182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_8424 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009357  OSTLU_8424  predicted protein  100 
 
 		 160 aa  325  2.0000000000000001e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.339927  normal  0.0315766 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0312  rhomboid family protein  34.48 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000705799  hitchhiker  0.00414604 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13218  hypothetical protein  33.59 
 
 		 216 aa  67.4  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  39.8 
 
 		 230 aa  67  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5745  Rhomboid family protein  31.76 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0278  rhomboid family protein  34.43 
 
 		 202 aa  64.3  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0305  rhomboid-like protein  34.43 
 
 		 230 aa  63.9  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4502  rhomboid family protein  30.63 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0460  rhomboid-like protein  34.75 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0322234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  33.91 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  33.6 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  37.38 
 
 		 444 aa  61.2  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  35.94 
 
 		 211 aa  60.8  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  32.8 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  32.09 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  36.94 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01372  rhomboid family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09150)  31.54 
 
 		 571 aa  58.5  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05400  hypothetical protein  29.88 
 
 		 330 aa  58.2  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0369764  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3557  Rhomboid family protein  31.17 
 
 		 206 aa  57.4  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  34.15 
 
 		 246 aa  57.4  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  39.77 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  30.77 
 
 		 487 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  30.77 
 
 		 487 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  28.57 
 
 		 486 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00672  peptidase, S54 (rhomboid) family  31.08 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.271958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  34.41 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1771  rhomboid-like protein  25.6 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.604427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  33.33 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_6645  predicted protein  32.39 
 
 		 325 aa  54.7  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0872317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6787  Rhomboid family protein  28.12 
 
 		 280 aa  54.3  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132625 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7801  hypothetical protein  35.04 
 
 		 245 aa  54.7  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.990932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2965  Rhomboid family protein  32.8 
 
 		 318 aa  54.7  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.58204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  31.78 
 
 		 260 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2451  Rhomboid family protein  34.58 
 
 		 326 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  32.77 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3769  Rhomboid family protein  28.79 
 
 		 203 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0472391 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  36.96 
 
 		 198 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  33.88 
 
 		 252 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  31.03 
 
 		 220 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0239  rhomboid family protein  31.09 
 
 		 190 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  36.96 
 
 		 198 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2486  Rhomboid family protein  29.2 
 
 		 240 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19288  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1635  rhomboid family protein  32.97 
 
 		 252 aa  51.2  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0132  rhomboid family protein  33.62 
 
 		 190 aa  51.2  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  33.02 
 
 		 232 aa  50.8  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0711  Rhomboid family protein  32.29 
 
 		 515 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535917 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  30.16 
 
 		 239 aa  50.8  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1387  hypothetical protein  31.29 
 
 		 202 aa  50.8  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0256989  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1367  Rhomboid family protein  30.71 
 
 		 205 aa  50.8  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.870184  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2666  Rhomboid family protein  27.08 
 
 		 208 aa  50.8  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0426657 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1317  rhomboid family protein  31.29 
 
 		 202 aa  50.8  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.175415  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0883  rhomboid family protein  30.08 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  33.02 
 
 		 263 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  39.13 
 
 		 247 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  34.11 
 
 		 220 aa  50.4  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  33.01 
 
 		 273 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  31.37 
 
 		 207 aa  49.7  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2304  Rhomboid family protein  34.23 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0147214  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0987  rhomboid-like protein  32.8 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.769886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0228  Rhomboid family protein  32.11 
 
 		 237 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 220 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0686  rhomboid family protein  30.82 
 
 		 231 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0078809 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1200  rhomboid family protein  31.85 
 
 		 258 aa  48.9  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.302256  normal  0.536903 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  26.92 
 
 		 236 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5597  Rhomboid family protein  28.1 
 
 		 371 aa  48.5  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  32.69 
 
 		 279 aa  48.1  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  36.84 
 
 		 291 aa  48.1  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  27.13 
 
 		 211 aa  47.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1696  rhomboid-like protein  34.07 
 
 		 256 aa  47.8  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0169703  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  31.65 
 
 		 231 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  28.05 
 
 		 229 aa  47.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  32 
 
 		 519 aa  47.8  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  30.7 
 
 		 278 aa  47.8  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  30.23 
 
 		 227 aa  47.8  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0953  Rhomboid family protein  31.07 
 
 		 218 aa  47.4  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00030487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0440  rhomboid family protein  32.52 
 
 		 209 aa  47.4  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0337816  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1404  rhomboid family protein  29.91 
 
 		 238 aa  47  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.334243 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  30.43 
 
 		 267 aa  47  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  30.17 
 
 		 283 aa  47  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2713  Rhomboid family protein  27.64 
 
 		 227 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  36.14 
 
 		 554 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  31.73 
 
 		 237 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  34.12 
 
 		 342 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0568  rhomboid family protein  32.69 
 
 		 249 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  34.09 
 
 		 290 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  37.29 
 
 		 303 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  35.59 
 
 		 303 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35318  predicted protein  30 
 
 		 327 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  31.5 
 
 		 198 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0851  rhomboid family protein  28.1 
 
 		 241 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1083  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.400512  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  30.95 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  31.31 
 
 		 264 aa  46.6  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1151  rhomboid-like protein  28.23 
 
 		 240 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000385696  normal  0.159732 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  33.96 
 
 		 273 aa  46.6  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4331  rhomboid family protein  29.79 
 
 		 232 aa  46.2  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  34.12 
 
 		 342 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  27.5 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1021  rhomboid family protein  32.98 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0537483  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2900  rhomboid family protein  27.69 
 
 		 215 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.28632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>