183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0788 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0788  Rhomboid family protein  100 
 
 		 288 aa  572  1.0000000000000001e-162  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  36.18 
 
 		 279 aa  92  9e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3067  Rhomboid family protein  32.45 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00769632  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  32.69 
 
 		 209 aa  68.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  30.77 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  29.45 
 
 		 207 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  31.13 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  30.56 
 
 		 444 aa  65.5  0.0000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  27.42 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  31.76 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  28.74 
 
 		 224 aa  62  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0277  Rhomboid family protein  32.41 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499185  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  28.4 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  31.11 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  35.1 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  28.1 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  29.93 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1026  hypothetical protein  29.25 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.877096  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  29.63 
 
 		 220 aa  58.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3140  Rhomboid family protein  27.59 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  31.93 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1489  rhomboid-like protein  32.24 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.726859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2965  Rhomboid family protein  32.26 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.58204  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  33.09 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5597  Rhomboid family protein  23.24 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  27.61 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0482  Rhomboid family protein  31.76 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  27.16 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  28.5 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  36.67 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  26.12 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  25 
 
 		 252 aa  55.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0015  rhomboid family membrane protein  42.35 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  29.41 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5568  Rhomboid family protein  38.71 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  26.64 
 
 		 356 aa  53.9  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  27.78 
 
 		 246 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  26.61 
 
 		 234 aa  53.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  29.93 
 
 		 226 aa  53.5  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  28.57 
 
 		 201 aa  53.5  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0132  rhomboid family protein  34.15 
 
 		 190 aa  52.8  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2451  Rhomboid family protein  29.09 
 
 		 326 aa  53.1  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0599  AN1-type Zinc finger protein  30.77 
 
 		 321 aa  53.1  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.715069  normal  0.614872 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  26.18 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  29.93 
 
 		 310 aa  52.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  31.75 
 
 		 279 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1263  Rhomboid family protein  37.08 
 
 		 245 aa  52.4  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03550  peptidase, S54 (rhomboid) family  22.52 
 
 		 214 aa  52.4  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  28.98 
 
 		 239 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3810  Rhomboid family protein  41.57 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.450903  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  26.32 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0064  rhomboid-like protein  29.93 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  32.32 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1727  rhomboid family protein  25.41 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  29.75 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0305  Rhomboid family protein  29.67 
 
 		 230 aa  50.8  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000904763 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4331  rhomboid family protein  35.87 
 
 		 232 aa  50.4  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  29.73 
 
 		 226 aa  50.8  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  26.24 
 
 		 265 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  26.96 
 
 		 291 aa  50.4  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  27.21 
 
 		 228 aa  49.7  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1130  integral membrane protein  32.03 
 
 		 196 aa  49.7  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  0.0126937 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0239  rhomboid family protein  31.71 
 
 		 190 aa  50.1  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  27.1 
 
 		 229 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  36.84 
 
 		 239 aa  49.7  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1657  rhomboid family protein  26.39 
 
 		 222 aa  49.3  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000107341  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  27.16 
 
 		 200 aa  49.3  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  27.95 
 
 		 236 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  26.54 
 
 		 263 aa  48.9  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2304  Rhomboid family protein  31.3 
 
 		 203 aa  48.9  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0147214  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0559  S54 family peptidase  34.03 
 
 		 240 aa  48.9  0.00009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000568046  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2016  rhomboid-like protein  26.8 
 
 		 504 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  29.37 
 
 		 290 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2325  rhomboid family protein  34.44 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.555664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  28.67 
 
 		 197 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1730  rhomboid family protein  27.4 
 
 		 222 aa  48.5  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0105821  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  28.87 
 
 		 190 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  33.73 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0326  Rhomboid family protein  27.48 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  33.11 
 
 		 554 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0283  rhomboid family protein  36.14 
 
 		 190 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  28.78 
 
 		 342 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  28.67 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0568  rhomboid family protein  33.71 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_6645  predicted protein  37.21 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0872317 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1200  rhomboid family protein  31.52 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.302256  normal  0.536903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  37.04 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  27.92 
 
 		 359 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.273052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1771  rhomboid-like protein  28.57 
 
 		 223 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.604427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3930  intramembrane serine protease GlpG  30.77 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0605  hypothetical protein  30.19 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00675072  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2713  Rhomboid family protein  29.93 
 
 		 227 aa  47.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  25.14 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1588  Rhomboid family protein  27.46 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  29.47 
 
 		 246 aa  47.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0937  rhomboid family protein  29.92 
 
 		 202 aa  47.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  33.61 
 
 		 226 aa  47.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0365  hypothetical protein  29.7 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1696  rhomboid-like protein  26.96 
 
 		 256 aa  47  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0169703  normal  0.97401 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>