More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1663 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  100 
 
 		 220 aa  436  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  98.18 
 
 		 220 aa  432  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  68.72 
 
 		 232 aa  294  8e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  71.84 
 
 		 224 aa  278  4e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1130  integral membrane protein  55.67 
 
 		 196 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  0.0126937 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  52.38 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  48.64 
 
 		 226 aa  192  4e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  48.61 
 
 		 228 aa  188  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  48.29 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  48.08 
 
 		 200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  46.12 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  45.73 
 
 		 276 aa  153  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  45 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  41.74 
 
 		 273 aa  148  6e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  43.81 
 
 		 197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  40.83 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  43.14 
 
 		 283 aa  144  8.000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  37.26 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  38.33 
 
 		 264 aa  141  6e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  39.58 
 
 		 198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  40.21 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  40 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  40 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  40 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  40 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  40 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  38.19 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  38.19 
 
 		 260 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  38.19 
 
 		 229 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1404  rhomboid family protein  41.05 
 
 		 238 aa  135  5e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.334243 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0482  Rhomboid family protein  36.84 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4542  Rhomboid family protein  43.59 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483276 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4409  Rhomboid family protein  43.59 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.824835 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07075  rhomboid family protein  28.34 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2146  Rhomboid family protein  33.17 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000095331  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0210  rhomboid family protein  28.74 
 
 		 249 aa  108  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5568  Rhomboid family protein  53.57 
 
 		 259 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  40.94 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  36.24 
 
 		 285 aa  99.8  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3810  Rhomboid family protein  51.04 
 
 		 261 aa  99  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.450903  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0633  hypothetical protein  46.23 
 
 		 263 aa  93.2  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 291 aa  91.3  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  33.18 
 
 		 265 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  32.2 
 
 		 230 aa  88.6  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  30.32 
 
 		 263 aa  87  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  34.09 
 
 		 261 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  35.95 
 
 		 279 aa  86.3  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0015  rhomboid family membrane protein  48.75 
 
 		 264 aa  84.7  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1155  rhomboid-like protein  41.22 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0861  Rhomboid family protein  42.37 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1730  rhomboid family protein  31.31 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0105821  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  34.53 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  29.74 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0228  Rhomboid family protein  30.81 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0326  Rhomboid family protein  29.76 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  34.97 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  31.07 
 
 		 444 aa  79.3  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  33.17 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  35.14 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  32.06 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  30.7 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1771  rhomboid-like protein  32.21 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.604427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3495  rhomboid family protein  33.01 
 
 		 297 aa  78.2  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  30.66 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1657  rhomboid family protein  30.3 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000107341  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  32.51 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  32.2 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  27.65 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  30.13 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  38.62 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  29.27 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  35.1 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  29.72 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0568  rhomboid family protein  32.12 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  31.72 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4278  Rhomboid family protein  31.78 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4331  rhomboid family protein  31.13 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  31.71 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1727  rhomboid family protein  29.94 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  28.07 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0830001 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  30.69 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  27.96 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1050  Rhomboid family protein  30.09 
 
 		 220 aa  72  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  29.82 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1812  Rhomboid family protein  34 
 
 		 237 aa  72  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00264176  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0851  rhomboid family protein  31.88 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  32.61 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  31.5 
 
 		 260 aa  71.6  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1200  rhomboid family protein  37.59 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.302256  normal  0.536903 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1165  rhomboid family protein  33.17 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00020927  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2900  rhomboid family protein  30.24 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.28632  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  30.33 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  35.71 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  27.68 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6787  Rhomboid family protein  34.06 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132625 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  31.68 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  27.7 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0999  Rhomboid family protein  33.77 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.46711  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0686  rhomboid family protein  28.64 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0078809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6620  Rhomboid family protein  34.19 
 
 		 292 aa  68.6  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000794004  hitchhiker  0.00987109 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>