132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2965 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2965  Rhomboid family protein  100 
 
 		 318 aa  628  1e-179  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.58204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2451  Rhomboid family protein  58.92 
 
 		 326 aa  356  2.9999999999999997e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  59.41 
 
 		 310 aa  342  5.999999999999999e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1128  Rhomboid family protein  52.94 
 
 		 319 aa  278  1e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0599  AN1-type Zinc finger protein  45.72 
 
 		 321 aa  242  5e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.715069  normal  0.614872 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  26.67 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3064  Rhomboid family protein  31.71 
 
 		 219 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  32.16 
 
 		 205 aa  75.1  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  29.38 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  27.7 
 
 		 264 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  32.24 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2518  Rhomboid family protein  29.44 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  29.44 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  31.36 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0830001 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2282  Allergen V5/Tpx-1 family protein  52.38 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0851  rhomboid family protein  31.75 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0016  hypothetical protein  28.21 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3809  Rhomboid family protein  31.58 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  29.22 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  33.85 
 
 		 444 aa  59.7  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5567  Rhomboid family protein  31.4 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  29.61 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  29.75 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  33.73 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  30.65 
 
 		 239 aa  57  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0788  Rhomboid family protein  31.61 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  29.36 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0239  rhomboid family protein  36.03 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1090  rhomboid family protein  29.73 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  29.36 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0132  rhomboid family protein  36.76 
 
 		 190 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1021  rhomboid family protein  37.11 
 
 		 172 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0537483  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1458  Rhomboid family protein  30.32 
 
 		 211 aa  55.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2949  AN1-type Zinc finger protein  50 
 
 		 90 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  30.11 
 
 		 264 aa  55.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0917  rhomboid family protein  30.92 
 
 		 177 aa  54.7  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  28.95 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0786  rhomboid family protein  37.11 
 
 		 172 aa  54.3  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.169699  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1151  rhomboid-like protein  30.82 
 
 		 240 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000385696  normal  0.159732 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07080  putative transmembrane rhomboid family protein  26.89 
 
 		 299 aa  53.9  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8424  predicted protein  32.8 
 
 		 160 aa  53.5  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.339927  normal  0.0315766 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1787  AN1-type Zinc finger protein  38.6 
 
 		 73 aa  53.1  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_6645  predicted protein  31.25 
 
 		 325 aa  52.8  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0872317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  34.81 
 
 		 224 aa  52.8  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  24.83 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  37.27 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1083  rhomboid family protein  35.05 
 
 		 172 aa  51.2  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.400512  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  32.09 
 
 		 226 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2261  Zinc finger, AN1-type  53.85 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0860  Rhomboid family protein  31.15 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0482  Rhomboid family protein  30.73 
 
 		 241 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  32.21 
 
 		 197 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002143  protein GlpG  33.77 
 
 		 280 aa  50.8  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00412305  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  32.05 
 
 		 224 aa  50.8  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0732  conserved hypothetical integral membrane protein, Rhomboid family  32.47 
 
 		 176 aa  51.2  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000749647  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1404  rhomboid family protein  31.29 
 
 		 238 aa  50.4  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.334243 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0568  rhomboid family protein  32.43 
 
 		 249 aa  50.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  28.75 
 
 		 273 aa  50.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  28.67 
 
 		 220 aa  50.1  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  31.93 
 
 		 227 aa  50.1  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  26.07 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  29.27 
 
 		 234 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  28.36 
 
 		 360 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  28.36 
 
 		 360 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  28.27 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0686  rhomboid family protein  31.32 
 
 		 231 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0078809 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  31.01 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1263  peptidase E  26.99 
 
 		 191 aa  48.1  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  22.49 
 
 		 396 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  31.65 
 
 		 232 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0312  intramembrane serine protease GlpG  27.75 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3067  Rhomboid family protein  27.39 
 
 		 248 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00769632  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  28.16 
 
 		 228 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  26.47 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  30.84 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  31.76 
 
 		 201 aa  47.4  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  29.24 
 
 		 267 aa  47.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05400  hypothetical protein  30.53 
 
 		 330 aa  47.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0369764  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1489  rhomboid-like protein  31.79 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.726859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1225  regulatory proteins, IclR  34.67 
 
 		 249 aa  47.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0542278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  29.87 
 
 		 252 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00275  peptidase  31.13 
 
 		 280 aa  47  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  30.59 
 
 		 260 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02331  hypothetical protein  30.61 
 
 		 197 aa  46.2  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930848 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1002  Rhomboid family protein  34.78 
 
 		 200 aa  45.8  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.873632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00672  peptidase, S54 (rhomboid) family  32.73 
 
 		 202 aa  45.8  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.271958  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  28.08 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0458  Zinc finger, AN1-type  40.91 
 
 		 111 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0460  rhomboid-like protein  29.38 
 
 		 204 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0322234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  30 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0209  rhomboid family protein  25.15 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2417  glpG protein  32.52 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140187  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  26.29 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3495  rhomboid family protein  29.56 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03550  peptidase, S54 (rhomboid) family  31.4 
 
 		 214 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  35.87 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13218  hypothetical protein  29.75 
 
 		 216 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  28.78 
 
 		 237 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  26.83 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  28.74 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>