193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1367 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1367  Rhomboid family protein  100 
 
 		 205 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.870184  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0312  rhomboid family protein  54.05 
 
 		 206 aa  216  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000705799  hitchhiker  0.00414604 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2666  Rhomboid family protein  53.43 
 
 		 208 aa  204  6e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0426657 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00672  peptidase, S54 (rhomboid) family  52.53 
 
 		 202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.271958  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1317  rhomboid family protein  50.51 
 
 		 202 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.175415  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0305  rhomboid-like protein  50.27 
 
 		 230 aa  194  6e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1387  hypothetical protein  50 
 
 		 202 aa  192  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0256989  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0278  rhomboid family protein  49.73 
 
 		 202 aa  192  4e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3769  Rhomboid family protein  47.31 
 
 		 203 aa  158  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0472391 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0460  rhomboid-like protein  43.5 
 
 		 204 aa  155  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0322234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3557  Rhomboid family protein  42.5 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5745  Rhomboid family protein  44.02 
 
 		 207 aa  150  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0099  Rhomboid family protein  38.86 
 
 		 205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.36939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4502  rhomboid family protein  37.36 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13218  hypothetical protein  42.76 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1836  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 208 aa  105  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.76231  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2304  Rhomboid family protein  41.83 
 
 		 203 aa  101  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0147214  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6787  Rhomboid family protein  33 
 
 		 280 aa  97.1  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132625 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0287  hypothetical protein  38.96 
 
 		 279 aa  95.5  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.742971  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  34.51 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  38.69 
 
 		 279 aa  71.6  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  32.18 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  34.71 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  37.5 
 
 		 444 aa  65.9  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  34.23 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  34.97 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  30.48 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  35.26 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  30.77 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  31.79 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  32.89 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  31.58 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  30.53 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  31.37 
 
 		 396 aa  58.9  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1588  Rhomboid family protein  32.94 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  31.69 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  46.27 
 
 		 290 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  31.58 
 
 		 276 aa  58.2  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  30.43 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  35.06 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  35.06 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  35.06 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  32.59 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  53.49 
 
 		 292 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1360  Rhomboid family protein  32.03 
 
 		 492 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.165337  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  30.77 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0482  Rhomboid family protein  32.95 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  34.48 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  34.48 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  34.48 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  34.48 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2337  rhomboid family protein  34.93 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.218198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  43.75 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05400  hypothetical protein  37.5 
 
 		 330 aa  55.5  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0369764  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0239  rhomboid family protein  37.61 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01372  rhomboid family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09150)  31.67 
 
 		 571 aa  55.1  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  34.27 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  30.14 
 
 		 265 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  39.45 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  30.5 
 
 		 278 aa  54.7  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1155  rhomboid-like protein  34.81 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  35.48 
 
 		 303 aa  53.9  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  41.38 
 
 		 279 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  38.89 
 
 		 246 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  36 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  33.57 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  32.88 
 
 		 224 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  35.48 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  46.38 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  30.06 
 
 		 263 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_002936  DET0132  rhomboid family protein  36.7 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  30 
 
 		 223 aa  52  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  33.64 
 
 		 291 aa  52  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  30.22 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  34.06 
 
 		 292 aa  51.6  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0305  Rhomboid family protein  34.78 
 
 		 230 aa  51.6  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000904763 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  29.22 
 
 		 261 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  32.35 
 
 		 232 aa  50.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1021  rhomboid family protein  31 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0537483  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8424  predicted protein  30.71 
 
 		 160 aa  50.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.339927  normal  0.0315766 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  29.07 
 
 		 523 aa  50.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  35.77 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0953  Rhomboid family protein  32.17 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00030487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  30.41 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1083  rhomboid family protein  30 
 
 		 172 aa  50.1  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.400512  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  41.76 
 
 		 239 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  33.06 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  36.17 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0916  rhomboid-like protein  36.73 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4542  Rhomboid family protein  36.42 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483276 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4409  Rhomboid family protein  36.42 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.824835 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4331  rhomboid family protein  36.51 
 
 		 232 aa  48.9  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03550  peptidase, S54 (rhomboid) family  30.46 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  28.03 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  31.39 
 
 		 342 aa  48.5  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  30.66 
 
 		 342 aa  48.5  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  27.43 
 
 		 235 aa  48.5  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  32.05 
 
 		 264 aa  48.5  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  27.43 
 
 		 235 aa  48.5  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>