		 291 aa  51.6  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0711  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 515 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535917 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42743  predicted protein  30.14 
 
 		 669 aa  51.2  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599119  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  34.82 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2070  rhomboid family protein  25.42 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  30.63 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  37.11 
 
 		 342 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  34.41 
 
 		 342 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  33.33 
 
 		 264 aa  49.7  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  36.99 
 
 		 267 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  30.97 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0305  Rhomboid family protein  27.81 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000904763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  29.38 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  29.77 
 
 		 232 aa  49.3  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  29.19 
 
 		 252 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  57.14 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  37.63 
 
 		 283 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  27.52 
 
 		 198 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  34.83 
 
 		 369 aa  48.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  36.56 
 
 		 281 aa  48.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  27.17 
 
 		 226 aa  48.5  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  27.61 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0239  rhomboid family protein  34.21 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  26.35 
 
 		 486 aa  47  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  27.86 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3067  Rhomboid family protein  26.85 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00769632  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  31.07 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  27.63 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  29.45 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  37.5 
 
 		 356 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  27.63 
 
 		 229 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1764  Rhomboid family protein  32 
 
 		 274 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  25.95 
 
 		 252 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0830001 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  27.63 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  27.63 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  27.63 
 
 		 260 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  27.63 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  27.63 
 
 		 260 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03550  peptidase, S54 (rhomboid) family  28.24 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26597  predicted protein  30.23 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0296389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  27.33 
 
 		 234 aa  45.4  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  27.45 
 
 		 226 aa  45.4  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  25.15 
 
 		 487 aa  45.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  25.15 
 
 		 487 aa  45.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  25.47 
 
 		 265 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  38.82 
 
 		 279 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_002936  DET0132  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 190 aa  45.1  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47107  predicted protein  35.2 
 
 		 342 aa  45.1  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0432891  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0851  rhomboid family protein  33.9 
 
 		 241 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  29.08 
 
 		 519 aa  44.3  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  32.43 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  25.27 
 
 		 554 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  54.05 
 
 		 290 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  25.79 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>